Prototipo · Versión preliminar: todos los servidores del registro oficial, sincronizados cada 30 minutos. Las reseñas y las cuentas llegarán en una etapa posterior.
PopNx MCPServidores MCP para quienes usan IA · explicados con palabras sencillas

Molecular MCP

de andylbrummerversión 0.1.6i★ –iSe ejecuta en tu computadora
Nombre en el registroio.github.andylbrummer/molecular-mcp

Instalar

Resumen

Descripción del creador (original en inglés)

GPU-accelerated MCP server for molecular dynamics, N-body simulations, and particle systems

Los tres pilares de PopNx MCP

Estos tres nunca se combinan en una sola puntuación: las opiniones, las mediciones y la popularidad son cosas distintas.

Qué puedes hacer con él

Todavía no escribimos un resumen sencillo para este. Abajo están los datos que leímos del registro.

  • Conexión: Se ejecuta en tu computadora
  • Transporte: stdio
  • Categoría: Otros

Instalación

Elige la app de IA que usas y copia la configuración.

Antes de instalar

Necesitas

  • PyPIuv de Python instalado (para el comando uvx)

¿Qué app usas?

Elige tu app arriba. La recordamos, así que la próxima vez el botón dirá “Instalar en …”.

Abre Claude Desktop → Settings → Developer → Edit Config y pega esto en claude_desktop_config.json

{
  "mcpServers": {
    "molecular": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "scicomp-molecular-mcp"
      ]
    }
  }
}

Ejecuta esto en tu terminal

claude mcp add molecular -- uvx scicomp-molecular-mcp

Abrir en Cursor

O copia la configuración tú

Pégalo en .cursor/mcp.json de tu proyecto, o en ~/.cursor/mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "molecular": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "scicomp-molecular-mcp"
      ]
    }
  }
}

Tu navegador te pide permiso para abrir la app; luego la app muestra la configuración y te pide confirmar. Los valores de las claves quedan vacíos para que los completes tú.

Abrir en VS Code

O copia la configuración tú

Pégalo en .vscode/mcp.json de tu proyecto

{
  "servers": {
    "molecular": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "scicomp-molecular-mcp"
      ]
    }
  }
}

Tu navegador te pide permiso para abrir la app; luego la app muestra la configuración y te pide confirmar. Los valores de las claves quedan vacíos para que los completes tú.

Este se ejecuta en tu computadora, y ChatGPT solo puede conectarse a servidores en internet. Elige otra app.

Tu elección se guarda en una cookie en este dispositivo; no necesitas cuenta.

Esta configuración se genera a partir de la ficha del creador en el registro. Si el README dice otra cosa, sigue el README.

Qué puede hacer

Se ejecuta en tu computadora; la lista de herramientas aparece en tu app de IA después de instalarlo.

Revisiones básicasi

Revisamos información que cualquiera puede ver; no hemos leído el código. Las revisiones que no aplican no se cuentan. · Revisado el 7 nov 2026

  • ✓ Superada

    El creador coincide con el repo

    El nombre en el registro se verificó con la cuenta de GitHub andylbrummer, dueña del repo

  • … Aún sin revisar

    Sigue en mantenimiento

    Todavía no hemos leído este repo en GitHub

  • … Aún sin revisar

    Tiene licencia

    Todavía no hemos leído este repo en GitHub

  • – No aplica

    El endpoint responde

    Este se ejecuta en tu computadora; no hay endpoint en internet

  • – No aplica

    Inicio de sesión con OAuth

    Se ejecuta en tu computadora y usa ajustes locales en su lugar

  • … Aún sin revisar

    Sin instrucciones ocultas en las descripciones de herramientas

    Se ejecuta en tu computadora; solo podemos leer listas de herramientas de endpoints en internet

Comparado con otros en Otrosi

  • Más estrellas que el 0% de los otros 32715 servidores de esta categoría
  • Publicado en el registro más recientemente que el 1% de los otros 32715 servidores de esta categoría
  • Revisiones básicas iguales o mejores que el 100% de los otros 32715 servidores de esta categoría

Comparado con todos los servidores activos de esta categoría en el registro. Las estrellas solo cuentan cuando quien lo publica es dueño del repo.

Preguntas frecuentes

¿Es seguro Molecular MCP?

Superó 1 de 1 revisiones básicas aplicables. No hemos leído el código. Antes de agregar una clave o un token, revisa qué acceso pide el servidor y usa una clave que tenga solo los permisos que necesitas.

