GeneBe

Name: GeneBe
Author: genebe-net

제작자: genebe-net버전 0.1.0i★ 0i클라우드에서 실행

레지스트리 이름net.genebe/genebe-mcp

설치

개요

제작자가 쓴 설명(영어 원문)

Annotate and classify human genetic variants with GeneBe (ACMG, gnomAD, ClinVar). Research use only.

PopNx MCP의 세 기둥

이 세 가지는 절대 하나의 점수로 합치지 않아요. 의견, 측정, 인기는 서로 다른 것이니까요.

사용자 의견i아직 리뷰가 없어요리뷰는 다음 단계에서 계정 기능과 함께 열려요
우리의 기본 점검i4개 중 4개 통과공개된 정보로 점검했으며, 코드는 아직 스캔하지 않았어요
사용 정도i초기★ 0

할 수 있는 일

이 서버는 아직 쉬운 말로 된 요약을 쓰지 못했어요. 아래는 레지스트리에서 읽어 온 사실이에요.

연결 방식: 클라우드에서 실행
전송 방식: Streamable HTTP
카테고리: 검색 및 AI 기억

설치

쓰고 있는 AI 앱을 고른 다음 설정을 복사하세요.

설치하기 전에

기본 점검: 4개 중 4개 통과
제작자의 서버에서 실행돼요. 내가 요청한 내용은 제작자의 서버를 거쳐요.
할 수 있는 일 6가지(도구) annotate_variant, explain_acmg_decision_path, convert_variant, get_variant_effects …
레지스트리에 입력해야 할 키가 나와 있지 않아요.

필요한 것

클라우드에서 실행설치할 것 없음. 인터넷으로 연결돼요

어떤 앱을 쓰세요?

ClaudeClaude CodeCursorVS CodeChatGPT

위에서 앱을 고르세요. 기억해 두었다가 다음부터는 버튼에 “…에 설치”라고 표시해요.

웹, 데스크톱, 모바일의 Claude에서 쓸 수 있어요:

Settings → Connectors 열기
Add custom connector 누르기
아래 주소를 붙여 넣고 Add 누르기
로그인하라고 하면 제작자의 서비스에 로그인하기

https://mcp.genebe.net/v1/mcp

터미널에서 이 명령어를 실행하세요

claude mcp add --transport http genebe https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Cursor에서 열기

또는 설정을 직접 복사하기

프로젝트의 .cursor/mcp.json 또는 ~/.cursor/mcp.json에 붙여 넣으세요

{
  "mcpServers": {
    "genebe": {
      "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp"
    }
  }
}

브라우저가 앱을 열지 물어본 다음, 앱이 설정을 보여 주고 확인을 요청해요. 키 값은 비워 두니 직접 입력하세요.

VS Code에서 열기

또는 설정을 직접 복사하기

프로젝트의 .vscode/mcp.json에 붙여 넣으세요

{
  "servers": {
    "genebe": {
      "type": "http",
      "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp"
    }
  }
}

브라우저가 앱을 열지 물어본 다음, 앱이 설정을 보여 주고 확인을 요청해요. 키 값은 비워 두니 직접 입력하세요.

ChatGPT는 인터넷에 있는 서버에만 연결할 수 있어요:

웹에서 ChatGPT 열기 → Settings → Connectors (Apps)
Create 또는 Add 누르기(일부 요금제는 먼저 Advanced에서 Developer mode를 켜야 해요)
아래 주소를 붙여 넣고 이름을 정한 뒤 저장하기
로그인하라고 하면 제작자의 서비스에 로그인하기

https://mcp.genebe.net/v1/mcp

메뉴 이름은 요금제나 시기에 따라 조금 다를 수 있어요.

선택한 앱은 이 기기의 쿠키에만 저장돼요. 계정은 필요 없어요.

이 설정은 제작자의 레지스트리 정보로 만들었어요. README와 다르면 README를 따르세요.

