Mirobody
von thetahealth
Lab results to LOINC codes and UCUM units, symptoms and diagnoses to ICPC-3. Offline, no API key.
Läuft auf deinem Computer★ 1.408Apache-2.0Aktualisiert vor 5 Tagen
Installieren
Genefoundry
Überblick
Beschreibung vom Entwickler (englisches Original)
MCP gateway federating 22 biomedical MCP servers behind one endpoint: gnomAD, ClinVar, HPO, VEP.
Die drei Säulen von PopNx MCP
Diese drei werden nie zu einer Punktzahl zusammengefasst: Meinungen, Messungen und Beliebtheit sind verschiedene Dinge.
- Stimmen der NutzeriNoch keine BewertungenBewertungen starten in einem späteren Schritt zusammen mit Benutzerkonten
- Unsere Basischecksi3 von 3 bestandenAnhand öffentlicher Informationen geprüft; Code noch nicht gescannt
- NutzungiNoch nicht gemessen★ –
Was du damit machen kannst
Für diesen Server haben wir noch keine Zusammenfassung in einfacher Sprache geschrieben. Unten stehen die Fakten, die wir aus der Registry gelesen haben.
- Verbindung: Läuft in der Cloud
- Transport: Streamable HTTP
- Kategorie: Praxen & Gesundheit
Installation
Wähle die KI-App, die du nutzt, und kopiere die Einstellungen.
Bevor du installierst
- Basischecks: 3 von 3 bestanden
- Läuft auf dem Server des Entwicklers: Was du fragst, läuft über dessen Server.
- Die Registry nennt keinen Schlüssel zum Eintragen.
Du brauchst
- Läuft in der CloudNichts zu installieren; die Verbindung läuft übers Internet
Welche App nutzt du?
Wähle oben deine App. Wir merken sie uns, damit der Button beim nächsten Mal „In … installieren“ anzeigt.
Funktioniert in Claude im Web, auf dem Desktop und auf dem Handy:
- Öffne Settings → Connectors
- Tippe auf Add custom connector
- Füge die Adresse unten ein und tippe auf Add
- Wenn eine Anmeldung verlangt wird, melde dich beim Dienst des Entwicklers an
https://genefoundry.org/mcpFühre das in deinem Terminal aus
claude mcp add --transport http genefoundry https://genefoundry.org/mcpOder kopier die Einstellungen selbst
In .cursor/mcp.json in deinem Projekt oder in ~/.cursor/mcp.json einfügen
{
"mcpServers": {
"genefoundry": {
"url": "https://genefoundry.org/mcp"
}
}
}Dein Browser fragt, ob er die App öffnen darf, dann zeigt die App die Einstellungen und bittet dich um Bestätigung. Schlüsselwerte bleiben leer, damit du sie selbst einträgst.
Oder kopier die Einstellungen selbst
In .vscode/mcp.json in deinem Projekt einfügen
{
"servers": {
"genefoundry": {
"type": "http",
"url": "https://genefoundry.org/mcp"
}
}
}Dein Browser fragt, ob er die App öffnen darf, dann zeigt die App die Einstellungen und bittet dich um Bestätigung. Schlüsselwerte bleiben leer, damit du sie selbst einträgst.
ChatGPT verbindet sich nur mit Servern im Internet:
- Öffne ChatGPT im Web → Settings → Connectors (Apps)
- Tippe auf Create oder Add (bei manchen Tarifen musst du zuerst Developer mode unter Advanced einschalten)
- Füge die Adresse unten ein, gib ihr einen Namen und speichere
- Wenn eine Anmeldung verlangt wird, melde dich beim Dienst des Entwicklers an
https://genefoundry.org/mcpMenünamen können sich je nach Tarif und mit der Zeit leicht unterscheiden.
Deine Auswahl bleibt in einem Cookie auf diesem Gerät; kein Konto nötig.
Diese Einstellungen werden aus dem Registry-Eintrag des Entwicklers erzeugt. Wenn in der README etwas anderes steht, folge der README.
Was er kann
Der Server verlangt eine Anmeldung, bevor er seine Tools auflistet.
