biomedmcp

Qué puedes hacer con él

Todavía no escribimos un resumen sencillo para este. Abajo están los datos que leímos del registro.

• Conexión: Computadora o nube
• Transporte: stdio, Streamable HTTP
• Categoría: Clínicas y salud

Instalación

Elige la app de IA que usas y copia la configuración.

Necesitas

• Se ejecuta en la nubeNo hay nada que instalar; se conecta por internet
• PyPIuv de Python instalado (para el comando uvx)

¿Qué app usas?

https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "your-value"
      }
    }
  }
}

claude mcp add --transport http biomedmcp https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

claude mcp add biomedmcp --env UBI_PROFILE=your-value -- uvx biomedmcp mcp --transport stdio

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "url": "https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp"
    }
  }
}

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "your-value"
      }
    }
  }
}

{
  "servers": {
    "biomedmcp": {
      "type": "http",
      "url": "https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp"
    }
  }
}

{
  "servers": {
    "biomedmcp": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "your-value"
      }
    }
  }
}

https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

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Valores que debes completar

• UBI_PROFILE env

Esta configuración se genera a partir de la ficha del creador en el registro. Si el README dice otra cosa, sigue el README.

Qué apps pueden usarlo

Según cómo se conecta este servidor y la documentación de cada app, comprobado el 10 nov 2026.

Se conectan por internet en

ClaudeChatGPTGooseLM StudioMsty StudioCherry StudioCursorVS Code + GitHub CopilotVisual StudioWindsurf (Devin Desktop)ZedKiroClineContinueJetBrains AI AssistantClaude CodeCodex CLIGemini CLIOpenCodenodecodeWarpLibreChatOpen WebUIRaycast

Se ejecutan en tu computadora en

ClaudeGooseLM StudioMsty StudioCherry StudioCursorVS Code + GitHub CopilotVisual StudioWindsurf (Devin Desktop)ZedKiroClineContinueJetBrains AI AssistantClaude CodeCodex CLIGemini CLIOpenCodenodecodeWarpLibreChatRaycast

Todas las apps, con ventajas y desventajas →

Qué puede hacer

Nombres y descripciones de las herramientas tal como los informó el servidor el 10 nov 2026. Los escribió el creador, no nosotros; los mostramos como texto sin formato.

• search_records

  Search genes, proteins, drugs, diseases, phenotypes, pathways, variants, pharmacogenomics, GWAS, diagnostics, adverse events, studies, patents or authors by text; returns IDs for get_record (variants: get_variant_evidence). Papers: search_literature. Trials: search_trials. Patent

• get_record

  Fetch one record by ID with optional evidence sections, e.g. gene expression/eqtl/diseases/druggability, drug label/safety, article fulltext, trial eligibility, protein domains/structures. Variants: get_variant_evidence. List an entity's sections with get_capabilities(entity=...)

• search_literature

  Search papers across PubMed, Europe PMC, PubTator and LitSense with date, author, journal, article-type and open-access filters. Deduplicates across sources and reports each source's outcome. Read abstracts or full text with get_record(entity=article). e.g. {"query":"PCSK9 LDL ch

• search_trials

  Search clinical trials (ClinicalTrials.gov, NCI) by condition, intervention, phase and recruitment status. Read arms, eligibility or outcomes with get_record(entity=trial). Does not assess an individual's eligibility. e.g. {"query":"familial hypercholesterolemia","filters":{"stat

• get_variant_evidence

  Get evidence for one variant (rsID, gene + protein change, HGVS or chr:pos:ref:alt). Defaults: ClinVar, gnomAD population, CIViC; add predictions (AlphaMissense), eve, cosmic, oncokb, hotspots, gwas or cbioportal. Ambiguous assembly or transcript is reported, not guessed; predict

• analyze_study

  Analyze an installed public cancer genomics study: gene_profile, mutation_cohort, survival, compare, co_occurrence, filter_cohort, top_mutated. List installed studies with get_capabilities(source=study); ubi_synthetic is invented demo data. Report sample denominators and exclusio

• resolve_entity

  Map a name, alias or ambiguous identifier to exact species-qualified IDs before joining evidence. Returns candidates when ambiguous; a provider match score alone is not identity. Skip when you already hold an exact ID. e.g. {"entity":"gene","query":"LDL receptor","species":9606}

• find_related

  List records linked to one record. gene/drug/disease: articles, trials. variant: articles, structure. article: citations, references, recommendations, authors, entities. author: articles. Record attributes are get_record sections, not relations. e.g. {"entity":"article","id":"PMI

• build_dossier

  Build a multi-section dossier in one call: verified identity, default record sections and top related papers, with citations and per-source outcomes. Workflows: target_dossier, model_input_bundle (gene), drug_review, disease_landscape, pathway_review, variant_dossier, negative_ev

• query_source

  Run a source-specific operation that other tools do not cover, e.g. ChEMBL bioactivities, Ensembl coordinates, PDB structure quality, OmniPath interactions, NCBI Datasets genomes, ncbi-records for GenBank/GEO/SRA. Read get_capabilities(source=...) for operations and params first.

• run_batch

  Run up to ten independent read calls in parallel with one quota reservation; each result keeps its own outcome. build_dossier and utilities are not batchable. e.g. {"calls":[{"operation":"get_record","arguments":{"entity":"gene","id":"PCSK9","species":9606}}]}

• get_capabilities

  List enabled sources, entity sections, dossier workflows and source operations with exact parameter schemas. Narrow with source or entity; diagnose=true probes source health. Examples: biomedmcp://guide. e.g. {}

• get_quota

  Show remaining research allowance and reset times; signed-in accounts get higher limits. e.g. {}

Revisiones básicasi

Revisamos información que cualquiera puede ver; no hemos leído el código. Las revisiones que no aplican no se cuentan. · Revisado el 11 nov 2026

• ✓ Superada

  El creador coincide con el repo

  El nombre en el registro se verificó con la cuenta de GitHub unibio-intelligence, dueña del repo

• ✓ Superada

  Sigue en mantenimiento

  Último cambio de código: anteayer

• … Aún sin revisar

  Tiene licencia

  Todavía no hemos leído este repo en GitHub

• ✓ Superada

  El endpoint responde

  Respondió en 250 ms (HTTP 200)

• – No aplica

  Inicio de sesión con OAuth

  No hace falta iniciar sesión

• ✓ Superada

  Sin instrucciones ocultas en las descripciones de herramientas

  Leímos 13 descripciones de herramientas y no encontramos instrucciones ocultas para la IA

Comparado con otros en Clínicas y saludi

• Más estrellas que el 76% de los otros 1067 servidores de esta categoría
• Publicado en el registro más recientemente que el 90% de los otros 1067 servidores de esta categoría
• Revisiones básicas iguales o mejores que el 100% de los otros 1067 servidores de esta categoría

Comparado con todos los servidores activos de esta categoría en el registro. Las estrellas solo cuentan cuando quien lo publica es dueño del repo.

Alternativas

Servidores de la misma categoría hechos por otros creadores, ordenados por estrellas.

Cómo leer una tarjeta:↓ Descargas por semanai★ Estrellas de GitHubiTres pilares: reseñas · revisiones · usoiActualizado = fecha en que se publicó la última versión en el registroi

README del creador

python -m pip install biomedmcp==0.2.5

UBI_PROFILE=local biomedmcp get_record '{"entity":"gene","id":"LDLR","species":9606,"sections":["expression"]}'

<!-- public-call-examples:end -->

UBI_PROFILE=local biomedmcp-server --transport http --host 127.0.0.1 --port 8000