biomedmcp

ใช้ทำอะไรได้

ตัวนี้ยังไม่ได้เรียบเรียงเป็นภาษาไทย ด้านล่างคือข้อเท็จจริงที่เราอ่านจาก registry

• การเชื่อมต่อ: บนเครื่องหรือคลาวด์
• ช่องทาง (transport): stdio, Streamable HTTP
• หมวด: คลินิกและสุขภาพ

ติดตั้ง

เลือกโปรแกรม AI ที่คุณใช้ แล้วคัดลอกค่าตั้งไปวาง

ต้องเตรียมก่อน

• รันบนคลาวด์ไม่ต้องลงโปรแกรมเพิ่ม ต่อผ่านอินเทอร์เน็ตได้เลย
• PyPIติดตั้ง uv ของ Python (มีคำสั่ง uvx) ในเครื่อง

คุณใช้แอปไหน

https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "ใส่ค่าของคุณ"
      }
    }
  }
}

claude mcp add --transport http biomedmcp https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

claude mcp add biomedmcp --env UBI_PROFILE='ใส่ค่าของคุณ' -- uvx biomedmcp mcp --transport stdio

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "url": "https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp"
    }
  }
}

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "ใส่ค่าของคุณ"
      }
    }
  }
}

{
  "servers": {
    "biomedmcp": {
      "type": "http",
      "url": "https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp"
    }
  }
}

{
  "servers": {
    "biomedmcp": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "ใส่ค่าของคุณ"
      }
    }
  }
}

https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

ตัวเลือกเก็บในคุกกี้บนเครื่องนี้ ไม่ต้องมีบัญชี

ค่าที่ต้องใส่เอง

• UBI_PROFILE env

ค่าตั้งนี้สร้างจากข้อมูลใน registry ของผู้ทำ ถ้าไม่ตรงกับ README ให้เชื่อ README

ทำอะไรได้บ้าง

ชื่อและคำอธิบายเครื่องมือตามที่ server ตอบมาเมื่อ 7 พ.ย. 2569 ผู้ทำเป็นคนเขียน ไม่ใช่เรา แสดงเป็นข้อความล้วน

• search_records

  Search genes, proteins, drugs, diseases, phenotypes, pathways, variants, pharmacogenomics, GWAS, diagnostics, adverse events, studies, patents or authors by text; returns IDs for get_record (variants: get_variant_evidence). Papers: search_literature. Trials: search_trials. Patent

• get_record

  Fetch one record by ID with optional evidence sections, e.g. gene expression/eqtl/diseases/druggability, drug label/safety, article fulltext, trial eligibility, protein domains/structures. Variants: get_variant_evidence. List an entity's sections with get_capabilities(entity=...)

• search_literature

  Search papers across PubMed, Europe PMC, PubTator and LitSense with date, author, journal, article-type and open-access filters. Deduplicates across sources and reports each source's outcome. Read abstracts or full text with get_record(entity=article). e.g. {"query":"PCSK9 LDL ch

• search_trials

  Search clinical trials (ClinicalTrials.gov, NCI) by condition, intervention, phase and recruitment status. Read arms, eligibility or outcomes with get_record(entity=trial). Does not assess an individual's eligibility. e.g. {"query":"familial hypercholesterolemia","filters":{"stat

• get_variant_evidence

  Get evidence for one variant (rsID, gene + protein change, HGVS or chr:pos:ref:alt). Defaults: ClinVar, gnomAD population, CIViC; add predictions (AlphaMissense), eve, cosmic, oncokb, hotspots, gwas or cbioportal. Ambiguous assembly or transcript is reported, not guessed; predict

• analyze_study

  Analyze an installed public cancer genomics study: gene_profile, mutation_cohort, survival, compare, co_occurrence, filter_cohort, top_mutated. List installed studies with get_capabilities(source=study); ubi_synthetic is invented demo data. Report sample denominators and exclusio

• resolve_entity

  Map a name, alias or ambiguous identifier to exact species-qualified IDs before joining evidence. Returns candidates when ambiguous; a provider match score alone is not identity. Skip when you already hold an exact ID. e.g. {"entity":"gene","query":"LDL receptor","species":9606}

