biomedmcp

Was du damit machen kannst

Für diesen Server haben wir noch keine Zusammenfassung in einfacher Sprache geschrieben. Unten stehen die Fakten, die wir aus der Registry gelesen haben.

• Verbindung: Computer oder Cloud
• Transport: stdio, Streamable HTTP
• Kategorie: Praxen & Gesundheit

Installation

Wähle die KI-App, die du nutzt, und kopiere die Einstellungen.

Du brauchst

• Läuft in der CloudNichts zu installieren; die Verbindung läuft übers Internet
• PyPIuv für Python installiert (für den Befehl uvx)

Welche App nutzt du?

https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "your-value"
      }
    }
  }
}

claude mcp add --transport http biomedmcp https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

claude mcp add biomedmcp --env UBI_PROFILE=your-value -- uvx biomedmcp mcp --transport stdio

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "url": "https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp"
    }
  }
}

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "your-value"
      }
    }
  }
}

{
  "servers": {
    "biomedmcp": {
      "type": "http",
      "url": "https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp"
    }
  }
}

{
  "servers": {
    "biomedmcp": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "your-value"
      }
    }
  }
}

https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

Deine Auswahl bleibt in einem Cookie auf diesem Gerät; kein Konto nötig.

Werte, die du selbst einträgst

• UBI_PROFILE env

Diese Einstellungen werden aus dem Registry-Eintrag des Entwicklers erzeugt. Wenn in der README etwas anderes steht, folge der README.

Was er kann

Tool-Namen und -Beschreibungen genau so, wie der Server sie am 7. Nov. 2026 gemeldet hat. Geschrieben hat sie der Entwickler, nicht wir; wir zeigen sie als reinen Text.

• search_records

  Search genes, proteins, drugs, diseases, phenotypes, pathways, variants, pharmacogenomics, GWAS, diagnostics, adverse events, studies, patents or authors by text; returns IDs for get_record (variants: get_variant_evidence). Papers: search_literature. Trials: search_trials. Patent

• get_record

  Fetch one record by ID with optional evidence sections, e.g. gene expression/eqtl/diseases/druggability, drug label/safety, article fulltext, trial eligibility, protein domains/structures. Variants: get_variant_evidence. List an entity's sections with get_capabilities(entity=...)

• search_literature

  Search papers across PubMed, Europe PMC, PubTator and LitSense with date, author, journal, article-type and open-access filters. Deduplicates across sources and reports each source's outcome. Read abstracts or full text with get_record(entity=article). e.g. {"query":"PCSK9 LDL ch

• search_trials

  Search clinical trials (ClinicalTrials.gov, NCI) by condition, intervention, phase and recruitment status. Read arms, eligibility or outcomes with get_record(entity=trial). Does not assess an individual's eligibility. e.g. {"query":"familial hypercholesterolemia","filters":{"stat

• get_variant_evidence

  Get evidence for one variant (rsID, gene + protein change, HGVS or chr:pos:ref:alt). Defaults: ClinVar, gnomAD population, CIViC; add predictions (AlphaMissense), eve, cosmic, oncokb, hotspots, gwas or cbioportal. Ambiguous assembly or transcript is reported, not guessed; predict

• analyze_study

  Analyze an installed public cancer genomics study: gene_profile, mutation_cohort, survival, compare, co_occurrence, filter_cohort, top_mutated. List installed studies with get_capabilities(source=study); ubi_synthetic is invented demo data. Report sample denominators and exclusio

• resolve_entity

  Map a name, alias or ambiguous identifier to exact species-qualified IDs before joining evidence. Returns candidates when ambiguous; a provider match score alone is not identity. Skip when you already hold an exact ID. e.g. {"entity":"gene","query":"LDL receptor","species":9606}

• find_related

  List records linked to one record. gene/drug/disease: articles, trials. variant: articles, structure. article: citations, references, recommendations, authors, entities. author: articles. Record attributes are get_record sections, not relations. e.g. {"entity":"article","id":"PMI

• build_dossier

  Build a multi-section dossier in one call: verified identity, default record sections and top related papers, with citations and per-source outcomes. Workflows: target_dossier, model_input_bundle (gene), drug_review, disease_landscape, pathway_review, variant_dossier, negative_ev

• query_source

  Run a source-specific operation that other tools do not cover, e.g. ChEMBL bioactivities, Ensembl coordinates, PDB structure quality, OmniPath interactions, NCBI Datasets genomes, ncbi-records for GenBank/GEO/SRA. Read get_capabilities(source=...) for operations and params first.

• run_batch

  Run up to ten independent read calls in parallel with one quota reservation; each result keeps its own outcome. build_dossier and utilities are not batchable. e.g. {"calls":[{"operation":"get_record","arguments":{"entity":"gene","id":"PCSK9","species":9606}}]}

• get_capabilities

  List enabled sources, entity sections, dossier workflows and source operations with exact parameter schemas. Narrow with source or entity; diagnose=true probes source health. Examples: biomedmcp://guide. e.g. {}

• get_quota

  Show remaining research allowance and reset times; signed-in accounts get higher limits. e.g. {}

Basischecksi

Wir prüfen Informationen, die jeder sehen kann; den Code haben wir nicht gelesen. Checks, die nicht zutreffen, werden nicht mitgezählt. · Geprüft am 8. Nov. 2026

• ✓ Bestanden

  Entwickler passt zum Repo

  Der Registry-Name wurde mit dem GitHub-Konto unibio-intelligence bestätigt, dem das Repo gehört

• … Noch nicht geprüft

  Wird noch gepflegt

  Dieses Repo haben wir noch nicht von GitHub gelesen

• … Noch nicht geprüft

  Hat eine Lizenz

  Dieses Repo haben wir noch nicht von GitHub gelesen

• ✓ Bestanden

  Endpunkt antwortet

  Antwort in 105 ms (HTTP 200)

• – Nicht zutreffend

  Anmeldung mit OAuth

  Keine Anmeldung nötig

• ✓ Bestanden

  Keine versteckten Anweisungen in Tool-Beschreibungen

  Wir haben 13 Tool-Beschreibungen gelesen und keine versteckten Anweisungen an die KI gefunden

Im Vergleich mit anderen in Praxen & Gesundheiti

• Mehr Sterne als 0 % der anderen 1030 Server in dieser Kategorie
• Neuer in der Registry veröffentlicht als 90 % der anderen 1030 Server in dieser Kategorie
• Basischecks gleich gut wie oder besser als bei 100 % der anderen 1030 Server in dieser Kategorie

Verglichen mit allen aktiven Servern dieser Kategorie in der Registry. Sterne zählen nur, wenn dem Herausgeber das Repo gehört.

Alternativen

Server derselben Kategorie von anderen Entwicklern, sortiert nach Sternen.

So liest du eine Karte:↓ Downloads pro Wochei★ GitHub-SterneiDrei Säulen: Bewertungen · Checks · NutzungiAktualisiert = neueste Version in der Registry veröffentlichti

README vom Entwickler

python -m pip install biomedmcp==0.2.5

UBI_PROFILE=local biomedmcp get_record '{"entity":"gene","id":"LDLR","species":9606,"sections":["expression"]}'

<!-- public-call-examples:end -->

UBI_PROFILE=local biomedmcp-server --transport http --host 127.0.0.1 --port 8000