askBrassica

ติดตั้ง

เลือกโปรแกรม AI ที่คุณใช้ แล้วคัดลอกค่าตั้งไปวาง

ผลตรวจผ่าน 2/3 · สิ่งที่คุณถามผ่านเซิร์ฟเวอร์ของผู้ทำ (askbrassica.plantdatabases.org) · ✓ ตรวจคำสั่งแล้ว 14 พ.ย. 2569

claude mcp add --transport http --scope user askbrassica https://askbrassica.plantdatabases.org/mcp

{
  "mcpServers": {
    "askbrassica": {
      "url": "https://askbrassica.plantdatabases.org/mcp"
    }
  }
}

{
  "servers": {
    "askbrassica": {
      "type": "http",
      "url": "https://askbrassica.plantdatabases.org/mcp"
    }
  }
}

ใช้กับโปรแกรมไหนได้

ดูจากแบบการต่อของ server ตัวนี้ และเอกสารของผู้ทำโปรแกรมแต่ละตัว ตรวจเมื่อ 10 พ.ย. 2569

ต่อผ่านคลาวด์ได้ใน

ClaudeChatGPTGooseLM StudioMsty StudioCherry StudioCursorVS Code + GitHub CopilotVisual StudioWindsurf (Devin Desktop)ZedKiroClineContinueJetBrains AI AssistantClaude CodeCodex CLIGemini CLIOpenCodenodecodeWarpLibreChatOpen WebUIRaycast

ดูโปรแกรมทั้งหมดพร้อมข้อดีข้อเสีย →

ทำอะไรได้บ้าง

ชื่อและคำอธิบายเครื่องมือตามที่ server ตอบมาเมื่อ 14 พ.ย. 2569 ผู้ทำเป็นคนเขียน ไม่ใช่เรา แสดงเป็นข้อความล้วน

• search_data

  Full-text search across all askBrassica resources (genes, germplasm, genotyping datasets, files). Filters (exact values): database e.g. 'Ensembl Plants', 'Brassica Genome (brassicagenome.net)', 'GBIF genebank accessions'; entry_type e.g. 'Gene annotation', 'Germplasm', 'Genotypin

• find_germplasm

  Find Brassica genebank accessions by accession number or name: Brassica, Camelina, Sinapis and Raphanus accessions from GBIF, with the holding genebank (FAO WIEWS code) and accession number; mostly Svalbard Global Seed Vault safety duplicates. Passport data are minimal (no traits

• data_sources

  What askBrassica currently indexes: record counts per database and data type, and data versions.

• find_gene

  Look up a gene by Ensembl gene ID or gene name/symbol in Ensembl Plants: species, location, assembly, biotype, description and link. Names are searched in all of: brassica_napus, brassica_rapa (Chiifu), brassica_rapa_ro18 (R-o-18), brassica_rapa_z1 (Z1), brassica_oleracea, brassi

• genes_in_region

  Genes overlapping a region of one Ensembl Plants genome (max 5 Mb). species is an Ensembl name, e.g. 'brassica_rapa' (chromosomes A01-A10) or 'brassica_oleracea' (C1-C9); chromosome names as in that assembly. Brassica napus is scaffold-level in Ensembl Plants (Darmor-bzh v4.1), s

• orthologues

  Orthologues of a gene from Ensembl Plants Compara (gene trees across plant genomes), e.g. the Brassica copies of an Arabidopsis gene. gene: Ensembl ID or name; target_species: Ensembl name to restrict to (e.g. 'brassica_napus'). Returns orthologue IDs, species, relationship (one2

• pangenome_gene

  Presence/absence of a gene across the accessions of a crop pangenome: how many accessions carry it, core or variable, which accessions lack it (and which carry it, if fewer), location, description and genome browser link. gene: a pangenome gene ID, a B. napus Ensembl (Darmor-bzh

• pangenome_region

  Pangenome genes in a region (max 5 Mb) with how many accessions carry each, e.g. to see which genes in a QTL interval show presence/absence variation. chromosome like 'A01' or 'chrA01'. Datasets: 'bnapus' = B. napus pangenome (Darmor-bzh v8.1 plus 52 accessions, 94,013 genes; IDs

