GeneBe

Name: GeneBe
Author: genebe-net

de genebe-netversión 0.1.0i★ –iSe ejecuta en la nube

Nombre en el registronet.genebe/genebe-mcp

Instalar

Resumen

Descripción del creador (original en inglés)

Annotate and classify human genetic variants with GeneBe (ACMG, gnomAD, ClinVar). Research use only.

Los tres pilares de PopNx MCP

Estos tres nunca se combinan en una sola puntuación: las opiniones, las mediciones y la popularidad son cosas distintas.

Opinión de usuariosiAún no hay reseñasLas reseñas se abrirán junto con las cuentas en una etapa posterior
Nuestras revisiones básicasi1 de 1 superadasRevisado con información pública; el código aún no se ha escaneado
UsoiAún sin medir★ –

Qué puedes hacer con él

Todavía no escribimos un resumen sencillo para este. Abajo están los datos que leímos del registro.

Conexión: Se ejecuta en la nube
Transporte: Streamable HTTP
Categoría: Búsqueda y memoria de IA

Instalación

Elige la app de IA que usas y copia la configuración.

Antes de instalar

Revisiones básicas: 1 de 1 superadas
Se ejecuta en el servidor del creador: lo que le pidas pasa por su servidor.
El registro no indica ninguna clave que completar.

Necesitas

Se ejecuta en la nubeNo hay nada que instalar; se conecta por internet

¿Qué app usas?

ClaudeClaude CodeCursorVS CodeChatGPT

Elige tu app arriba. La recordamos, así que la próxima vez el botón dirá “Instalar en …”.

Funciona en Claude para web, escritorio y móvil:

Abre Settings → Connectors
Presiona Add custom connector
Pega la dirección de abajo y presiona Add
Si te pide iniciar sesión, inicia sesión en el servicio del creador

https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Ejecuta esto en tu terminal

claude mcp add --transport http genebe https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Abrir en Cursor

O copia la configuración tú

Pégalo en .cursor/mcp.json de tu proyecto, o en ~/.cursor/mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "genebe": {
      "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp"
    }
  }
}

Tu navegador te pide permiso para abrir la app; luego la app muestra la configuración y te pide confirmar. Los valores de las claves quedan vacíos para que los completes tú.

Abrir en VS Code

O copia la configuración tú

Pégalo en .vscode/mcp.json de tu proyecto

{
  "servers": {
    "genebe": {
      "type": "http",
      "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp"
    }
  }
}

Tu navegador te pide permiso para abrir la app; luego la app muestra la configuración y te pide confirmar. Los valores de las claves quedan vacíos para que los completes tú.

ChatGPT solo se conecta a servidores en internet:

Abre ChatGPT en la web → Settings → Connectors (Apps)
Presiona Create o Add (en algunos planes primero hay que activar Developer mode en Advanced)
Pega la dirección de abajo, ponle un nombre y guarda
Si te pide iniciar sesión, inicia sesión en el servicio del creador

https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Los nombres de los menús pueden variar un poco según el plan y con el tiempo.

Tu elección se guarda en una cookie en este dispositivo; no necesitas cuenta.

Esta configuración se genera a partir de la ficha del creador en el registro. Si el README dice otra cosa, sigue el README.

Qué puede hacer

Todavía no hemos leído la lista de herramientas de este servidor; revisamos los endpoints por turnos.

Revisiones básicasi

Revisamos información que cualquiera puede ver; no hemos leído el código. Las revisiones que no aplican no se cuentan. · Revisado el 6 nov 2026

✓ Superada
El creador coincide con el repo
El nombre en el registro se verificó con el dominio genebe.net (el registro comprueba quién es dueño del dominio)
… Aún sin revisar
Sigue en mantenimiento
Todavía no hemos leído este repo en GitHub
… Aún sin revisar
Tiene licencia
Todavía no hemos leído este repo en GitHub
… Aún sin revisar
El endpoint responde
Aún sin revisar; revisamos los endpoints por turnos
… Aún sin revisar
Inicio de sesión con OAuth
Aún sin revisar; revisamos los endpoints por turnos
… Aún sin revisar
Sin instrucciones ocultas en las descripciones de herramientas
Aún sin revisar; leemos la lista de herramientas cuando revisamos el endpoint

