FHIR MCP Server

Name: FHIR MCP Server
Author: wso2

제작자: wso2버전 0.11.0i★ 137i내 컴퓨터에서 실행

레지스트리 이름io.github.wso2/fhir-mcp-server

설치

개요

제작자가 쓴 설명(영어 원문)

MCP server providing seamless access to FHIR APIs for AI tools and healthcare applications

PopNx MCP의 세 기둥

이 세 가지는 절대 하나의 점수로 합치지 않아요. 의견, 측정, 인기는 서로 다른 것이니까요.

사용자 의견i아직 리뷰가 없어요리뷰는 다음 단계에서 계정 기능과 함께 열려요
우리의 기본 점검i3개 중 3개 통과공개된 정보로 점검했으며, 코드는 아직 스캔하지 않았어요
사용 정도i성장 중↓ 823/주 · ★ 137

할 수 있는 일

이 서버는 아직 쉬운 말로 된 요약을 쓰지 못했어요. 아래는 레지스트리에서 읽어 온 사실이에요.

연결 방식: 내 컴퓨터에서 실행
전송 방식: stdio
카테고리: 클리닉 및 건강
입력해야 할 값: FHIR_SERVER_BASE_URL

설치

쓰고 있는 AI 앱을 고른 다음 설정을 복사하세요.

설치하기 전에

기본 점검: 3개 중 3개 통과
내 컴퓨터에서 내 사용자 계정의 권한(파일, 네트워크, 앱)으로 실행돼요.
직접 입력할 값: FHIR_SERVER_BASE_URL

필요한 것

PyPIPython의 uv 설치(uvx 명령어용)

어떤 앱을 쓰세요?

ClaudeClaude CodeCursorVS CodeChatGPT

위에서 앱을 고르세요. 기억해 두었다가 다음부터는 버튼에 “…에 설치”라고 표시해요.

Claude Desktop → Settings → Developer → Edit Config를 열고 claude_desktop_config.json에 이 내용을 붙여 넣으세요

{
  "mcpServers": {
    "fhir": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "fhir-mcp-server"
      ],
      "env": {
        "FHIR_SERVER_BASE_URL": "your-value"
      }
    }
  }
}

터미널에서 이 명령어를 실행하세요

claude mcp add fhir --env FHIR_SERVER_BASE_URL=your-value -- uvx fhir-mcp-server

실행하기 전에 빈 값을 채워 주세요.

Cursor에서 열기

또는 설정을 직접 복사하기

프로젝트의 .cursor/mcp.json 또는 ~/.cursor/mcp.json에 붙여 넣으세요

{
  "mcpServers": {
    "fhir": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "fhir-mcp-server"
      ],
      "env": {
        "FHIR_SERVER_BASE_URL": "your-value"
      }
    }
  }
}

브라우저가 앱을 열지 물어본 다음, 앱이 설정을 보여 주고 확인을 요청해요. 키 값은 비워 두니 직접 입력하세요.

VS Code에서 열기

또는 설정을 직접 복사하기

프로젝트의 .vscode/mcp.json에 붙여 넣으세요

{
  "servers": {
    "fhir": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "fhir-mcp-server"
      ],
      "env": {
        "FHIR_SERVER_BASE_URL": "your-value"
      }
    }
  }
}

브라우저가 앱을 열지 물어본 다음, 앱이 설정을 보여 주고 확인을 요청해요. 키 값은 비워 두니 직접 입력하세요.

이 서버는 내 컴퓨터에서 실행되는데, ChatGPT는 인터넷에 있는 서버에만 연결할 수 있어요. 다른 앱을 고르세요.

선택한 앱은 이 기기의 쿠키에만 저장돼요. 계정은 필요 없어요.

직접 입력할 값

FHIR_SERVER_BASE_URL 필수 env
Base URL of the FHIR Server (eg: https://hapi.fhir.org/baseR5)

이 설정은 제작자의 레지스트리 정보로 만들었어요. README와 다르면 README를 따르세요.

할 수 있는 일

내 컴퓨터에서 실행돼요. 설치하면 AI 앱에 도구 목록이 나타나요.