어떤 앱에서 쓸 수 있나요

이 서버의 연결 방식과 각 앱의 공식 문서를 바탕으로 했어요. 2026년 11월 10일 확인.

인터넷으로 연결하는 앱

Claude ChatGPT Goose LM Studio Msty Studio Cherry Studio Cursor VS Code + GitHub Copilot Visual Studio Windsurf (Devin Desktop)Zed Kiro Cline Continue JetBrains AI Assistant Claude Code Codex CLI Gemini CLI OpenCode nodecode Warp LibreChat Open WebUI Raycast

모든 앱과 장단점 →

할 수 있는 일

도구 이름과 설명은 서버가 2026년 11월 7일에 알려 준 그대로예요. 우리가 아니라 제작자가 쓴 글이고, 일반 텍스트로만 보여 드려요.

annotate_variant
Annotate and classify one human genetic variant using GeneBe. Start here for any question about a variant (what is it, is it pathogenic/benign, how common is it). Returns the ACMG verdict with points and criteria, population frequency (gnomAD), predictor scores (REVEL, AlphaMisse
explain_acmg_decision_path
Explain step by step why each classification criterion did or did not apply to a variant. Use after annotate_variant when the user asks "why was this classified that way?". Returns an ASCII rendering of the decision tree with the evaluated conditions. By default it explains the g
convert_variant
Convert a variant written in any notation into normalized hg38 genomic coordinates. Use when you only need the chr/pos/ref/alt of a variant (for example to translate HGVS or an rsID), without annotation. Does not classify the variant; use annotate_variant for that.
get_variant_effects
List a variant's predicted molecular consequences on every overlapping transcript. Returns per-transcript HGVS (c. and p.), consequence terms (e.g. missense_variant) and impact, most severe and MANE Select transcripts first. Lightweight: no frequencies or classification.
get_gene
Look up a human gene: identifiers, location, MANE Select transcript, ClinGen gene-disease validity. Use for questions about a gene rather than a specific variant. Transcripts are listed with MANE Select first and capped; check total_transcripts.
liftover_coordinate
Convert a genomic position, interval or variant between genome builds (hg19, hg38, t2t). Check `status`: RESOLVED means one result, AMBIGUOUS means several candidates, anything else means it could not be mapped (see errors). For variants, ref/alt are rebuilt against the target re

기본 점검i

누구나 볼 수 있는 정보를 점검했고, 코드는 읽지 않았어요. 해당하지 않는 항목은 개수에서 뺐어요. · 2026년 11월 10일 점검

✓ 통과
제작자와 저장소 일치
레지스트리 이름이 도메인 genebe.net 기준으로 확인되었어요(레지스트리가 도메인 소유를 확인해요)
✓ 통과
계속 관리되고 있음
코드 마지막 변경: 19일 전
… 아직 점검 안 함
라이선스 있음
아직 GitHub에서 이 저장소를 읽어 오지 않았어요
✓ 통과
엔드포인트 응답
90ms 만에 응답(HTTP 200)
– 해당 없음
OAuth로 로그인
로그인 필요 없음
✓ 통과
도구 설명에 숨겨진 지시 없음
도구 설명 6개를 읽었고, AI에게 보내는 숨겨진 지시는 없었어요

검색 및 AI 기억 카테고리의 다른 서버와 비교i

이 카테고리의 다른 서버 5875개 중 0%보다 스타가 많아요
이 카테고리의 다른 서버 5875개 중 67%보다 최근에 레지스트리에 공개됐어요
기본 점검 결과가 이 카테고리의 다른 서버 5875개 중 100%와 같거나 더 좋아요

레지스트리에서 이 카테고리의 활성 서버 전체와 비교했어요. 스타는 게시자가 저장소를 소유한 경우에만 세요.

자주 묻는 질문

GeneBe, 안전한가요?

해당하는 기본 점검 4개 중 4개를 통과했어요. 코드는 읽지 않았어요. 키나 토큰을 넣기 전에 서버가 어떤 권한을 요구하는지 확인하고, 꼭 필요한 권한만 있는 키를 쓰세요.

