Obsidian Vault MCP

Obsidian Vault MCP

面向科研文献工作流的本地 MCP 服务：以 Zotero 管理来源，以 MinerU 提取全文，以 Obsidian 沉淀文献、Wiki 与结构化 Analysis，并通过 Skills 让 AI Agent 按可追溯流程工作。

English · 完整安装教程 · 开发文档 · 更新日志 · 贡献者

架构

用户自然语言任务

↓ 7 个科研 Skills：识别意图、规划步骤、约束证据与输出 ↓ 31 个 MCP Tools：版本契约、查询、导入、解析、检索、校验与事务写入 ↓ Zotero Desktop ── PDF ── MinerU ── Obsidian Vault ├─ Literature 主笔记 ├─ PDF 与全文 Markdown ├─ Index / Literature.base ├─ Wiki └─ 五类 Analysis / Analysis.base

项目不绑定大模型供应商。MCP Tools 负责确定性的本地数据操作，Skills 负责把工具编排成可复用的科研工作流。

核心功能

• 稳定文献身份：以 Zotero 父条目 zoteroKey 作为主键。
• Zotero 导入与同步：支持单篇、Collection、notes、annotations、BibTeX、存储附件和链接附件。
• MinerU 全文解析：将 PDF 规范化为 Markdown，每篇文献使用独立图片目录和相对链接。
• Obsidian 文献库：自动维护 Literature/index.md、Literature/Literature.base、主笔记、PDF、全文和 Wiki。
• 结构化研究层：支持 full_read、literature_review、passage_qa、figure_qa、concept 五类 Analysis。
• 统一数据库视图：Literature/Analysis/Analysis.base 提供 9 个视图。
• 科研 Skills：内置 paper-qa、full-read、passage-qa、figure-qa、compare-papers、literature-review、concept-learning。
• 安全写入：支持 dry-run、staging、锁、备份、原子替换、事务预览和回滚。
• 版本可验证：literature_version 返回当前版本、31 个工具、7 个 Skills 和五类 Analysis。
• 多客户端接入：支持 Codex、Claude Code、OpenCode、Pi、Hermes 和 WorkBuddy。

效果展示

文献目录

Literature Index

多篇文献形成的可追溯 Wiki

展开效果图

安装

3.0.2 已正式发布，要求 Python 3.10+。以下公开安装命令现已可用。

uv（推荐）

uv tool install "zotero-obsidian-mcp==3.0.2"

obsidian-vault-mcp --help

无需持久安装：

uvx --from "zotero-obsidian-mcp==3.0.2" obsidian-vault-mcp doctor --vault-path "<VAULT_PATH>"

pipx / pip

pipx install "zotero-obsidian-mcp==3.0.2"

或

python -m pip install "zotero-obsidian-mcp==3.0.2"

MCP Registry

io.github.luffysolution-svg/obsidian-vault-mcp

等价的 stdio 配置：

{

"mcpServers": { "obsidian-literature": { "command": "uvx", "args": [ "--from", "zotero-obsidian-mcp==3.0.2", "obsidian-vault-mcp", "serve", "--transport", "stdio" ], "env": { "OBSIDIAN_VAULT_PATH": " " } } } }

首次配置

目标目录必须是已由 Obsidian 打开过的 Vault，并包含 .obsidian/。

obsidian-vault-mcp config init --vault-path "<VAULT_PATH>" --dry-run

obsidian-vault-mcp config init --vault-path " " obsidian-vault-mcp config validate --vault-path " " obsidian-vault-mcp doctor --vault-path " " obsidian-vault-mcp call literature_version --json '{}'

启动 Zotero Desktop 并启用本地 API：

obsidian-vault-mcp call zotero_search_items --json '{"query":"photocatalysis"}'

obsidian-vault-mcp import item ABCD1234 --vault-path " " --dry-run obsidian-vault-mcp import item ABCD1234 --vault-path " "

链接附件配置：

{

"zotero": { "linkedAttachmentBaseDir": " " } }

MinerU 解析：

obsidian-vault-mcp mineru parse ABCD1234 --vault-path "<VAULT_PATH>" --dry-run

obsidian-vault-mcp mineru parse ABCD1234 --vault-path " "

规范产物：

Literature/attachment/MinerU/ABCD1234.md

Literature/attachment/MinerU/image/ABCD1234/ABCD1234-fig01.png

Agent 与插件安装

obsidian-vault-mcp agent install codex --dry-run

obsidian-vault-mcp agent install codex

客户端名称可替换为 claude、opencode、pi、hermes 或 workbuddy。

GitHub Release 中的离线插件包：

obsidian-vault-mcp-3.0.2-plugins.zip

Skills

正式工具面

发布一致性

3.0.2 必须同时出现在 Python 包、运行时 __version__、MCP Registry server.json、Codex/Claude 插件清单、Pi 包、Git Tag v3.0.2、GitHub Release 和 PyPI 中。Release workflow 会校验版本、Tag 和产物身份，构建 wheel、sdist、插件 ZIP，执行测试与 handshake，并生成 SHA256SUMS。

安全边界

• 所有写操作先 dry-run，再提交并保存 transactionId。
• 不要提交 Vault 绝对路径、Zotero 数据目录、MinerU token 或其他凭据。
• MinerU 可能把 PDF 发送到外部服务，使用前确认授权和组织政策。
• 推荐本地 stdio；SSE/HTTP 必须放在可信认证边界之后。
• 事务备份不替代独立的 Vault 备份。

贡献者

感谢 方珸 / Lym Fang (@LimFang) 提出 Zotero 链接附件兼容方案。完整记录见 CONTRIBUTORS.md。