기본 점검i

누구나 볼 수 있는 정보를 점검했고, 코드는 읽지 않았어요. 해당하지 않는 항목은 개수에서 뺐어요. · 2026년 11월 8일 점검

✓ 통과
제작자와 저장소 일치
레지스트리 이름이 GitHub 계정 wso2 기준으로 확인되었고, 이 계정이 저장소를 소유하고 있어요
✓ 통과
계속 관리되고 있음
코드 마지막 변경: 6일 전
✓ 통과
라이선스 있음
Apache-2.0 사용
– 해당 없음
엔드포인트 응답
내 컴퓨터에서 실행되는 서버라 인터넷 엔드포인트가 없어요
– 해당 없음
OAuth로 로그인
내 컴퓨터에서 실행되며, 대신 로컬 설정을 사용해요
… 아직 점검 안 함
도구 설명에 숨겨진 지시 없음
내 컴퓨터에서 실행돼요. 도구 목록은 인터넷 엔드포인트가 있는 서버에서만 읽을 수 있어요

클리닉 및 건강 카테고리의 다른 서버와 비교i

이 카테고리의 다른 서버 1027개 중 100%보다 스타가 많아요
이 카테고리의 다른 서버 1027개 중 71%보다 최근에 레지스트리에 공개됐어요
기본 점검 결과가 이 카테고리의 다른 서버 1027개 중 100%와 같거나 더 좋아요

레지스트리에서 이 카테고리의 활성 서버 전체와 비교했어요. 스타는 게시자가 저장소를 소유한 경우에만 세요.

자주 묻는 질문

FHIR MCP Server, 안전한가요?

해당하는 기본 점검 3개 중 3개를 통과했어요. 코드는 읽지 않았어요. 키나 토큰을 넣기 전에 서버가 어떤 권한을 요구하는지 확인하고, 꼭 필요한 권한만 있는 키를 쓰세요.

어떤 키나 코드가 필요한가요?

입력해야 할 값: FHIR_SERVER_BASE_URL

내 컴퓨터에서 실행되나요, 클라우드에서 실행되나요?

내 컴퓨터에서 실행돼요. AI 앱이 필요할 때 실행하고, 데이터는 제작자의 서버를 거치지 않아요(서버 자체가 온라인 서비스를 호출하는 경우는 제외).

아직 관리되고 있나요?

GitHub 저장소는 마지막으로 6일 전 변경됐고, 최신 버전(0.11.0)은 10일 전 레지스트리에 올라왔어요.

어떤 앱에서 쓸 수 있나요?

Claude Desktop, Claude Code, Cursor, VS Code처럼 MCP를 지원하는 앱에서 쓸 수 있어요. 내 컴퓨터에 Python (uv)도 있어야 해요.

대신 쓸 수 있는 건 뭐가 있나요?

같은 카테고리에는: Mirobody, Google Health MCP, Langcare MCP FHIR

대안

같은 카테고리에서 다른 제작자가 만든 서버예요. 스타 순으로 정렬했어요.

카드 보는 법:↓ 주간 다운로드i★ GitHub 스타i세 기둥: 리뷰 · 점검 · 사용 정도i업데이트 = 최신 버전을 레지스트리에 공개한 날i

Mirobody

Lab results to LOINC codes and UCUM units, symptoms and diagnoses to ICPC-3. Offline, no API key.

제작자: thetahealth성장 중↓ 290/주★ 1.4천어제 업데이트

내 컴퓨터에서 실행✓ thetahealth.ai

설치

Google Health MCP

Privacy-first unofficial Google Health API v4 MCP server for health, sleep, activity, HR agents

제작자: davidmosiah성장 중↓ 1천/주★ 794개월 전 업데이트

내 컴퓨터에서 실행

설치

Langcare MCP FHIR

An MCP FHIR server written in Go for EMR systems like Epic and Cerner

제작자: langcare초기↓ 297/주★ 709개월 전 업데이트

내 컴퓨터에서 실행

설치

제작자의 README

README 열기

제작자의 저장소에서 쓰인 그대로 가져왔어요. PopNx MCP가 검토하거나 보증한 내용이 아니에요. HTML, 이미지, 스크립트는 제거했어요. 링크를 누르면 이 사이트를 벗어나요.

Model Context Protocol (MCP) Server for Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) APIs

Model Context Protocol (MCP) Server for Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) APIs
Table of Contents
Overview
Demo
Demo with HAPI FHIR server
Demo with EPIC Sandbox
Core Features
Prerequisites
Installation
Installing using PyPI Package
Installing from Source
Installing using Docker
Running the MCP Server with Docker
Using Docker Compose with WSO2 FHIR Server
Configuring any FHIR Server
Integration with MCP Clients
VS Code
Claude Desktop
MCP Inspector
Configuration
CLI Options
Environment Variables
Tools
Development \& Testing
Installing Development Dependencies
Running Tests

Overview

The FHIR MCP Server is a Model Context Protocol (MCP) server that provides seamless integration with FHIR APIs. Designed for developers, integrators, and healthcare innovators, this server acts as a bridge between modern AI/LLM tools and healthcare data, making it easy to search, retrieve, and analyze clinical information.