어떤 키나 코드가 필요한가요?

레지스트리에 필수 키가 나와 있지 않아요. 다만 처음 쓸 때 로그인을 요구하는 서버도 있어요.

내 컴퓨터에서 실행되나요, 클라우드에서 실행되나요?

제작자의 클라우드에서 실행돼요. 설치 없이 인터넷으로 연결하지만, 보내는 내용은 제작자의 서버를 거쳐요.

아직 관리되고 있나요?

GitHub 저장소는 마지막으로 19일 전 변경됐고, 최신 버전(0.1.0)은 19일 전 레지스트리에 올라왔어요.

어떤 앱에서 쓸 수 있나요?

Claude Desktop, Claude Code, Cursor, VS Code처럼 MCP를 지원하는 앱에서 쓸 수 있어요. URL로 연결되기 때문에, 원격 MCP 서버를 지원하는 앱(예: 개발자 모드의 ChatGPT)에서도 쓸 수 있어요.

대신 쓸 수 있는 건 뭐가 있나요?

같은 카테고리에는: Ruflo, Context7, Metabase

대안

같은 카테고리에서 다른 제작자가 만든 서버예요. 스타 순으로 정렬했어요.

카드 보는 법:↓ 주간 다운로드i★ GitHub 스타i세 기둥: 리뷰 · 점검 · 사용 정도i업데이트 = 최신 버전을 레지스트리에 공개한 날i

Ruflo

Agent teams, swarms, memory and hooks for Claude Code and Codex, served over MCP.

제작자: ruvnet널리 사용됨↓ 7.4만/주★ 8.1만오늘 업데이트

내 컴퓨터에서 실행

설치

Context7

Up-to-date docs for AI agents

제작자: upstash널리 사용됨↓ 125만/주★ 6.4만어제 업데이트

컴퓨터 또는 클라우드

설치

Metabase

Lets AI clients search, explore, query, and visualize data in a Metabase instance.

제작자: metabase널리 사용됨★ 5만6개월 전 업데이트

클라우드에서 실행

설치

제작자의 README

README 열기

제작자의 저장소에서 쓰인 그대로 가져왔어요. PopNx MCP가 검토하거나 보증한 내용이 아니에요. HTML, 이미지, 스크립트는 제거했어요. 링크를 누르면 이 사이트를 벗어나요.

🧬 GeneBe MCP

Give your AI assistant real variant-interpretation data instead of guesses.

Annotate and classify human genetic variants (ACMG, gnomAD, ClinVar, in-silico predictors) from Claude, Cursor, VS Code and any other MCP client, powered by GeneBe.

https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Why

Language models are bad at remembering the clinical status of a specific variant. They sound confident and are often wrong. GeneBe MCP lets the assistant look the variant up and answer from data: a transparent, points-based ACMG classification with every criterion explained, together with population frequencies, predictor scores, ClinVar and transcript consequences.

*"Is NM_005577.4:c.4195A>C benign?"*

*"What is chr6-160585140-T-G? Explain why it is classified that way."*

*"Convert rs41272110 to hg38 and list its consequences on each transcript."*

For example, chr6-160585140-T-G (rs41272110, *LPA*) comes back as Benign, −9 points with criteria BA1 and BP4, plus the data behind them and a link to the GeneBe page.

What you get

Any notation in: genomic coordinates, HGVS, rsID or SPDI; hg19, hg38 and T2T supported through liftover.
Verdict you can audit: ACMG classification with points and the reasoning for each criterion, not a black-box label.
Evidence in one call: gnomAD frequencies, in-silico predictors, ClinVar, per-transcript consequences (HGVS c./p., impact), gene details with MANE Select and ClinGen gene–disease validity.
Compact answers: large lists are capped, so one call costs roughly 1–3k tokens, and every result also carries structured data that follows the tool's output schema.
Links back to GeneBe, so the human can check the source.

