Biostudies MCP
Überblick
Beschreibung vom Entwickler (englisches Original)
EBI BioStudies: search studies across life-science repositories and read their metadata - keyless.
Die drei Säulen von PopNx MCP
Diese drei werden nie zu einer Punktzahl zusammengefasst: Meinungen, Messungen und Beliebtheit sind verschiedene Dinge.
- Stimmen der NutzeriNoch keine BewertungenBewertungen starten in einem späteren Schritt zusammen mit Benutzerkonten
- Unsere Basischecksi1 von 1 bestandenAnhand öffentlicher Informationen geprüft; Code noch nicht gescannt
- NutzungiGanz neu↓ 146/Wo. · ★ –
Was du damit machen kannst
Für diesen Server haben wir noch keine Zusammenfassung in einfacher Sprache geschrieben. Unten stehen die Fakten, die wir aus der Registry gelesen haben.
- Verbindung: Läuft auf deinem Computer
- Transport: stdio
- Kategorie: Suche & KI-Gedächtnis
Installation
Wähle die KI-App, die du nutzt, und kopiere die Einstellungen.
Bevor du installierst
- Basischecks: 1 von 1 bestanden
- Läuft auf deinem Computer mit den Rechten deines Benutzerkontos (Dateien, Netzwerk, Apps).
- Die Registry nennt keinen Schlüssel zum Eintragen.
Du brauchst
- npmNode.js installiert (für den Befehl npx)
Welche App nutzt du?
Wähle oben deine App. Wir merken sie uns, damit der Button beim nächsten Mal „In … installieren“ anzeigt.
Öffne Claude Desktop → Settings → Developer → Edit Config und füge dies in claude_desktop_config.json ein
{
"mcpServers": {
"biostudies": {
"command": "npx",
"args": [
"-y",
"@mrfentmen/biostudies-mcp"
]
}
}
}Führe das in deinem Terminal aus
claude mcp add biostudies -- npx -y @mrfentmen/biostudies-mcpOder kopier die Einstellungen selbst
In .cursor/mcp.json in deinem Projekt oder in ~/.cursor/mcp.json einfügen
{
"mcpServers": {
"biostudies": {
"command": "npx",
"args": [
"-y",
"@mrfentmen/biostudies-mcp"
]
}
}
}Dein Browser fragt, ob er die App öffnen darf, dann zeigt die App die Einstellungen und bittet dich um Bestätigung. Schlüsselwerte bleiben leer, damit du sie selbst einträgst.
Oder kopier die Einstellungen selbst
In .vscode/mcp.json in deinem Projekt einfügen
{
"servers": {
"biostudies": {
"type": "stdio",
"command": "npx",
"args": [
"-y",
"@mrfentmen/biostudies-mcp"
]
}
}
}Dein Browser fragt, ob er die App öffnen darf, dann zeigt die App die Einstellungen und bittet dich um Bestätigung. Schlüsselwerte bleiben leer, damit du sie selbst einträgst.
Dieser Server läuft auf deinem Computer, und ChatGPT kann sich nur mit Servern im Internet verbinden. Wähle eine andere App.
Deine Auswahl bleibt in einem Cookie auf diesem Gerät; kein Konto nötig.
Diese Einstellungen werden aus dem Registry-Eintrag des Entwicklers erzeugt. Wenn in der README etwas anderes steht, folge der README.
Was er kann
Läuft auf deinem Computer; die Tool-Liste erscheint nach der Installation in deiner KI-App.
Basischecksi
Wir prüfen Informationen, die jeder sehen kann; den Code haben wir nicht gelesen. Checks, die nicht zutreffen, werden nicht mitgezählt. · Geprüft am 8. Nov. 2026
- ✓ Bestanden
Entwickler passt zum Repo
Der Registry-Name wurde mit dem GitHub-Konto mrfentmen bestätigt, dem das Repo gehört
- … Noch nicht geprüft
Wird noch gepflegt
Dieses Repo haben wir noch nicht von GitHub gelesen
- … Noch nicht geprüft
Hat eine Lizenz
Dieses Repo haben wir noch nicht von GitHub gelesen
- – Nicht zutreffend
Endpunkt antwortet
Dieser Server läuft auf deinem Computer; es gibt keinen Endpunkt im Internet
- – Nicht zutreffend
Anmeldung mit OAuth
Läuft auf deinem Computer und nutzt stattdessen lokale Einstellungen
- … Noch nicht geprüft
Keine versteckten Anweisungen in Tool-Beschreibungen
Läuft auf deinem Computer; Tool-Listen können wir nur von Endpunkten im Internet lesen
Im Vergleich mit anderen in Suche & KI-Gedächtnisi
- Mehr Sterne als 0 % der anderen 5718 Server in dieser Kategorie
- Neuer in der Registry veröffentlicht als 99 % der anderen 5718 Server in dieser Kategorie
- Basischecks gleich gut wie oder besser als bei 100 % der anderen 5718 Server in dieser Kategorie
Verglichen mit allen aktiven Servern dieser Kategorie in der Registry. Sterne zählen nur, wenn dem Herausgeber das Repo gehört.