Demo

Demo with HAPI FHIR server

This video showcases the MCP server's functionality when connected to a public HAPI FHIR server. This example showcases direct interaction with an open FHIR server that does not require an authorization flow.

https://github.com/user-attachments/assets/cc6ac87e-8329-4da4-a090-2d76564a3abf

Demo with EPIC Sandbox

This video showcases the MCP server's capabilities within the Epic EHR ecosystem. It demonstrates the complete OAuth 2.0 Authorization Code Grant flow.

https://github.com/user-attachments/assets/96b433f1-3e53-4564-8466-65ab48d521de

Core Features

MCP-compatible transport: Serves FHIR via stdio, SSE, or streamable HTTP

SMART-on-FHIR based authentication support: Securely authenticate with FHIR servers and clients

Response Filtering using FHIRPath: Filter resources and bundles returned by read and search operations using custom FHIRPath expressions to retrieve only the fields needed for the task, reducing payload sizes.

Tool integration: Integratable with any MCP client such as VS Code, Claude Desktop, and MCP Inspector

Prerequisites

Python 3.8+
uv (for dependency management)
An accessible FHIR API server.

Installation

You can use the FHIR MCP Server by installing our Python package, or by cloning this repository.

Installing using PyPI Package

Configure Environment Variables:

To run the server, you must set FHIR_SERVER_BASE_URL.

To enable authorization: Set FHIR_SERVER_BASE_URL, FHIR_SERVER_CLIENT_ID, FHIR_SERVER_CLIENT_SECRET, and FHIR_SERVER_SCOPES. Authorization is enabled by default.
To disable authorization: Set FHIR_SERVER_DISABLE_AUTHORIZATION to True.

By default, the MCP server runs on [http://localhost:8000](http://localhost:8000), and you can customize the host and port using FHIR_MCP_HOST and FHIR_MCP_PORT.

You can set these by exporting them as environment variables like below or by creating a .env file (referencing .env.example).

`bash export FHIR_SERVER_BASE_URL="" export FHIR_SERVER_CLIENT_ID="" export FHIR_SERVER_CLIENT_SECRET="" export FHIR_SERVER_SCOPES=""

export FHIR_MCP_HOST="localhost" export FHIR_MCP_PORT="8000" `

Install the PyPI package and run the server

bash uvx fhir-mcp-server

Installing from Source

Clone the repository: bash git clone cd

Create a virtual environment and install dependencies: bash uv venv source .venv/bin/activate uv pip sync requirements.txt Or with pip: bash python -m venv .venv source .venv/bin/activate pip install -r requirements.txt

Configure Environment Variables: Copy the example file and customize if needed: bash cp .env.example .env

Run the server: bash uv run fhir-mcp-server

Installing using Docker

Running the MCP Server with Docker

You can run the MCP server using Docker for a consistent, isolated environment.

Note on Authorization: When running the MCP server locally via Docker or Docker Compose, authorization should be disabled by setting the environment variable, FHIR_SERVER_DISABLE_AUTHORIZATION=True . This would be fixed in the future releases.

Build the Docker Image or pull the docker image from the container registry:

Build from source: bash docker build -t fhir-mcp-server .
Pull from GitHub Container Registry: bash docker pull ghcr.io/wso2/fhir-mcp-server:latest latest is built from the main branch. To use a release, pull its version tag instead, for example ghcr.io/wso2/fhir-mcp-server:0.11.0.

Configure Environment Variables

Copy the example environment file and edit as needed:

`bash cp .env.example .env

Edit .env to set your FHIR server, client credentials, etc.

Alternatively, you can pass environment variables directly with -e flags or use Docker secrets for sensitive values. See the Configuration section for details on available environment variables.

Run the Container

bash docker run --env-file .env -p 8000:8000 ghcr.io/wso2/fhir-mcp-server:latest

This will start the server and expose it on port 8000. Adjust the port mapping as needed.

Using Docker Compose with WSO2 FHIR Server

For a quick setup that includes both the FHIR MCP server and the WSO2 FHIR Server (with PostgreSQL), use the provided docker-compose.yml. This sets up an instant development environment for testing FHIR operations.