Connect in a minute

No sign-up, no API key. The server is remote; you only add its URL.

Claude Code

claude mcp add --transport http genebe https://mcp.genebe.net/v1/mcp

Claude (web and desktop)

Settings → Connectors → *Add custom connector*, then enter https://mcp.genebe.net/v1/mcp.

ChatGPT

Open chatgpt.com/plugins, click Add (+) → Add custom MCP, and enter https://mcp.genebe.net/v1/mcp.

Cursor

Add to ~/.cursor/mcp.json:

{ "mcpServers": { "genebe": { "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp" } } }

VS Code

Add to .vscode/mcp.json:

{ "servers": { "genebe": { "type": "http", "url": "https://mcp.genebe.net/v1/mcp" } } }

Any other client / try it with curl

Any client that supports remote MCP over Streamable HTTP works. Try it from a terminal:

curl -s -X POST https://mcp.genebe.net/v1/mcp \

-H 'Content-Type: application/json' -H 'Accept: application/json, text/event-stream' \ -d '{"jsonrpc":"2.0","id":1,"method":"tools/call","params":{"name":"annotate_variant","arguments":{"variant":"chr6-160585140-T-G"}}}'

More examples: USAGE.md.

Tools

Tool	What it does
`annotate_variant`	Start here. Any notation → ACMG verdict, points and criteria, frequencies, predictor scores, ClinVar, consequences, GeneBe links
`explain_acmg_decision_path`	Why each classification criterion applied, in plain text
`convert_variant`	HGVS / rsID / SPDI → hg38 coordinates
`get_variant_effects`	Per-transcript consequences (HGVS c./p., impact)
`get_gene`	Gene identifiers, location, MANE Select, ClinGen gene–disease validity, transcripts
`liftover_coordinate`	Positions, intervals or variants between hg19 / hg38 / t2t

The default genome build is hg38.

Trust and privacy

Read-only. No tool changes anything, anywhere.
No account, no key needed to use the hosted server.
Single variants only. No patient data, no VCF files, no samples are sent or stored.
Nothing is stored and variant input is not logged by the MCP server.
Transparent classification. Results come from GeneBe's points-based ACMG implementation; the reasoning is returned with the verdict, so you and the assistant can check it.
Open source under the MIT license; you can read exactly what the server does, or run your own copy.
Research use only. This is not a medical device and not a diagnosis. Classifications must be reviewed by a qualified specialist before any clinical use.

Roadmap

Today GeneBe MCP answers questions about single variants. We plan to grow it into a workspace your assistant can use on your own data. None of the items below is available yet, and the order may change.

Sign-in, so the assistant can act on your GeneBe account
Your own samples: view and edit sample details and annotations
Search your cohort: find a variant across your own set of samples
Upload samples from the assistant
Supervise computations: start analyses, follow their progress and read the results

Ideas or requests? Open an issue or write to us via genebe.net.

Data sources

Results combine data from GeneBe, gnomAD, ClinVar, UniProt, ClinGen and dbNSFP predictors. Please check each source's license terms before redistributing the data.

Contributing and self-hosting

Want to run your own instance or change the code? See DEVELOPMENT.md. Issues and pull requests are welcome.

Made by the GeneBe team · MIT · Research use only

GeneBe

개요

PopNx MCP의 세 기둥

할 수 있는 일

설치

설치하기 전에

어떤 앱에서 쓸 수 있나요

할 수 있는 일

기본 점검i

제작자와 저장소 일치

계속 관리되고 있음

라이선스 있음

엔드포인트 응답

OAuth로 로그인

도구 설명에 숨겨진 지시 없음

검색 및 AI 기억 카테고리의 다른 서버와 비교i

자주 묻는 질문

대안

Ruflo

Context7

Metabase

제작자의 README

🧬 GeneBe MCP

Why

What you get

Connect in a minute

Tools

Trust and privacy

Roadmap

Data sources

Contributing and self-hosting