BioCosm

Name: BioCosm
Author: nhoverte

作者：nhoverte版本 1.0.0i★ –i在云端运行

注册名称io.github.nhoverte/biocosm

安装方法

What it does

Biotech intelligence for AI agents: drugs, targets, diagnostics, PoS estimates, and writeups.

Connects 在云端运行
Account or key No key needed
Category 诊所与健康

安装

选择你使用的 AI 应用，然后复制设置。

通过 2/3 项检查 · 你的提问会经过开发者的服务器（biocosm-mcp.fly.dev） · ✓ 命令已检查 2026年11月13日

第一步：你用哪个 AI？

Claude网页 · 应用 · 手机ChatGPT网页Claude Code终端Cursor代码编辑器VS Code代码编辑器其他其他应用

选择你用的应用，步骤会显示在下方。

可连接 Claude · 约 2 分钟

不需要密钥，不用安装程序 · 在 claude.ai 或桌面应用设置一次，即可在聊天中使用 · 免费账户可添加 1 个 · Team/Enterprise 方案由所有者（Owner）添加

打开 Claude 的 Connectors 页面
CustomizeConnectors
已完成
点击“Add” → “Custom” → “Web”，填写这 2 项
把这里的内容复制到 Claude 中同名的输入框，然后点击 Continue
Name · 名称BioCosm
Remote MCP server URL · 地址https://biocosm-mcp.fly.dev/mcp
在 Claude 检测到的登录设置页点击 Continue · Authentication 按作者说明选择（Sign in now、Sign in when needed 或 No sign in），然后点击 Add
已完成
在聊天中开启
+ConnectorsBioCosm
已完成
试一试
用 BioCosm 告诉我你能帮我做什么，然后做一件给我看
✓ 如果 Claude 说正在使用 BioCosm，或回答中出现 BioCosm 的工具名称，就表示连接成功

菜单名称已于 2026年11月11日对照 Anthropic 帮助页面核实 · 你的界面可能因版本略有不同

能否连接 ChatGPT 取决于方案

完整 MCP：网页版 ChatGPT Business、Enterprise 或 Edu · Pro：以读取/获取权限连接，修改数据的工具可能用不了 · Plus：官方文档尚未确认，如果在插件页看到添加自定义 MCP 的选项可以试试 · 仅限网页

在网页版 ChatGPT 打开添加 MCP 的页面
Plugins+Add custom MCP server
已完成
填写名称和地址
输入名称，在 Connection 下粘贴地址，勾选风险提示，然后点击 Create as a plugin
Name · 名称BioCosm
Connection · 地址https://biocosm-mcp.fly.dev/mcp
已完成
在聊天中选择 BioCosm
开启新聊天，输入前先从插件列表中选择 BioCosm
已完成
试一试
用 BioCosm 告诉我你能帮我做什么，然后做一件给我看
✓ 如果 ChatGPT 说正在使用 BioCosm，或回答中出现 BioCosm 的工具名称，就表示连接成功

菜单名称已于 2026年11月11日对照 OpenAI 帮助页面核实 · 你的界面可能因版本略有不同

可连接 Claude Code · 约 2 分钟

不需要密钥，不用安装程序

打开终端
Mac：按 Command+空格，输入 Terminal · Windows：打开 PowerShell
已完成

粘贴这条命令并按 Enter

claude mcp add --transport http --scope user biocosm https://biocosm-mcp.fly.dev/mcp

已完成

在 Claude Code 中输入 /mcp
应能看到 BioCosm 在列表中并显示已连接
已完成
试一试
用 BioCosm 告诉我你能帮我做什么，然后做一件给我看
✓ 如果 Claude Code 说正在使用 BioCosm，或回答中出现 BioCosm 的工具名称，就表示连接成功

菜单名称已于 2026年11月11日对照 Anthropic 帮助页面核实 · 你的界面可能因版本略有不同

可连接 Cursor · 约 2 分钟

不需要密钥，不用安装程序

点击这个按钮打开 Cursor
在 Cursor 中打开
Cursor 会请你确认安装，点击 Install
已完成
在 Cursor 中以 Agent 模式打开 AI 聊天
已完成
试一试
用 BioCosm 告诉我你能帮我做什么，然后做一件给我看
✓ 如果 Cursor 说正在使用 BioCosm，或回答中出现 BioCosm 的工具名称，就表示连接成功