Häufige Fragen
Ist Biostudies MCP sicher?
Er hat 1 von 1 zutreffenden Basischecks bestanden. Den Code haben wir nicht gelesen. Bevor du einen Schlüssel oder Token hinzufügst, sieh nach, welche Zugriffe der Server verlangt, und nutze einen Schlüssel, der nur die Berechtigungen hat, die du brauchst.
Welche Schlüssel oder Codes braucht er?
Die Registry nennt keinen erforderlichen Schlüssel, manche Server bitten dich aber bei der ersten Nutzung, dich anzumelden.
Läuft er auf meinem Computer oder in der Cloud?
Er läuft auf deinem Computer. Deine KI-App startet ihn bei Bedarf, und die Daten laufen nicht über die Server des Entwicklers (außer der Server ruft selbst einen Onlinedienst auf).
Wird er noch gepflegt?
Das GitHub-Repo wurde zuletzt – geändert, und die neueste Version (1.0.1) kam heute in die Registry.
Welche Apps können ihn nutzen?
Apps, die MCP unterstützen, etwa Claude Desktop, Claude Code, Cursor und VS Code. Außerdem brauchst du Node.js auf deinem Computer.
Was kann ich stattdessen nutzen?
In derselben Kategorie: Context7, Codebase Memory, Exa
Alternativen
Server derselben Kategorie von anderen Entwicklern, sortiert nach Sternen.
So liest du eine Karte:↓ Downloads pro Wochei★ GitHub-SterneiDrei Säulen: Bewertungen · Checks · NutzungiAktualisiert = neueste Version in der Registry veröffentlichti
Codebase Memory
Codebase knowledge graph for AI agents — 162 languages, sub-ms queries, 99% fewer tokens.
Exa
Connect AI agents to Exa for web search, content fetching, and multi-step research.
README vom Entwickler
README öffnen
Unverändert aus dem Repo des Entwicklers übernommen. PopNx MCP hat den Inhalt weder geprüft noch empfiehlt es ihn. HTML, Bilder und Skripte wurden entfernt. Links führen von dieser Website weg.
awesome-servers
One repo for three families of servers, each subtree keeping its own layout and tooling so it can still be built, run and published on its own.
| Subtree | What it holds | Run one |
|---|---|---|
mcp/ | 338 TypeScript MCP servers, plus 1107 published packages in published/ | cd mcp/servers/ && npm install && npm run build |
acp/ | 79 Python ACP agents | python3 acp/agents/ /agent.py |
a2a/ | 37 Python A2A servers plus the shared a2a_kit | python3 a2a/servers/ /server.py |
watchd/ | a threshold watcher that runs the feeds between editor sessions | python3 watchd/watchd.py --config conditions.json --loop |
site/ | the published site: registry with search, the public-feed atlas, watchd plans | https://mrfentmen.github.io/awesome-servers/ |
Most servers read public data with no key of their own; the ones wrapping a vendor API take that vendor's key. Nothing in this repo asks a caller to pay. On 2026-10-17 the licence machinery was removed for good: the per-tool src/license.ts gates are gone from the MCP servers, and the A2A and ACP trees no longer carry the hosted licence-gateway half — the skills that used it now answer with an explicit not-implemented stub. Nothing here asks a caller to pay, and nothing they run is refused with a buy link.
Nothing here is generated: each subtree's README says what its servers read, and every server has its own unit tests (mcp/servers/ /tests, acp/agents/ /tests, a2a/servers/ /tests) plus a live smoke check (tools/smoke*.py, a2a/tools/smoke_all.py).