Prerequisites:

Docker and Docker Compose installed.

Set the Database Credentials:

Copy the example environment file and set DB_PASSWORD in .env. If you already have a .env, add the DB_USER, DB_PASSWORD and DB_NAME lines from .env.example to it instead.

   cp .env.example .env

Docker Compose reads .env automatically. DB_USER and DB_NAME default to postgres if not set. .env is excluded from Git; use a secrets manager for production deployments.

Run the Stack:

   docker compose up -d

This command will:

Start a PostgreSQL database container.
Launch the FHIR Server (connected to PostgreSQL) listening on http://localhost:8080/fhir/r4.
Build and run the FHIR MCP server container listening on http://localhost:8000, with FHIR_SERVER_BASE_URL set to http://wso2-fhir-server:8080/fhir/r4.

Access the Services:

FHIR MCP Server: http://localhost:8000
FHIR Server: http://localhost:8080/fhir/r4
To stop run docker compose down.

docker compose down removes the database data; use docker compose stop to keep it between runs.

Configure Additional Environment Variables:

If you need to customize OAuth or other settings, adjust the env variables in the docker-compose.yml. The compose file sets basic configuration; refer to the Configuration section for full options.

Configuring any FHIR Server

To use a different FHIR server, run the FHIR MCP server container with FHIR_SERVER_BASE_URL pointing to that server. The example below uses the HAPI FHIR server. Stop the default stack first if it's already running (docker compose down), as both use ports 8000 and 8080.

Create a network and start the HAPI FHIR server:

   docker network create fhir-network

docker run -d --name hapi-fhir-server --network fhir-network -p 127.0.0.1:8080:8080 docker.io/hapiproject/hapi:v8.4.0-2

HAPI FHIR listens on http://localhost:8080/fhir. This uses its built-in database, so data is lost when the container is removed.

Build and run the FHIR MCP server container:

   docker build -t fhir-mcp-server .

docker run -d --name fhir-mcp-server-hapi --network fhir-network -p 127.0.0.1:8000:8000 -e FHIR_SERVER_BASE_URL=http://hapi-fhir-server:8080/fhir -e FHIR_MCP_HOST=0.0.0.0 -e FHIR_SERVER_DISABLE_AUTHORIZATION=True fhir-mcp-server

The FHIR MCP server listens on http://localhost:8000.

Stop and clean up:

   docker rm -f fhir-mcp-server-hapi hapi-fhir-server

docker network rm fhir-network

For any other FHIR server, set FHIR_SERVER_BASE_URL to its base URL. If the FHIR server runs on your host rather than in Docker, use http://host.docker.internal: /... instead of localhost. On Linux, also add --add-host=host.docker.internal:host-gateway to the docker run command, and make sure the FHIR server listens on an address reachable from containers (for example 0.0.0.0, not only 127.0.0.1).

Integration with MCP Clients

The FHIR MCP Server is designed for seamless integration with various MCP clients.

VS Code

Add the following JSON block to your MCP configuration file in VS Code (> V1.104). You can do this by pressing Ctrl + Shift + P and typing MCP: Open User Configuration.

Streamable HTTP STDIO SSE

"servers": {

"fhir": { "type": "http", "url": "http://localhost:8000/mcp", } }

</td>

"servers": {

"fhir": { "command": "uv", "args": [ "-

앞부분만 보여 드려요. 나머지는 저장소에서 읽어 보세요

FHIR MCP Server

개요

PopNx MCP의 세 기둥

할 수 있는 일

설치

설치하기 전에

직접 입력할 값

할 수 있는 일

기본 점검i

제작자와 저장소 일치

계속 관리되고 있음

라이선스 있음

엔드포인트 응답

OAuth로 로그인

도구 설명에 숨겨진 지시 없음

클리닉 및 건강 카테고리의 다른 서버와 비교i

자주 묻는 질문

대안

Mirobody

Google Health MCP

Langcare MCP FHIR

제작자의 README

Model Context Protocol (MCP) Server for Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) APIs

Table of Contents

Overview

Demo

Demo with HAPI FHIR server

Demo with EPIC Sandbox

Core Features

Prerequisites

Installation

Installing using PyPI Package

Installing from Source

Installing using Docker

Running the MCP Server with Docker

Edit .env to set your FHIR server, client credentials, etc.

Using Docker Compose with WSO2 FHIR Server

Configuring any FHIR Server

Integration with MCP Clients

VS Code