Comparado con otros en Búsqueda y memoria de IAi

Más estrellas que el 0% de los otros 7247 servidores de esta categoría
Publicado en el registro más recientemente que el 72% de los otros 7247 servidores de esta categoría
Revisiones básicas iguales o mejores que el 100% de los otros 7247 servidores de esta categoría

Comparado con todos los servidores activos de esta categoría en el registro. Las estrellas solo cuentan cuando quien lo publica es dueño del repo.

Preguntas frecuentes

¿Es seguro GeneBe?

Superó 1 de 1 revisiones básicas aplicables. No hemos leído el código. Antes de agregar una clave o un token, revisa qué acceso pide el servidor y usa una clave que tenga solo los permisos que necesitas.

¿Qué claves o códigos necesita?

El registro no indica ninguna clave obligatoria, aunque algunos servidores te piden iniciar sesión la primera vez que los usas.

¿Se ejecuta en mi computadora o en la nube?

Se ejecuta en la nube del creador. Te conectas por internet sin instalar nada, pero lo que envías pasa por los servidores del creador.

¿Sigue en mantenimiento?

El repo de GitHub cambió por última vez –, y la última versión (0.1.0) llegó al registro hace 15 días.

¿Qué apps pueden usarlo?

Las apps compatibles con MCP, como Claude Desktop, Claude Code, Cursor y VS Code. Se conecta por URL, así que también funcionan las apps que aceptan servidores MCP remotos, como ChatGPT en modo desarrollador.

¿Qué puedo usar en su lugar?

En la misma categoría: Context7, Codebase Memory, Exa

Alternativas

Servidores de la misma categoría hechos por otros creadores, ordenados por estrellas.

Cómo leer una tarjeta:★ Estrellas de GitHubiTres pilares: reseñas · revisiones · usoiActualizado = fecha en que se publicó la última versión en el registroi

Context7

de upstash

Up-to-date docs for AI agents

Computadora o nube★ 64.224MITActualizado hoy

Instalar

Codebase Memory

de DeusData

Codebase knowledge graph for AI agents — 162 languages, sub-ms queries, 99% fewer tokens.

Se ejecuta en tu computadora★ 48.148MITActualizado hace 20 días

Instalar

Exa

de exa-labs

Connect AI agents to Exa for web search, content fetching, and multi-step research.

Se ejecuta en la nube★ 5213MITActualizado el mes pasado

Instalar

README del creador

Abrir el README

Copiado tal cual del repo del creador. PopNx MCP no lo ha revisado ni lo respalda. Se quitaron HTML, imágenes y scripts. Los enlaces llevan fuera de este sitio.

🧬 GeneBe MCP

Give your AI assistant real variant-interpretation data instead of guesses.

Annotate and classify human genetic variants (ACMG, gnomAD, ClinVar, in-silico predictors) from Claude, Cursor, VS Code and any other MCP client, powered by GeneBe.

https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Why

Language models are bad at remembering the clinical status of a specific variant. They sound confident and are often wrong. GeneBe MCP lets the assistant look the variant up and answer from data: a transparent, points-based ACMG classification with every criterion explained, together with population frequencies, predictor scores, ClinVar and transcript consequences.

*"Is NM_005577.4:c.4195A>C benign?"*

*"What is chr6-160585140-T-G? Explain why it is classified that way."*

*"Convert rs41272110 to hg38 and list its consequences on each transcript."*

For example, chr6-160585140-T-G (rs41272110, *LPA*) comes back as Benign, −9 points with criteria BA1 and BP4, plus the data behind them and a link to the GeneBe page.

What you get

Any notation in: genomic coordinates, HGVS, rsID or SPDI; hg19, hg38 and T2T supported through liftover.
Verdict you can audit: ACMG classification with points and the reasoning for each criterion, not a black-box label.
Evidence in one call: gnomAD frequencies, in-silico predictors, ClinVar, per-transcript consequences (HGVS c./p., impact), gene details with MANE Select and ClinGen gene–disease validity.
Compact answers: large lists are capped, so one call costs roughly 1–3k tokens, and every result also carries structured data that follows the tool's output schema.
Links back to GeneBe, so the human can check the source.