菜单名称已于 2026年11月11日对照 Cursor 帮助页面核实 · 你的界面可能因版本略有不同

可连接 VS Code · 约 2 分钟

不需要密钥，不用安装程序

点击这个按钮打开 VS Code
在 VS Code 中打开
VS Code 会请你确认安装，点击 Install
已完成
在 VS Code 中以 Agent 模式打开 AI 聊天
已完成
试一试
用 BioCosm 告诉我你能帮我做什么，然后做一件给我看
✓ 如果 VS Code 说正在使用 BioCosm，或回答中出现 BioCosm 的工具名称，就表示连接成功

菜单名称已于 2026年11月11日对照 VS Code 帮助页面核实 · 你的界面可能因版本略有不同

其他支持 MCP 的应用（如 Windsurf、Zed、Gemini CLI）添加方式各不相同，请在应用列表中查看

查看所有支持 MCP 的应用 →

通过网页连接的应用使用的地址

地址https://biocosm-mcp.fly.dev/mcp

JSON 设置在下方“开发者专用”中

卡住了？问问正在用 BioCosm 的人💬 讨论 →

开发者专用：终端命令和 JSON 设置

通过网页连接

Claude Code

claude mcp add --transport http --scope user biocosm https://biocosm-mcp.fly.dev/mcp

Cursor (~/.cursor/mcp.json)

{
  "mcpServers": {
    "biocosm": {
      "url": "https://biocosm-mcp.fly.dev/mcp"
    }
  }
}

VS Code (mcp.json)

{
  "servers": {
    "biocosm": {
      "type": "http",
      "url": "https://biocosm-mcp.fly.dev/mcp"
    }
  }
}

这些设置是根据作者在注册中心的条目生成的。如果 README 的写法不同，请以 README 为准。

一览

GitHub 星标 i: –
每周下载量i: 不在 npm/PyPI 上
许可证 i: 未注明许可证
连接方式: 在云端运行
传输方式: streamable-http
最新版本i: 1.0.0
分类i: 诊所与健康
发布到注册中心i: 2026年6月18日
代码最后更新i: –
作者: nhoverte
仓库: –
网站: biocosm.io
注册状态: 活跃

哪些应用可以使用它

依据这个服务器的连接方式和各应用自己的文档，检查于 2026年11月10日。

通过互联网连接，适用于

Claude ChatGPT Goose LM Studio Msty Studio Cherry Studio Cursor VS Code + GitHub Copilot Visual Studio Windsurf (Devin Desktop)Zed Kiro Cline Continue JetBrains AI Assistant Claude Code Codex CLI Gemini CLI OpenCode nodecode Warp LibreChat Open WebUI Raycast

全部应用及其优缺点 →

它能做什么

工具名称和描述与服务器在 2026年11月11日报告的完全一致。这些内容由作者撰写，不是我们写的；我们以纯文本形式显示。

search_nodes
Search BioCosm nodes by name, gene symbol, target, therapeutic area, or company. Results are ranked: exact name/brand matches first, then partial name matches, with a node-type prior (canonical drug/diagnostic nodes rank above gene-target nodes, which rank above ChEMBL salt-form
get_node
Get full details for a single BioCosm node: identity and all name aliases, classification, gene targets and mechanism, therapeutic areas, companies, revenue history where available (sparse: ~100 drugs, mostly blockbusters, as annualized quarterly estimates; source links when pres
get_writeup
Get the full writeup for a BioCosm node, including all sections, citations, structured data, and validation score.
list_by_therapeutic_area
List all nodes in a given therapeutic area.
get_company_portfolio
Get a company's full drug/diagnostic portfolio from BioCosm.
get_stats
Get a high-level overview of the BioCosm database: total nodes, writeups, companies, breakdowns by type/status/domain, validation scores, and recent pipeline runs.
get_staleness_report
Get writeup staleness report: overall stats, top stale nodes, data source freshness.
get_node_freshness
Get freshness details for a single node: writeup age, enrichment hash match, staleness score, validation score.
find_by_target
Find all drugs that target a specific gene/protein.
find_by_phase
List drugs/diagnostics at a specific clinical phase.
find_related
Find nodes connected to a given node. Three relationship types are derived on-the-fly: - "drug_target": for a drug, the targets it hits (and vice versa for a target node, the drugs that hit it) - "same_company": drugs sharing a company with this node - "same_target_class": drugs
get_pos_score
Get the Probability of Success estimate for a node, including the base rate, adjustment factors with reasoning, confidence interval, and model version. Returns None for nodes without a PoS score (typically only late-stage pipeline drugs are scored).
get_coverage
Report BioCosm's actual data coverage so you never mistake missing data for a real-world zero. An empty or absent field on a node means "not in BioCosm's data," never a true zero. BioCosm is AI-generated and may contain errors.