GeneBe

Name: GeneBe
Author: genebe-net

von genebe-netVersion 0.1.0i★ –iLäuft in der Cloud

Name in der Registrynet.genebe/genebe-mcp

Installieren

Überblick

Beschreibung vom Entwickler (englisches Original)

Annotate and classify human genetic variants with GeneBe (ACMG, gnomAD, ClinVar). Research use only.

Die drei Säulen von PopNx MCP

Diese drei werden nie zu einer Punktzahl zusammengefasst: Meinungen, Messungen und Beliebtheit sind verschiedene Dinge.

Stimmen der NutzeriNoch keine BewertungenBewertungen starten in einem späteren Schritt zusammen mit Benutzerkonten
Unsere Basischecksi1 von 1 bestandenAnhand öffentlicher Informationen geprüft; Code noch nicht gescannt
NutzungiNoch nicht gemessen★ –

Was du damit machen kannst

Für diesen Server haben wir noch keine Zusammenfassung in einfacher Sprache geschrieben. Unten stehen die Fakten, die wir aus der Registry gelesen haben.

Verbindung: Läuft in der Cloud
Transport: Streamable HTTP
Kategorie: Suche & KI-Gedächtnis

Installation

Wähle die KI-App, die du nutzt, und kopiere die Einstellungen.

Bevor du installierst

Basischecks: 1 von 1 bestanden
Läuft auf dem Server des Entwicklers: Was du fragst, läuft über dessen Server.
Die Registry nennt keinen Schlüssel zum Eintragen.

Du brauchst

Läuft in der CloudNichts zu installieren; die Verbindung läuft übers Internet

Welche App nutzt du?

ClaudeClaude CodeCursorVS CodeChatGPT

Wähle oben deine App. Wir merken sie uns, damit der Button beim nächsten Mal „In … installieren“ anzeigt.

Funktioniert in Claude im Web, auf dem Desktop und auf dem Handy:

Öffne Settings → Connectors
Tippe auf Add custom connector
Füge die Adresse unten ein und tippe auf Add
Wenn eine Anmeldung verlangt wird, melde dich beim Dienst des Entwicklers an

https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Führe das in deinem Terminal aus

claude mcp add --transport http genebe https://mcp.genebe.net/v1/mcp

In Cursor öffnen

Oder kopier die Einstellungen selbst

In .cursor/mcp.json in deinem Projekt oder in ~/.cursor/mcp.json einfügen

{
  "mcpServers": {
    "genebe": {
      "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp"
    }
  }
}

Dein Browser fragt, ob er die App öffnen darf, dann zeigt die App die Einstellungen und bittet dich um Bestätigung. Schlüsselwerte bleiben leer, damit du sie selbst einträgst.

In VS Code öffnen

Oder kopier die Einstellungen selbst

In .vscode/mcp.json in deinem Projekt einfügen

{
  "servers": {
    "genebe": {
      "type": "http",
      "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp"
    }
  }
}

Dein Browser fragt, ob er die App öffnen darf, dann zeigt die App die Einstellungen und bittet dich um Bestätigung. Schlüsselwerte bleiben leer, damit du sie selbst einträgst.

ChatGPT verbindet sich nur mit Servern im Internet:

Öffne ChatGPT im Web → Settings → Connectors (Apps)
Tippe auf Create oder Add (bei manchen Tarifen musst du zuerst Developer mode unter Advanced einschalten)
Füge die Adresse unten ein, gib ihr einen Namen und speichere
Wenn eine Anmeldung verlangt wird, melde dich beim Dienst des Entwicklers an

https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Menünamen können sich je nach Tarif und mit der Zeit leicht unterscheiden.

Deine Auswahl bleibt in einem Cookie auf diesem Gerät; kein Konto nötig.

Diese Einstellungen werden aus dem Registry-Eintrag des Entwicklers erzeugt. Wenn in der README etwas anderes steht, folge der README.

Was er kann

Die Tool-Liste dieses Servers haben wir noch nicht gelesen; wir prüfen die Endpunkte reihum.