¿Qué claves o códigos necesita?

El registro no indica ninguna clave obligatoria, aunque algunos servidores te piden iniciar sesión la primera vez que los usas.

¿Se ejecuta en mi computadora o en la nube?

Se ejecuta en tu computadora. Tu app de IA lo inicia cuando hace falta, y los datos no pasan por los servidores del creador (a menos que el propio servidor llame a un servicio en línea).

¿Sigue en mantenimiento?

El repo de GitHub cambió por última vez –, y la última versión (0.1.6) llegó al registro hace 10 meses.

¿Qué apps pueden usarlo?

Las apps compatibles con MCP, como Claude Desktop, Claude Code, Cursor y VS Code. También necesitas Python (uv) en tu computadora.

¿Qué puedo usar en su lugar?

En la misma categoría: Spec Driven Development, Remote Desktop Commander, First Sale Scout

Alternativas

Servidores de la misma categoría hechos por otros creadores, ordenados por estrellas.

Cómo leer una tarjeta:★ Estrellas de GitHubiTres pilares: reseñas · revisiones · usoiActualizado = fecha en que se publicó la última versión en el registroi

Spec Driven Development

de formulahendry

MCP Server that facilitates spec-driven development workflows, not just Vibe Coding.

Se ejecuta en tu computadora★ 440MITActualizado hace 14 meses
Instalar

Remote Desktop Commander

de desktop-commander

Remote Desktop Commander: use files, terminal and processes on your own computers from any AI app.

Se ejecuta en la nube★ 211Actualizado anteayer
Instalar

First Sale Scout

de firstsale.pro

Playbooks and a 14-day checklist for founders winning their first paying customers.

Se ejecuta en la nubeActualizado hoy
Instalar

README del creador

Abrir el README

Copiado tal cual del repo del creador. PopNx MCP no lo ha revisado ni lo respalda. Se quitaron HTML, imágenes y scripts. Los enlaces llevan fuera de este sitio.

scicomp-molecular-mcp

mcp-name: io.github.andylbrummer/molecular-mcp

MCP server for classical molecular dynamics simulations.

Overview

This server provides tools for molecular dynamics simulations with support for various ensembles and interaction potentials:

  • Particle systems - Create and manage systems of interacting particles
  • Interaction potentials - Lennard-Jones and Coulomb interactions
  • Ensembles - NVE (microcanonical), NVT (canonical), NPT (isothermal-isobaric)
  • Analysis tools - Radial distribution functions, mean squared displacement, phase transitions
  • Visualization - Trajectory rendering and density field visualization
  • GPU acceleration - Optional CUDA acceleration for large systems

Installation & Usage

# Run directly with uvx (no installation required)

uvx scicomp-molecular-mcp

Or install with pip

pip install scicomp-molecular-mcp

With GPU support

pip install scicomp-molecular-mcp[gpu]

Run as command

scicomp-molecular-mcp

Available Tools

System Setup
  • create_particles - Initialize particle system with temperature
  • add_potential - Add Lennard-Jones or Coulomb interactions
Simulation
  • run_md - NVE ensemble (constant energy, volume)
  • run_nvt - NVT ensemble (constant temperature, volume)
  • run_npt - NPT ensemble (constant temperature, pressure)
  • get_trajectory - Retrieve simulation trajectory data
Analysis
  • compute_rdf - Radial distribution function analysis
  • compute_msd - Mean squared displacement
  • analyze_temperature - Thermodynamic properties
  • detect_phase_transition - Identify phase transitions
  • density_field - Compute density field visualization
Visualization
  • render_trajectory - Animate particle trajectories

Configuration

Enable GPU acceleration with environment variable:

MCP_USE_GPU=1 scicomp-molecular-mcp

Examples

🎬 Visual Demos

Spectacular animated demonstrations:

Run demos with Claude:

claude -p "Simulate two galaxies colliding" \

--allowedTools "mcpmolecular-mcp*"

📖 Code Examples

Practical tutorials in EXAMPLES.md:

  • Simple liquid simulation with Lennard-Jones
  • Temperature & pressure control
  • Diffusion coefficient calculation
  • Ionic systems with Coulomb interactions
📚 Full Documentation

See the API documentation for complete reference.

Part of Math-Physics-ML MCP System

Part of a comprehensive system for scientific computing. See the documentation for the complete ecosystem.

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