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PopNx MCPAIを使う人のためのMCPサーバー · やさしい言葉で解説
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Hydroxyl

作者：trebeljahrバージョン 0.1.0i★ –iパソコンで動く
レジストリ名io.github.trebeljahr/hydroxyl

インストール

概要

作者による説明（英語の原文）

Local stdio MCP server: publication figures, structure checks and conversions for AI assistants

PopNx MCPの3つの柱

この3つを1つのスコアにまとめることはしません。意見、測定、人気はそれぞれ別のものだからです。

できること

このサーバーのやさしい解説はまだ書いていません。以下はレジストリから読み取った事実です。

  • 接続方法: パソコンで動く
  • トランスポート: stdio
  • カテゴリ: その他

インストール

使っているAIアプリを選んで、設定をコピーしてください。

インストールの前に

  • 基本チェック：1項目中1項目に合格
  • あなたのパソコンで、あなたのユーザーと同じ権限（ファイル、ネットワーク、アプリ）で動きます。
  • 自分で入力するもの： HYDROXYL_EDITOR_URL

必要なもの

  • npmNode.jsのインストール（npxコマンドに必要）

どのアプリを使っていますか？

上でアプリを選んでください。選んだアプリを覚えておくので、次からはボタンに「…にインストール」と表示されます。

Claude Desktop → Settings → Developer → Edit Config を開き、claude_desktop_config.json にこれを貼り付けます

{
  "mcpServers": {
    "hydroxyl": {
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "hydroxyl-mcp"
      ],
      "env": {
        "HYDROXYL_EDITOR_URL": "your-value"
      }
    }
  }
}

ターミナルでこれを実行します

claude mcp add hydroxyl --env HYDROXYL_EDITOR_URL=your-value -- npx -y hydroxyl-mcp

動かす前に、空欄の値を入力してください。

Cursorで開く

または、設定を自分でコピーする

プロジェクトの .cursor/mcp.json、または ~/.cursor/mcp.json に貼り付けます

{
  "mcpServers": {
    "hydroxyl": {
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "hydroxyl-mcp"
      ],
      "env": {
        "HYDROXYL_EDITOR_URL": "your-value"
      }
    }
  }
}

ブラウザがアプリを開いてよいか確認し、そのあとアプリが設定を表示して確認を求めます。キーの値は空欄のままなので、自分で入力してください。

VS Codeで開く

または、設定を自分でコピーする

プロジェクトの .vscode/mcp.json に貼り付けます

{
  "servers": {
    "hydroxyl": {
      "type": "stdio",
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "hydroxyl-mcp"
      ],
      "env": {
        "HYDROXYL_EDITOR_URL": "your-value"
      }
    }
  }
}

ブラウザがアプリを開いてよいか確認し、そのあとアプリが設定を表示して確認を求めます。キーの値は空欄のままなので、自分で入力してください。

これはパソコンで動くサーバーですが、ChatGPTがつなげるのはインターネット上のサーバーだけです。ほかのアプリを選んでください。

選んだアプリは、この端末のCookieに保存されます。アカウントは不要です。

自分で入力する値

  • HYDROXYL_EDITOR_URL env
    Editor that editor_link points at (default https://hydroxyl.app/editor/)

この設定は、作者のレジストリ登録情報から作成しています。READMEと違う場合は、READMEに従ってください。

できること

パソコンで動くサーバーです。インストールすると、ツール一覧がAIアプリに表示されます。

基本チェックi

誰でも見られる情報をチェックしており、コードは読んでいません。当てはまらない項目は数に入れていません。 · 2026年11月8日にチェック

  • ✓ 合格

    作者とリポジトリが一致

    レジストリ名は、リポジトリを所有するGitHubアカウント trebeljahr で確認済みです

  • … 未チェック

    今もメンテナンスされている

    このリポジトリはまだGitHubから読み取っていません

  • … 未チェック

    ライセンスがある

    このリポジトリはまだGitHubから読み取っていません

  • – 対象外

    エンドポイントが応答する

    これはパソコンで動くため、インターネット上のエンドポイントはありません

  • – 対象外

    OAuthでサインイン

    パソコンで動き、代わりにローカルの設定を使います

  • … 未チェック

    ツールの説明に隠れた指示がない

    パソコンで動くサーバーです。ツール一覧を読み取れるのは、インターネット上のエンドポイントがある場合だけです

その他のほかのサーバーとの比較i

  • このカテゴリのほかの18436件のうち0%よりスターが多い
  • このカテゴリのほかの18436件のうち60%より最近レジストリに公開
  • 基本チェックの結果が、このカテゴリのほかの18436件のうち100%と同じかそれ以上