• find_related

  List records linked to one record. gene/drug/disease: articles, trials. variant: articles, structure. article: citations, references, recommendations, authors, entities. author: articles. Record attributes are get_record sections, not relations. e.g. {"entity":"article","id":"PMI

• build_dossier

  Build a multi-section dossier in one call: verified identity, default record sections and top related papers, with citations and per-source outcomes. Workflows: target_dossier, model_input_bundle (gene), drug_review, disease_landscape, pathway_review, variant_dossier, negative_ev

• query_source

  Run a source-specific operation that other tools do not cover, e.g. ChEMBL bioactivities, Ensembl coordinates, PDB structure quality, OmniPath interactions, NCBI Datasets genomes, ncbi-records for GenBank/GEO/SRA. Read get_capabilities(source=...) for operations and params first.

• run_batch

  Run up to ten independent read calls in parallel with one quota reservation; each result keeps its own outcome. build_dossier and utilities are not batchable. e.g. {"calls":[{"operation":"get_record","arguments":{"entity":"gene","id":"PCSK9","species":9606}}]}

• get_capabilities

  List enabled sources, entity sections, dossier workflows and source operations with exact parameter schemas. Narrow with source or entity; diagnose=true probes source health. Examples: biomedmcp://guide. e.g. {}

• get_quota

  Show remaining research allowance and reset times; signed-in accounts get higher limits. e.g. {}

ผลตรวจเบื้องต้นi

เราตรวจจากข้อมูลที่ใครก็เปิดดูได้ ยังไม่ได้อ่านโค้ด ข้อที่ไม่เกี่ยวกับตัวนี้ไม่นับในตัวหาร · ตรวจเมื่อ 8 พ.ย. 2569

• ✓ ผ่าน

  ตัวตนผู้ทำตรงกับ repo

  ชื่อใน registry ยืนยันด้วยบัญชี GitHub unibio-intelligence ซึ่งเป็นเจ้าของ repo

• … ยังไม่ตรวจ

  ยังมีคนดูแล

  ยังไม่ได้อ่านข้อมูล repo จาก GitHub

• … ยังไม่ตรวจ

  มีสัญญาอนุญาต (license)

  ยังไม่ได้อ่านข้อมูล repo จาก GitHub

• ✓ ผ่าน

  endpoint ตอบ

  ตอบกลับใน 105 ms (HTTP 200)

• – ไม่เกี่ยว

  ล็อกอินแบบ OAuth

  ไม่ต้องล็อกอิน

• ✓ ผ่าน

  คำอธิบายเครื่องมือไม่มีคำสั่งแอบแฝง

  อ่านคำอธิบายเครื่องมือ 13 ตัวแล้ว ไม่พบคำสั่งแอบแฝงถึง AI

เทียบกับตัวอื่นในหมวด คลินิกและสุขภาพi

• ดาวมากกว่า 0% ของอีก 1028 ตัวในหมวดนี้
• ส่งรุ่นใหม่เข้า registry ล่าสุดกว่า 91% ของอีก 1028 ตัวในหมวดนี้
• ผลตรวจเบื้องต้นดีกว่าหรือเท่ากับ 100% ของอีก 1028 ตัวในหมวดนี้

เทียบกับทุก server ที่ยังใช้งานในหมวดนี้ทั้งทะเบียน ดาวนับเฉพาะเมื่อผู้ลงทะเบียนเป็นเจ้าของ repo

ตัวที่ใช้แทนได้

server หมวดเดียวกันจากผู้ทำคนอื่น เรียงตามดาว

อ่านการ์ด:↓ ดาวน์โหลดต่อสัปดาห์i★ ดาว GitHubiสามเสา: รีวิว · ผลตรวจ · การใช้งานiอัปเดต = วันที่ส่งรุ่นล่าสุดเข้า registryi

README จากผู้ทำ

python -m pip install biomedmcp==0.2.5

UBI_PROFILE=local biomedmcp get_record '{"entity":"gene","id":"LDLR","species":9606,"sections":["expression"]}'

<!-- public-call-examples:end -->

UBI_PROFILE=local biomedmcp-server --transport http --host 127.0.0.1 --port 8000