Mirobody
โดย thetahealth
Lab results to LOINC codes and UCUM units, symptoms and diagnoses to ICPC-3. Offline, no API key.
รันบนเครื่อง★ 1,408Apache-2.0อัปเดต 5 วันที่ผ่านมา
ติดตั้ง
Genefoundry
ภาพรวม
คำอธิบายจากผู้ทำ (ภาษาอังกฤษตามต้นฉบับ)
MCP gateway federating 22 biomedical MCP servers behind one endpoint: gnomAD, ClinVar, HPO, VEP.
สามเสาของ PopNx MCP
สามเรื่องนี้ไม่รวมเป็นคะแนนเดียว เพราะความเห็น การวัด และความนิยม เป็นคนละเรื่องกัน
- เสียงผู้ใช้iยังไม่มีรีวิวรีวิวเปิดพร้อมระบบบัญชีในขั้นถัดไป
- ผลตรวจเบื้องต้นของเราiผ่าน 1 จาก 1 ข้อตรวจจากข้อมูลที่เปิดอยู่ ยังไม่ได้สแกนโค้ด
- การใช้งานiยังไม่ได้วัด★ –
ใช้ทำอะไรได้
ตัวนี้ยังไม่ได้เรียบเรียงเป็นภาษาไทย ด้านล่างคือข้อเท็จจริงที่เราอ่านจาก registry
- การเชื่อมต่อ: รันบนคลาวด์
- ช่องทาง (transport): Streamable HTTP
- หมวด: คลินิกและสุขภาพ
ติดตั้ง
เลือกโปรแกรม AI ที่คุณใช้ แล้วคัดลอกค่าตั้งไปวาง
ก่อนติดตั้ง
- ผลตรวจเบื้องต้น: ผ่าน 1 จาก 1 ข้อ
- รันบนเครื่องของผู้ทำ สิ่งที่คุณถามจะผ่านเครื่องของเขา
- ทะเบียนไม่ได้ระบุ key ที่ต้องใส่
ต้องเตรียมก่อน
- รันบนคลาวด์ไม่ต้องลงโปรแกรมเพิ่ม ต่อผ่านอินเทอร์เน็ตได้เลย
คุณใช้แอปไหน
เลือกแอปด้านบน เราจำไว้ให้ ครั้งหน้าปุ่มจะขึ้นว่า “ติดตั้งลง …”
ใช้ได้ทั้ง Claude บนเว็บ แอปคอมพิวเตอร์ และมือถือ:
- เปิด Settings → Connectors
- กด Add custom connector
- วางที่อยู่ด้านล่างแล้วกด Add
- ถ้าให้ล็อกอิน ให้ล็อกอินกับผู้ทำ
https://genefoundry.org/mcpพิมพ์คำสั่งนี้ใน Terminal
claude mcp add --transport http genefoundry https://genefoundry.org/mcpหรือคัดลอกค่าตั้งเอง
วางในไฟล์ .cursor/mcp.json ของโปรเจกต์ หรือ ~/.cursor/mcp.json
{
"mcpServers": {
"genefoundry": {
"url": "https://genefoundry.org/mcp"
}
}
}เบราว์เซอร์จะถามก่อนเปิดแอป จากนั้นแอปแสดงค่าตั้งให้ตรวจแล้วกดยืนยัน ช่อง key เว้นว่างไว้ให้คุณใส่เอง
หรือคัดลอกค่าตั้งเอง
วางในไฟล์ .vscode/mcp.json ของโปรเจกต์
{
"servers": {
"genefoundry": {
"type": "http",
"url": "https://genefoundry.org/mcp"
}
}
}เบราว์เซอร์จะถามก่อนเปิดแอป จากนั้นแอปแสดงค่าตั้งให้ตรวจแล้วกดยืนยัน ช่อง key เว้นว่างไว้ให้คุณใส่เอง
ChatGPT ต่อได้เฉพาะ server ที่อยู่บนอินเทอร์เน็ต:
- เปิด ChatGPT บนเว็บ → Settings → Connectors (Apps)
- กด Create หรือ Add (บางแพ็กเกจต้องเปิด Developer mode ใน Advanced ก่อน)
- วางที่อยู่ด้านล่าง ตั้งชื่อ แล้วบันทึก
- ถ้าให้ล็อกอิน ให้ล็อกอินกับผู้ทำ
https://genefoundry.org/mcpชื่อเมนูอาจต่างกันเล็กน้อยตามแพ็กเกจและรุ่นของแอป
ตัวเลือกเก็บในคุกกี้บนเครื่องนี้ ไม่ต้องมีบัญชี
ค่าตั้งนี้สร้างจากข้อมูลใน registry ของผู้ทำ ถ้าไม่ตรงกับ README ให้เชื่อ README
ทำอะไรได้บ้าง
ยังไม่ได้อ่านรายการเครื่องมือของตัวนี้ เราตรวจ endpoint ทีละชุดวนไป
ผลตรวจเบื้องต้นi
เราตรวจจากข้อมูลที่ใครก็เปิดดูได้ ยังไม่ได้อ่านโค้ด ข้อที่ไม่เกี่ยวกับตัวนี้ไม่นับในตัวหาร · ตรวจเมื่อ 7 พ.ย. 2569