Connect in a minute

No sign-up, no API key. The server is remote; you only add its URL.

Claude Code

claude mcp add --transport http genebe https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Claude (web and desktop)

Settings → Connectors → *Add custom connector*, then enter https://mcp.genebe.net/v1/mcp.

ChatGPT

Open chatgpt.com/plugins, click Add (+) → Add custom MCP, and enter https://mcp.genebe.net/v1/mcp.

Cursor

Add to ~/.cursor/mcp.json:

{ "mcpServers": { "genebe": { "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp" } } }

VS Code

Add to .vscode/mcp.json:

{ "servers": { "genebe": { "type": "http", "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp" } } }

Any other client / try it with curl

Any client that supports remote MCP over Streamable HTTP works. Try it from a terminal:

curl -s -X POST https://mcp.genebe.net/v1/mcp \

-H 'Content-Type: application/json' -H 'Accept: application/json, text/event-stream' \ -d '{"jsonrpc":"2.0","id":1,"method":"tools/call","params":{"name":"annotate_variant","arguments":{"variant":"chr6-160585140-T-G"}}}'

More examples: USAGE.md.

Tools

Tool	What it does
`annotate_variant`	Start here. Any notation → ACMG verdict, points and criteria, frequencies, predictor scores, ClinVar, consequences, GeneBe links
`explain_acmg_decision_path`	Why each classification criterion applied, in plain text
`convert_variant`	HGVS / rsID / SPDI → hg38 coordinates
`get_variant_effects`	Per-transcript consequences (HGVS c./p., impact)
`get_gene`	Gene identifiers, location, MANE Select, ClinGen gene–disease validity, transcripts
`liftover_coordinate`	Positions, intervals or variants between hg19 / hg38 / t2t

The default genome build is hg38.

Trust and privacy

Read-only. No tool changes anything, anywhere.
No account, no key needed to use the hosted server.
Single variants only. No patient data, no VCF files, no samples are sent or stored.
Nothing is stored and variant input is not logged by the MCP server.
Transparent classification. Results come from GeneBe's points-based ACMG implementation; the reasoning is returned with the verdict, so you and the assistant can check it.
Open source under the MIT license; you can read exactly what the server does, or run your own copy.
Research use only. This is not a medical device and not a diagnosis. Classifications must be reviewed by a qualified specialist before any clinical use.

Roadmap

Today GeneBe MCP answers questions about single variants. We plan to grow it into a workspace your assistant can use on your own data. None of the items below is available yet, and the order may change.

Sign-in, so the assistant can act on your GeneBe account
Your own samples: view and edit sample details and annotations
Search your cohort: find a variant across your own set of samples
Upload samples from the assistant
Supervise computations: start analyses, follow their progress and read the results

Ideas or requests? Open an issue or write to us via genebe.net.

Data sources

Results combine data from GeneBe, gnomAD, ClinVar, UniProt, ClinGen and dbNSFP predictors. Please check each source's license terms before redistributing the data.

Contributing and self-hosting

Want to run your own instance or change the code? See DEVELOPMENT.md. Issues and pull requests are welcome.

Made by the GeneBe team · MIT · Research use only

GeneBe

Resumen

Los tres pilares de PopNx MCP

Qué puedes hacer con él

Instalación

Antes de instalar

Qué puede hacer

Revisiones básicasi

El creador coincide con el repo

Sigue en mantenimiento

Tiene licencia

El endpoint responde

Inicio de sesión con OAuth

Sin instrucciones ocultas en las descripciones de herramientas

Comparado con otros en Búsqueda y memoria de IAi

Preguntas frecuentes

Alternativas

Context7

Codebase Memory

Exa

README del creador

🧬 GeneBe MCP

Why

What you get

Connect in a minute

Tools

Trust and privacy

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Data sources

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