Basischecksi
Wir prüfen Informationen, die jeder sehen kann; den Code haben wir nicht gelesen. Checks, die nicht zutreffen, werden nicht mitgezählt. · Geprüft am 7. Nov. 2026
- ✓ Bestanden
Entwickler passt zum Repo
Der Registry-Name wurde mit dem GitHub-Konto berntpopp bestätigt, dem das Repo gehört
- … Noch nicht geprüft
Wird noch gepflegt
Dieses Repo haben wir noch nicht von GitHub gelesen
- … Noch nicht geprüft
Hat eine Lizenz
Dieses Repo haben wir noch nicht von GitHub gelesen
- ✓ Bestanden
Endpunkt antwortet
Antwort in 830 ms (HTTP 401)
- ✓ Bestanden
Anmeldung mit OAuth
Gibt OAuth-Anmeldung an, damit deine KI-App dich zum Einloggen weiterleiten kann
- … Noch nicht geprüft
Keine versteckten Anweisungen in Tool-Beschreibungen
Noch nicht geprüft; wir lesen die Tool-Liste, wenn wir den Endpunkt prüfen
Im Vergleich mit anderen in Praxen & Gesundheiti
- Mehr Sterne als 0 % der anderen 866 Server in dieser Kategorie
- Neuer in der Registry veröffentlicht als 72 % der anderen 866 Server in dieser Kategorie
- Basischecks gleich gut wie oder besser als bei 100 % der anderen 866 Server in dieser Kategorie
Verglichen mit allen aktiven Servern dieser Kategorie in der Registry. Sterne zählen nur, wenn dem Herausgeber das Repo gehört.
Häufige Fragen
Ist Genefoundry sicher?
Er hat 3 von 3 zutreffenden Basischecks bestanden. Den Code haben wir nicht gelesen. Bevor du einen Schlüssel oder Token hinzufügst, sieh nach, welche Zugriffe der Server verlangt, und nutze einen Schlüssel, der nur die Berechtigungen hat, die du brauchst.
Welche Schlüssel oder Codes braucht er?
Die Registry nennt keinen erforderlichen Schlüssel, manche Server bitten dich aber bei der ersten Nutzung, dich anzumelden.
Läuft er auf meinem Computer oder in der Cloud?
Er läuft in der Cloud des Entwicklers. Du verbindest dich übers Internet, ohne etwas zu installieren, aber was du sendest, läuft über die Server des Entwicklers.
Wird er noch gepflegt?
Das GitHub-Repo wurde zuletzt – geändert, und die neueste Version (0.10.10) kam vor 9 Tagen in die Registry.
Welche Apps können ihn nutzen?
Apps, die MCP unterstützen, etwa Claude Desktop, Claude Code, Cursor und VS Code. Er verbindet sich per URL, also funktionieren auch Apps, die Remote-MCP-Server akzeptieren, zum Beispiel ChatGPT im Entwicklermodus.
Was kann ich stattdessen nutzen?
In derselben Kategorie: Mirobody, FHIR MCP Server, Google Health MCP
Alternativen
Server derselben Kategorie von anderen Entwicklern, sortiert nach Sternen.
So liest du eine Karte:★ GitHub-SterneiDrei Säulen: Bewertungen · Checks · NutzungiAktualisiert = neueste Version in der Registry veröffentlichti
FHIR MCP Server
von wso2
MCP server providing seamless access to FHIR APIs for AI tools and healthcare applications
Läuft auf deinem Computer★ 137Apache-2.0Aktualisiert vor 9 Tagen
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Google Health MCP
von davidmosiah
Privacy-first unofficial Google Health API v4 MCP server for health, sleep, activity, HR agents
Läuft auf deinem Computer★ 79MITAktualisiert vor 4 Monaten
Installieren
README vom Entwickler
README öffnen
Unverändert aus dem Repo des Entwicklers übernommen. PopNx MCP hat den Inhalt weder geprüft noch empfiehlt es ihn. HTML, Bilder und Skripte wurden entfernt. Links führen von dieser Website weg.
genefoundry-router
A thin FastMCP 3.x aggregator that federates the GeneFoundry *-link MCP fleet behind a single Streamable-HTTP endpoint. A host adds one server — genefoundry — and gets every biomedical backend with collision-free _ naming and search-based discovery.
[!IMPORTANT]
Research use only. Not clinical decision support. Do not use for diagnosis,
treatment, triage, or patient management.
Why
An MCP host that mounted all 21 backends directly would face a wall of several hundred tools — more than a model can reason over, and a guarantee of name collisions. The router collapses that into one endpoint and replaces the flat catalog with a search surface, so a model finds the right tool by intent instead of by scrolling.
It is a *client* to each backend and a *server* to hosts: it namespaces and shapes the surface, but never rewrites a backend's data. The caller's token is never forwarded upstream.