Basischecksi

Wir prüfen Informationen, die jeder sehen kann; den Code haben wir nicht gelesen. Checks, die nicht zutreffen, werden nicht mitgezählt. · Geprüft am 6. Nov. 2026

✓ Bestanden
Entwickler passt zum Repo
Der Registry-Name wurde über die Domain genebe.net bestätigt (die Registry prüft, wem die Domain gehört)
… Noch nicht geprüft
Wird noch gepflegt
Dieses Repo haben wir noch nicht von GitHub gelesen
… Noch nicht geprüft
Hat eine Lizenz
Dieses Repo haben wir noch nicht von GitHub gelesen
… Noch nicht geprüft
Endpunkt antwortet
Noch nicht geprüft; wir prüfen die Endpunkte reihum
… Noch nicht geprüft
Anmeldung mit OAuth
Noch nicht geprüft; wir prüfen die Endpunkte reihum
… Noch nicht geprüft
Keine versteckten Anweisungen in Tool-Beschreibungen
Noch nicht geprüft; wir lesen die Tool-Liste, wenn wir den Endpunkt prüfen

Im Vergleich mit anderen in Suche & KI-Gedächtnisi

Mehr Sterne als 0 % der anderen 7245 Server in dieser Kategorie
Neuer in der Registry veröffentlicht als 72 % der anderen 7245 Server in dieser Kategorie
Basischecks gleich gut wie oder besser als bei 100 % der anderen 7245 Server in dieser Kategorie

Verglichen mit allen aktiven Servern dieser Kategorie in der Registry. Sterne zählen nur, wenn dem Herausgeber das Repo gehört.

Häufige Fragen

Ist GeneBe sicher?

Er hat 1 von 1 zutreffenden Basischecks bestanden. Den Code haben wir nicht gelesen. Bevor du einen Schlüssel oder Token hinzufügst, sieh nach, welche Zugriffe der Server verlangt, und nutze einen Schlüssel, der nur die Berechtigungen hat, die du brauchst.

Welche Schlüssel oder Codes braucht er?

Die Registry nennt keinen erforderlichen Schlüssel, manche Server bitten dich aber bei der ersten Nutzung, dich anzumelden.

Läuft er auf meinem Computer oder in der Cloud?

Er läuft in der Cloud des Entwicklers. Du verbindest dich übers Internet, ohne etwas zu installieren, aber was du sendest, läuft über die Server des Entwicklers.

Wird er noch gepflegt?

Das GitHub-Repo wurde zuletzt – geändert, und die neueste Version (0.1.0) kam vor 15 Tagen in die Registry.

Welche Apps können ihn nutzen?

Apps, die MCP unterstützen, etwa Claude Desktop, Claude Code, Cursor und VS Code. Er verbindet sich per URL, also funktionieren auch Apps, die Remote-MCP-Server akzeptieren, zum Beispiel ChatGPT im Entwicklermodus.

Was kann ich stattdessen nutzen?

In derselben Kategorie: Context7, Codebase Memory, Exa

Alternativen

Server derselben Kategorie von anderen Entwicklern, sortiert nach Sternen.

So liest du eine Karte:★ GitHub-SterneiDrei Säulen: Bewertungen · Checks · NutzungiAktualisiert = neueste Version in der Registry veröffentlichti

Context7

von upstash

Up-to-date docs for AI agents

Computer oder Cloud★ 64.224MITAktualisiert heute

Installieren

Codebase Memory

von DeusData

Codebase knowledge graph for AI agents — 162 languages, sub-ms queries, 99% fewer tokens.

Läuft auf deinem Computer★ 48.148MITAktualisiert vor 20 Tagen

Installieren

Exa

von exa-labs

Connect AI agents to Exa for web search, content fetching, and multi-step research.

Läuft in der Cloud★ 5.213MITAktualisiert letzten Monat

Installieren

README vom Entwickler

README öffnen

Unverändert aus dem Repo des Entwicklers übernommen. PopNx MCP hat den Inhalt weder geprüft noch empfiehlt es ihn. HTML, Bilder und Skripte wurden entfernt. Links führen von dieser Website weg.

🧬 GeneBe MCP

Give your AI assistant real variant-interpretation data instead of guesses.

Annotate and classify human genetic variants (ACMG, gnomAD, ClinVar, in-silico predictors) from Claude, Cursor, VS Code and any other MCP client, powered by GeneBe.

https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Why

Language models are bad at remembering the clinical status of a specific variant. They sound confident and are often wrong. GeneBe MCP lets the assistant look the variant up and answer from data: a transparent, points-based ACMG classification with every criterion explained, together with population frequencies, predictor scores, ClinVar and transcript consequences.

*"Is NM_005577.4:c.4195A>C benign?"*

*"What is chr6-160585140-T-G? Explain why it is classified that way."*

*"Convert rs41272110 to hg38 and list its consequences on each transcript."*

For example, chr6-160585140-T-G (rs41272110, *LPA*) comes back as Benign, −9 points with criteria BA1 and BP4, plus the data behind them and a link to the GeneBe page.