レジストリでこのカテゴリにある有効なすべてのサーバーと比較しています。スターは、公開者がリポジトリの所有者である場合だけ数えます。

よくある質問

Hydroxylは安全ですか？

当てはまる基本チェック1項目のうち1項目に合格しました。コードは読んでいません。キーやトークンを追加する前に、サーバーがどんなアクセスを求めているかを確認し、必要な権限だけを持つキーを使ってください。

どんなキーやコードが必要ですか？

レジストリには必須のキーは載っていません。ただし、最初に使うときにサインインを求めるサーバーもあります。

パソコンで動きますか、それともクラウドですか？

あなたのパソコンで動きます。必要なときにAIアプリが起動し、データは作者のサーバーを通りません（サーバー自体がオンラインサービスを呼び出す場合を除きます）。

今もメンテナンスされていますか？

GitHubリポジトリの最終更新は–、最新バージョン（0.1.0）がレジストリに届いたのは31 日前です。

どのアプリで使えますか？

Claude Desktop、Claude Code、Cursor、VS CodeなどのMCP対応アプリで使えます。パソコンにNode.jsも必要です。

代わりに使えるものは？

同じカテゴリには：Spec Driven Development, Remote Desktop Commander, Tethered Trust

代わりの候補

同じカテゴリで、ほかの作者が作ったサーバー。スターの多い順。

カードの見方：★ GitHubスターi3つの柱：レビュー · チェック · 利用状況i更新＝最新バージョンをレジストリに公開した日i

Remote Desktop Commander

作者：desktop-commander

Remote Desktop Commander: use files, terminal and processes on your own computers from any AI app.

クラウドで動く★ 2113 日前更新
インストール

Tethered Trust

作者：tetheredtrust.com

Fit, compatibility and recall checks for AI agents before they buy: verdicts, evidence, receipts.

クラウドで動く今日更新
インストール

作者のREADME

READMEを開く

作者のリポジトリから書かれたとおりにコピーしたものです。PopNx MCPは内容を確認・推奨していません。HTML、画像、スクリプトは取り除いています。リンクはこのサイトの外へ移動します。

hydroxyl-mcp

hydroxyl-mcp is a local Model Context Protocol server. An assistant such as Claude Desktop can use it to draw a structure as a journal figure, check it, and convert it. It runs on your machine over stdio and makes no network calls. Structures you send go to your assistant's provider, never to us.

It has five tools:

ToolInputOutput
render_figurea structure; views; width (single, double or cm); png or svgthe figure, its printed size, its label size, and a warning for text under 8 pt
check_structurea structurethe valence and drawing issues the editor flags, each with its one-click fixes
describea structureformula, molecular weight, exact mass, net charge, CIP labels
converta structurea molfile or a canonical SMILES
editor_linka structurea link that opens the structure in the editor

A structure is one of smiles, molfile, or name (a compound from the editor's insert box, such as caffeine).

Add it to your MCP client; npx fetches the hydroxyl-mcp package from npm (Node.js 22 or newer). For Claude Desktop, edit claude_desktop_config.json (Settings → Developer → Edit Config) and restart the app:

{

"mcpServers": { "hydroxyl": { "command": "npx", "args": ["-y", "hydroxyl-mcp"] } } }

Other clients that start stdio servers take the same command and arguments. For Claude Code:

claude mcp add hydroxyl -- npx -y hydroxyl-mcp

editor_link points at https://hydroxyl.app/editor/. Set HYDROXYL_EDITOR_URL in the server's environment to link to a local or self-hosted editor instead.

The editor itself is at hydroxyl.app; source at github.com/trebeljahr/hydroxyl.app.

Licence

MIT. The package depends on RDKit (BSD-3-Clause) and resvg-wasm (MPL-2.0), and ships the Arimo font (OFL-1.1, text in dist/arimo-OFL.txt).

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