Novel and original
Nearly all of this is first-of-its-kind work, not a port of an existing catalogue. Before each server or agent was built, it was checked against the official tool lists (the MCP registries, agentclientprotocol.com's agent list and registry) and a live GitHub search for the same domain, and the research logs record what was found and why it still counted as missing — see mcp/MISSING.md, acp/MISSING.md and a2a/docs/. Highlights:
- The MCP side holds TypeScript servers, one npm package each, and 1039 published packages under
published/; mcp/MISSING.md documents the check that preceded every build: what was searched, what was skipped and why the domain still counted as uncovered. - On the ACP side there were zero domain agents before this repo — every agent on the official list was a coding agent. These 79 Python agents are the first non-coding ACP agents, and several use protocol surfaces no other agent uses in production (
session/request_permissionfor dataset reads,fs/write_text_filefor a briefing file,session/cancelfor a conditional watch, image content blocks, a live SSE push feed), each proved-unused in the wild by search at build time. Two more firsts carry their own proof: theorchestratoris an agent whose feeds are *agents* — it spawns sibling repo agents as real ACP child processes and merges their answers — and thenycpack is the first multi-agency city surface. acp/MISSING.mddoubles as the public-feed atlas: every keyless feed probed live, with its date, what it answered and whether it still works. The published site renders that table at https://mrfentmen.github.io/awesome-servers/atlas.html.- The pattern across all three subtrees is the same thesis: wrap one real, keyless public dataset, answer honestly about what the feed did and did not say, and keep the whole thing small, tested and self-contained.
Publishing
- MCP servers publish from
mcp/servers/(its ownpackage.json, version and README). - ACP and A2A servers are repo-run today (Python, no packaging step).
Built on top of it
Creatures that use this corpus as their world live in the sibling repo mrfentmen/superagents (public, with its own claim-check in MISSING.md):
- polymath — routes your question to the most fitting agents of this repo, spawns each as a real ACP child process, and merges the answers into one brief with per-row citations; a sibling that fails appears as a named row, never silence. Its registry is a data file and its ranking is deterministic word-scoring, not a model opinion.
- sentry — one plain sentence ("watch air quality in Denver over 150") becomes a tracked watch: a permission-asked protocol write produces the conditions file this repo's
watchd/obeys unchanged, plus the activation lines. Checks it can author today: air thresholds, quake magnitudes within a radius, river gauges at flood stage. - fedora hat guy — the persona agent in his own repo
mrfentmen/fedora-hat: says "never miss" and means it — one sentence installs the full crown of watches (air + quakes, gauge-named flood) in one permissioned write, and your other questions are forwarded to the siblings above with every row cited. - instink — the instinct agent in his own repo
mrfentmen/instink: compiles a skill into a reflex — a matcher plus the answer it fires, with hit/miss counters and honest promotion/demotion. The skill doc stays one step away, never deleted. - contextink — the context agent in his own repo
mrfentmen/contextink: you say "do this" and it acquires the context from the repo, git, and recent files so you don't have to explain it; asks only the minimal high-information-gain questions when acquisition fails. - rewind — the replay agent in his own repo
mrfentmen/rewind: replays agent runs and mutates one variable to see what would have happened. Replay + mutate + diff for agent traces. - scopink — the scope agent in his own repo
mrfentmen/scopink: checks if an action is within the scope of what was asked. Detects scope creep in agent plans. - curious — the curiosity agent in his own repo
mrfentmen/curious: proactively seeks information it doesn't have. Scans for knowledge gaps, seeks answers, learns facts. - bored — the idle agent in his own repo
mrfentmen/bored: uses idle time productively. Consolidates memories, explores areas, prepares for tasks.
Point the polymath at a checkout of this repo with AWESOME_SERVERS_HOME=$PWD/awesome-servers and it federates across the two repos live.
Published snapshot (published/)
published/ holds one directory per npm package, byte-for-byte what the registry serves: 1039 packages, every version matching npm latest.
published/INDEX.mdis generated from the tree bypython3 scripts/index-published.py.scripts/sync-published-snapshot.pyre-downloads every package from npm; run it only when every local fix has been published, because it overwritesdist/from the tarballs.- One package carries a licence gate (
MCP_LICENSE_KEY):@mrfentmen/vg-resource-mcp. Another 495 still ship tools that answerNot yet implemented;published/INDEX.mdlists every one of them. - Every package links to this repo (
mrfentmen/awesome-servers) as its source.
servers/ holds the older per-server source that predates the snapshot. Where the two disagree, published/ is what users actually install.