Quick start
The fleet is hosted — no install required:
claude mcp add --transport http genefoundry https://genefoundry.org/mcpHealth check: genefoundry.org/health.
To run your own against the live fleet (Python 3.14+, uv):
uv sync --group devcp .env.example .env # set GF_*_URL backend URLs and GF_AUTH_MODE uv run genefoundry-router run --host 127.0.0.1 --port 8000 curl -s localhost:8000/health | python -m json.tool
An offline fake fleet (make dev-fleet + make run-dev, or one-shot make test-e2e) runs the real router against impersonated backends over real Streamable-HTTP — no Docker, no network.
Tools
The router does not surface the federated catalog flat. A model sees three things:
| Tool | Purpose |
|---|---|
search_tools | Relevance search over the entire federated catalog |
call_tool | Invoke a hit by its _ name |
| *pinned entry points* | Each backend's front-door tool, always visible — declared per-backend as entrypoints: in servers.yaml |
search_tools(query="splicing prediction") # → spliceai_predict_splicing (+ schema)call_tool(name="spliceai_predict_splicing", arguments={...})
Pinning makes each domain's canonical tool reachable deterministically rather than by relevance luck. See How discovery works — including the two traps that bite MCP clients.
Federated backends
22 backends, 285 tools, each surfaced namespaced — e.g. gnomad_search_genes.
| Namespace | Domain | Data source | Tools | Repo |
|---|---|---|---|---|
pubtator | Literature & entity annotation | PubTator3 | 35 | pubtator-link |
gnomad | Variant / gene / population frequency | gnomAD | 22 | gnomad-link |
orphanet | Rare disease ontology & associations | Orphadata | 19 | orphanet-link |
clingen | Gene–disease curation | ClinGen | 17 | clingen-link |
hpo | Phenotype ontology & associations | Human Phenotype Ontology | 17 | hpo-link |
mavedb | Variant-effect assay scores | MaveDB | 15 | mavedb-link |
uniprot | Protein function | UniProt | 15 | uniprot-link |
clinpgx | Pharmacogenomics / gene-drug guidelines | ClinPGx | 13 | clinpgx-link |
genereviews | Gene–disease literature | GeneReviews | 13 | genereviews-link |
mgi | Mouse phenotype & models | MGI | 13 | mgi-link |
mondo | Disease ontology / cross-references | Mondo | 13 | mondo-link |
gencc | Gene–disease curation | GenCC | 12 | gencc-link |
metadome | Protein tolerance landscapes | MetaDome | 11 | metadome-link |
stringdb | Protein–protein interaction networks | STRING | 10 | stringdb-link |
gtex | Tissue expression | GTEx Portal | 9 | gtex-link |
hgnc | Gene nomenclature | HGNC | 9 | hgnc-link |
panelapp | Diagnostic gene panels & curation | PanelApp | 9 | panelapp-link |
autopvs1 | Variant ACMG PVS1 | AutoPVS1 | 7 | autopvs1-link |
spliceai | Splicing prediction | SpliceAI Lookup | 7 | spliceailookup-link |
vep | Variant annotation / consequence | Ensembl VEP | 7 | vep-link |
clinvar | Variant clinical significance | ClinVar | 6 | clinvar-link |
litvar | Variant literature | LitVar2 | 6 | litvar-link |
Data & provenance
The router serves no data of its own; each backend owns its sources, licences and citation guidance, and the router mirrors their disclaimers.
What it does own is integrity of the tool surface. A backend can serve a clean tool at review time and later change its definition — the channel for a rug pull. The router fingerprints every normalized tool definition and diffs the live fleet against a reviewed, packaged baseline (genefoundry_router/data/fleet-baseline.json), enforced at startup and on a schedule. See Deployment → drift detection.
Documentation
- Configuration & authentication — every
GF_*variable, the OAuth/JWT resource-server modes, and the startup guards. - Deployment — container release, digest pinning, rollback, and drift detection.
- How discovery works — the search surface, entry-point pinning, and how discoverability is measured.
- Design spec — the architecture and why it is shaped this way.
- Fleet standards — Tool-Naming · Response-Envelope · MCP-Behaviour · Tool-Surface-Budget · Tool-Schema-Documentation · Container-Hardening · Versioning · README.
Contributing
See AGENTS.md for engineering conventions. make ci-local is the definition-of-done gate: format, lint, line budget, README standard, mypy, and tests.
License
MIT © Bernt Popp. Each federated backend carries the licence and citation terms of its upstream data source; see that backend's repository.