What you get

Any notation in: genomic coordinates, HGVS, rsID or SPDI; hg19, hg38 and T2T supported through liftover.
Verdict you can audit: ACMG classification with points and the reasoning for each criterion, not a black-box label.
Evidence in one call: gnomAD frequencies, in-silico predictors, ClinVar, per-transcript consequences (HGVS c./p., impact), gene details with MANE Select and ClinGen gene–disease validity.
Compact answers: large lists are capped, so one call costs roughly 1–3k tokens, and every result also carries structured data that follows the tool's output schema.
Links back to GeneBe, so the human can check the source.

Connect in a minute

No sign-up, no API key. The server is remote; you only add its URL.

Claude Code

claude mcp add --transport http genebe https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Claude (web and desktop)

Settings → Connectors → *Add custom connector*, then enter https://mcp.genebe.net/v1/mcp.

ChatGPT

Open chatgpt.com/plugins, click Add (+) → Add custom MCP, and enter https://mcp.genebe.net/v1/mcp.

Cursor

Add to ~/.cursor/mcp.json:

{ "mcpServers": { "genebe": { "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp" } } }

VS Code

Add to .vscode/mcp.json:

{ "servers": { "genebe": { "type": "http", "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp" } } }

Any other client / try it with curl

Any client that supports remote MCP over Streamable HTTP works. Try it from a terminal:

curl -s -X POST https://mcp.genebe.net/v1/mcp \

-H 'Content-Type: application/json' -H 'Accept: application/json, text/event-stream' \ -d '{"jsonrpc":"2.0","id":1,"method":"tools/call","params":{"name":"annotate_variant","arguments":{"variant":"chr6-160585140-T-G"}}}'

More examples: USAGE.md.

Tools

Tool	What it does
`annotate_variant`	Start here. Any notation → ACMG verdict, points and criteria, frequencies, predictor scores, ClinVar, consequences, GeneBe links
`explain_acmg_decision_path`	Why each classification criterion applied, in plain text
`convert_variant`	HGVS / rsID / SPDI → hg38 coordinates
`get_variant_effects`	Per-transcript consequences (HGVS c./p., impact)
`get_gene`	Gene identifiers, location, MANE Select, ClinGen gene–disease validity, transcripts
`liftover_coordinate`	Positions, intervals or variants between hg19 / hg38 / t2t

The default genome build is hg38.

Trust and privacy

Read-only. No tool changes anything, anywhere.
No account, no key needed to use the hosted server.
Single variants only. No patient data, no VCF files, no samples are sent or stored.
Nothing is stored and variant input is not logged by the MCP server.
Transparent classification. Results come from GeneBe's points-based ACMG implementation; the reasoning is returned with the verdict, so you and the assistant can check it.
Open source under the MIT license; you can read exactly what the server does, or run your own copy.
Research use only. This is not a medical device and not a diagnosis. Classifications must be reviewed by a qualified specialist before any clinical use.

Roadmap

Today GeneBe MCP answers questions about single variants. We plan to grow it into a workspace your assistant can use on your own data. None of the items below is available yet, and the order may change.

Sign-in, so the assistant can act on your GeneBe account
Your own samples: view and edit sample details and annotations
Search your cohort: find a variant across your own set of samples
Upload samples from the assistant
Supervise computations: start analyses, follow their progress and read the results

Ideas or requests? Open an issue or write to us via genebe.net.

Data sources

Results combine data from GeneBe, gnomAD, ClinVar, UniProt, ClinGen and dbNSFP predictors. Please check each source's license terms before redistributing the data.

Contributing and self-hosting

Want to run your own instance or change the code? See DEVELOPMENT.md. Issues and pull requests are welcome.

Made by the GeneBe team · MIT · Research use only

GeneBe

Überblick

Die drei Säulen von PopNx MCP

Was du damit machen kannst

Installation

Bevor du installierst

Was er kann

Basischecksi

Entwickler passt zum Repo

Wird noch gepflegt

Hat eine Lizenz

Endpunkt antwortet

Anmeldung mit OAuth

Keine versteckten Anweisungen in Tool-Beschreibungen

Im Vergleich mit anderen in Suche & KI-Gedächtnisi

Häufige Fragen

Alternativen

Context7

Codebase Memory

Exa

README vom Entwickler

🧬 GeneBe MCP

Why

What you get

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Tools

Trust and privacy

Roadmap

Data sources

Contributing and self-hosting