- ✓ ผ่าน
ตัวตนผู้ทำตรงกับ repo
ชื่อใน registry ยืนยันด้วยบัญชี GitHub berntpopp ซึ่งเป็นเจ้าของ repo
- … ยังไม่ตรวจ
ยังมีคนดูแล
ยังไม่ได้อ่านข้อมูล repo จาก GitHub
- … ยังไม่ตรวจ
มีสัญญาอนุญาต (license)
ยังไม่ได้อ่านข้อมูล repo จาก GitHub
- … ยังไม่ตรวจ
endpoint ตอบ
ยังไม่ได้ตรวจ เราตรวจ endpoint ทีละชุดวนไป
- … ยังไม่ตรวจ
ล็อกอินแบบ OAuth
ยังไม่ได้ตรวจ เราตรวจ endpoint ทีละชุดวนไป
- … ยังไม่ตรวจ
คำอธิบายเครื่องมือไม่มีคำสั่งแอบแฝง
ยังไม่ได้ตรวจ เราอ่านรายการเครื่องมือตอนตรวจ endpoint
เทียบกับตัวอื่นในหมวด คลินิกและสุขภาพi
- ดาวมากกว่า 0% ของอีก 866 ตัวในหมวดนี้
- ส่งรุ่นใหม่เข้า registry ล่าสุดกว่า 72% ของอีก 866 ตัวในหมวดนี้
- ผลตรวจเบื้องต้นดีกว่าหรือเท่ากับ 100% ของอีก 866 ตัวในหมวดนี้
เทียบกับทุก server ที่ยังใช้งานในหมวดนี้ทั้งทะเบียน ดาวนับเฉพาะเมื่อผู้ลงทะเบียนเป็นเจ้าของ repo
คำถามที่พบบ่อย
Genefoundry ปลอดภัยไหม?
จากการตรวจเบื้องต้นของเรา ผ่าน 1 จาก 1 ข้อที่ตรวจได้ เรายังไม่ได้อ่านโค้ด ก่อนใส่กุญแจหรือ token ให้ดูว่า server ขอสิทธิ์อะไร และเลือกกุญแจที่ทำได้เท่าที่จำเป็น
ต้องใช้กุญแจหรือรหัสอะไรบ้าง?
registry ไม่ได้ระบุว่าต้องใช้กุญแจ แต่บางตัวจะขอให้ล็อกอินตอนใช้ครั้งแรก
ตัวนี้รันบนเครื่องหรือบนคลาวด์?
รันบนคลาวด์ของผู้ทำ ต่อผ่านอินเทอร์เน็ตได้เลย ไม่ต้องลงโปรแกรม แต่ข้อมูลที่ส่งให้จะผ่านเซิร์ฟเวอร์ของผู้ทำ
ยังมีคนดูแลอยู่ไหม?
repo บน GitHub มีการแก้โค้ดล่าสุด – และส่งรุ่นล่าสุด (0.10.10) เข้า registry 9 วันที่ผ่านมา
ใช้กับโปรแกรมไหนได้บ้าง?
โปรแกรมที่รองรับ MCP เช่น Claude Desktop, Claude Code, Cursor และ VS Code ตัวนี้ต่อผ่าน URL จึงใช้กับโปรแกรมที่รับ remote MCP ได้ เช่น ChatGPT ที่เปิดโหมดนักพัฒนา
มีตัวไหนใช้แทนได้บ้าง?
ในหมวดเดียวกันมี Mirobody, FHIR MCP Server, Google Health MCP
ตัวที่ใช้แทนได้
server หมวดเดียวกันจากผู้ทำคนอื่น เรียงตามดาว
อ่านการ์ด:★ ดาว GitHubiสามเสา: รีวิว · ผลตรวจ · การใช้งานiอัปเดต = วันที่ส่งรุ่นล่าสุดเข้า registryi
FHIR MCP Server
โดย wso2
MCP server providing seamless access to FHIR APIs for AI tools and healthcare applications
รันบนเครื่อง★ 137Apache-2.0อัปเดต 9 วันที่ผ่านมา
ติดตั้ง
Google Health MCP
โดย davidmosiah
Privacy-first unofficial Google Health API v4 MCP server for health, sleep, activity, HR agents
รันบนเครื่อง★ 79MITอัปเดต 4 เดือนที่ผ่านมา
ติดตั้ง
README จากผู้ทำ
เปิดอ่าน README
ส่วนนี้คัดจาก repo ของผู้ทำตามต้นฉบับ PopNx MCP ไม่ได้ตรวจหรือรับรองเนื้อหา ตัด HTML รูปภาพ และสคริปต์ออกแล้ว ลิงก์จะพาออกนอกเว็บ
genefoundry-router
A thin FastMCP 3.x aggregator that federates the GeneFoundry *-link MCP fleet behind a single Streamable-HTTP endpoint. A host adds one server — genefoundry — and gets every biomedical backend with collision-free _ naming and search-based discovery.
