BioMCP-TS

Was du damit machen kannst

Für diesen Server haben wir noch keine Zusammenfassung in einfacher Sprache geschrieben. Unten stehen die Fakten, die wir aus der Registry gelesen haben.

• Verbindung: Läuft auf deinem Computer
• Transport: stdio
• Kategorie: Praxen & Gesundheit
• Das musst du eintragen: NCBI_API_KEY, S2_API_KEY, OPENFDA_API_KEY, ONCOKB_TOKEN, DISGENET_API_KEY

Installation

Wähle die KI-App, die du nutzt, und kopiere die Einstellungen.

Du brauchst

• npmNode.js installiert (für den Befehl npx)

Welche App nutzt du?

{
  "mcpServers": {
    "biomcp-ts": {
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "biomcp"
      ],
      "env": {
        "ANALYSIS_BIOWASM": "your-value",
        "ANALYSIS_R": "your-value",
        "DB_TYPE": "your-value",
        "NCBI_API_KEY": "your-value",
        "S2_API_KEY": "your-value",
        "OPENFDA_API_KEY": "your-value",
        "ONCOKB_TOKEN": "your-value",
        "DISGENET_API_KEY": "your-value"
      }
    }
  }
}

claude mcp add biomcp-ts --env ANALYSIS_BIOWASM=your-value --env ANALYSIS_R=your-value --env DB_TYPE=your-value --env NCBI_API_KEY=your-value --env S2_API_KEY=your-value --env OPENFDA_API_KEY=your-value --env ONCOKB_TOKEN=your-value --env DISGENET_API_KEY=your-value -- npx -y biomcp

{
  "mcpServers": {
    "biomcp-ts": {
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "biomcp"
      ],
      "env": {
        "ANALYSIS_BIOWASM": "your-value",
        "ANALYSIS_R": "your-value",
        "DB_TYPE": "your-value",
        "NCBI_API_KEY": "your-value",
        "S2_API_KEY": "your-value",
        "OPENFDA_API_KEY": "your-value",
        "ONCOKB_TOKEN": "your-value",
        "DISGENET_API_KEY": "your-value"
      }
    }
  }
}

{
  "servers": {
    "biomcp-ts": {
      "type": "stdio",
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "biomcp"
      ],
      "env": {
        "ANALYSIS_BIOWASM": "your-value",
        "ANALYSIS_R": "your-value",
        "DB_TYPE": "your-value",
        "NCBI_API_KEY": "your-value",
        "S2_API_KEY": "your-value",
        "OPENFDA_API_KEY": "your-value",
        "ONCOKB_TOKEN": "your-value",
        "DISGENET_API_KEY": "your-value"
      }
    }
  }
}

Deine Auswahl bleibt in einem Cookie auf diesem Gerät; kein Konto nötig.

Werte, die du selbst einträgst

• ANALYSIS_BIOWASM env
  Set to 1 to enable the samtools/bedtools/bcftools biowasm analysis tools
• ANALYSIS_R env
  Set to 1 to enable the R/Bioconductor analysis tools (requires the webr peer dependency; use the pinned one-shot client command)
• DB_TYPE env
  Set to mysql or sqlite to enable the read-only SQL database tools
• NCBI_API_KEY geheim env
  Higher NCBI E-utilities rate limits (3 -> 10 req/s)
• S2_API_KEY geheim env
  Higher Semantic Scholar rate limits
• OPENFDA_API_KEY geheim env
  Higher OpenFDA rate limits
• ONCOKB_TOKEN geheim env
  Required by the variant_oncokb tool (OncoKB annotations)
• DISGENET_API_KEY geheim env
  Required for DisGeNET disease-gene associations

Diese Einstellungen werden aus dem Registry-Eintrag des Entwicklers erzeugt. Wenn in der README etwas anderes steht, folge der README.

Was er kann

Läuft auf deinem Computer; die Tool-Liste erscheint nach der Installation in deiner KI-App.

Basischecksi

Wir prüfen Informationen, die jeder sehen kann; den Code haben wir nicht gelesen. Checks, die nicht zutreffen, werden nicht mitgezählt. · Geprüft am 9. Nov. 2026

• ✓ Bestanden

  Entwickler passt zum Repo

  Der Registry-Name wurde mit dem GitHub-Konto yeyuan98 bestätigt, dem das Repo gehört

• … Noch nicht geprüft

  Wird noch gepflegt

  Dieses Repo haben wir noch nicht von GitHub gelesen

• … Noch nicht geprüft

  Hat eine Lizenz

  Dieses Repo haben wir noch nicht von GitHub gelesen

• – Nicht zutreffend

  Endpunkt antwortet

  Dieser Server läuft auf deinem Computer; es gibt keinen Endpunkt im Internet

• – Nicht zutreffend

  Anmeldung mit OAuth

  Läuft auf deinem Computer und nutzt stattdessen lokale Einstellungen

• … Noch nicht geprüft

  Keine versteckten Anweisungen in Tool-Beschreibungen

  Läuft auf deinem Computer; Tool-Listen können wir nur von Endpunkten im Internet lesen

Im Vergleich mit anderen in Praxen & Gesundheiti

• Mehr Sterne als 0 % der anderen 1034 Server in dieser Kategorie
• Neuer in der Registry veröffentlicht als 36 % der anderen 1034 Server in dieser Kategorie
• Basischecks gleich gut wie oder besser als bei 100 % der anderen 1034 Server in dieser Kategorie

Verglichen mit allen aktiven Servern dieser Kategorie in der Registry. Sterne zählen nur, wenn dem Herausgeber das Repo gehört.

Alternativen

Server derselben Kategorie von anderen Entwicklern, sortiert nach Sternen.

So liest du eine Karte:↓ Downloads pro Wochei★ GitHub-SterneiDrei Säulen: Bewertungen · Checks · NutzungiAktualisiert = neueste Version in der Registry veröffentlichti

README vom Entwickler

npx -y biomcp doctor   # diagnose a machine: Node gate, config health, feature gates, peer deps