[!IMPORTANT]
Research use only. Not clinical decision support. Do not use for diagnosis,
treatment, triage, or patient management.
Why
An MCP host that mounted all 21 backends directly would face a wall of several hundred tools — more than a model can reason over, and a guarantee of name collisions. The router collapses that into one endpoint and replaces the flat catalog with a search surface, so a model finds the right tool by intent instead of by scrolling.
It is a *client* to each backend and a *server* to hosts: it namespaces and shapes the surface, but never rewrites a backend's data. The caller's token is never forwarded upstream.
Quick start
The fleet is hosted — no install required:
claude mcp add --transport http genefoundry https://genefoundry.org/mcpHealth check: genefoundry.org/health.
To run your own against the live fleet (Python 3.14+, uv):
uv sync --group devcp .env.example .env # set GF_*_URL backend URLs and GF_AUTH_MODE uv run genefoundry-router run --host 127.0.0.1 --port 8000 curl -s localhost:8000/health | python -m json.tool
An offline fake fleet (make dev-fleet + make run-dev, or one-shot make test-e2e) runs the real router against impersonated backends over real Streamable-HTTP — no Docker, no network.
Tools
The router does not surface the federated catalog flat. A model sees three things:
| Tool | Purpose |
|---|---|
search_tools | Relevance search over the entire federated catalog |
call_tool | Invoke a hit by its _ name |
| *pinned entry points* | Each backend's front-door tool, always visible — declared per-backend as entrypoints: in servers.yaml |
search_tools(query="splicing prediction") # → spliceai_predict_splicing (+ schema)call_tool(name="spliceai_predict_splicing", arguments={...})
Pinning makes each domain's canonical tool reachable deterministically rather than by relevance luck. See How discovery works — including the two traps that bite MCP clients.
Federated backends
22 backends, 285 tools, each surfaced namespaced — e.g. gnomad_search_genes.
| Namespace | Domain | Data source | Tools | Repo |
|---|---|---|---|---|
pubtator | Literature & entity annotation | PubTator3 | 35 | pubtator-link |
gnomad | Variant / gene / population frequency | gnomAD | 22 | gnomad-link |
orphanet | Rare disease ontology & associations | Orphadata | 19 | orphanet-link |
clingen | Gene–disease curation | ClinGen | 17 | clingen-link |
hpo | Phenotype ontology & associations | Human Phenotype Ontology | 17 | hpo-link |
mavedb | Variant-effect assay scores | MaveDB | 15 | mavedb-link |
uniprot | Protein function | UniProt | 15 | uniprot-link |
clinpgx | Pharmacogenomics / gene-drug guidelines | ClinPGx | 13 | clinpgx-link |
genereviews | Gene–disease literature | GeneReviews | 13 | genereviews-link |
mgi | Mouse phenotype & models | MGI | 13 | mgi-link |
mondo | Disease ontology / cross-references | Mondo | 13 | mondo-link |
gencc | Gene–disease curation | GenCC | 12 | gencc-link |
metadome | Protein tolerance landscapes | MetaDome | 11 | metadome-link |
stringdb | Protein–protein interaction networks | STRING | 10 | stringdb-link |
gtex | Tissue expression | GTEx Portal | 9 | gtex-link |
hgnc | Gene nomenclature | HGNC | 9 | hgnc-link |
panelapp | Diagnostic gene panels & curation | PanelApp | 9 | panelapp-link |
autopvs1 | Variant ACMG PVS1 | AutoPVS1 | 7 | autopvs1-link |
spliceai | Splicing prediction | SpliceAI Lookup | 7 | spliceailookup-link |
vep | Variant annotation / consequence | Ensembl VEP | 7 | vep-link |
clinvar | Variant clinical significance | ClinVar | 6 | clinvar-link |
litvar | Variant literature | LitVar2 | 6 | litvar-link |
Data & provenance
The router serves no data of its own; each backend owns its sources, licences and citation guidance, and the router mirrors their disclaimers.
What it does own is integrity of the tool surface. A backend can serve a clean tool at review time and later change its definition — the channel for a rug pull. The router fingerprints every normalized tool definition and diffs the live fleet against a reviewed, packaged baseline (genefoundry_router/data/fleet-baseline.json), enforced at startup and on a schedule. See Deployment → drift detection.
Documentation
- Configuration & authentication — every
GF_*variable, the OAuth/JWT resource-server modes, and the startup guards. - Deployment — container release, digest pinning, rollback, and drift detection.
- How discovery works — the search surface, entry-point pinning, and how discoverability is measured.
- Design spec — the architecture and why it is shaped this way.
- Fleet standards — Tool-Naming · Response-Envelope · MCP-Behaviour · Tool-Surface-Budget · Tool-Schema-Documentation · Container-Hardening · Versioning · README.
Contributing
See AGENTS.md for engineering conventions. make ci-local is the definition-of-done gate: format, lint, line budget, README standard, mypy, and tests.
License
MIT © Bernt Popp. Each federated backend carries the licence and citation terms of its upstream data source; see that backend's repository.