• pangenome_compare

  Genes whose presence frequency differs most between two groups of pangenome accessions (accession names from pangenome_accessions, 'form: ' selectors such as 'form:Synthetic' or 'form:cauliflower', or ['all']). min_diff is the minimum absolute frequency difference (0-1); positive

• pangenome_accessions

  Accessions in a crop pangenome with their metadata (form, genotype code, synthetic parents where known) and the number of genes each carries and lacks. dataset defaults to the first one. Datasets: 'bnapus' = B. napus pangenome (Darmor-bzh v8.1 plus 52 accessions, 94,013 genes; ID

• arabidopsis_function

  Function of a gene through its Arabidopsis thaliana orthologue(s): Ensembl Plants Compara orthologues, then UniProtKB curated function, protein and gene names, mutant (disruption) phenotype, subcellular location and GO terms. gene: an Ensembl gene ID or name of any crop genome he

• resistance_loci

  Curated resistance loci of Brassica crops: blackleg (Leptosphaeria maculans: Rlm1-Rlm14, LepR1-3, RlmS), clubroot (Plasmodiophora brassicae: CRa, CRb, Crr1-5, Rcr1-10, PbBa...), and in Brassica vegetables downy mildew (BraDM, Pp523, BoDMR2...), Fusarium yellows (FocBo1, Foc-Br1),

• resistance_gene_analogues

  Resistance gene analogues (RGAs) in the B. napus pangenome (1,749 genes: NBS-LRR classes TNL, CNL, RNL, NL, TN, CN, RN, NBS, TX; receptor-like kinases RLK; receptor-like proteins RLP), with presence/absence across the 53 pangenome accessions, description and location (Darmor-bzh

• bnir_gwas

  Genome-wide association peaks for B. napus traits from BnIR (HZAU): 135 traits from 10 GWAS studies (seed oil fatty acids and erucic acid, glucosinolates, oil content, flowering time, plant height, branching, silique and seed traits, cadmium, salt and other stress responses...).

• bnir_expression

  B. napus (ZS11) RNA-seq expression in TPM from BnIR: 'stress' (leaf and root time courses, 0.25-24 h, under salt, drought, osmotic, heat, cold 4 C and freezing -4 C, with controls at the same time points), 'hormone' (leaf and root, IAA, ACC, GA, ABA, trans-zeatin, JA, brassinolid

• expression_experiments

  Brassica RNA-seq experiments held by askBrassica (Expression Atlas and SRA study SRP159041 (B. napus leaf cold, heat and drought; quantified by askBrassica)): baseline (TPM by tissue / developmental stage / treatment) and differential (stress, pathogen, genotype contrasts). query

• gene_expression

  Where and when a Brassica gene is expressed, and under which treatments it changes, from Expression Atlas and SRA study SRP159041 (B. napus leaf cold, heat and drought; quantified by askBrassica). gene: Ensembl gene ID (e.g. GSBRNA2T00000001001 for B. napus, Bra000001 for B. rapa

• expression_genes

  Genes characteristic of a tissue/stage or responsive to a treatment in one Expression Atlas experiment. Baseline experiment + group (text matched to group labels, e.g. 'root', 'grain'): genes with TPM >= min_tpm in a matching group ranked by specificity = (max TPM in matching gro

• snp_lines

  Find SNP-genotyped lines in CropSNPdb by name or AGG accession (e.g. 'Westar', 'Darmor'). Returns line name, accession(s), country, pedigree, status, breeding organisation and donor. dataset: 'Brassica napus Darmor v81' (default, 459 lines), 'Brassica napus Darmor v41', 'Brassica

• snp_genotypes

  SNP genotype calls for up to 50 lines in a region (chromosome like 'A01'). Returns markers with positions and each line's call. Keep regions small (a few Mb) for many lines.

• snp_compare_lines

  Compare two lines' SNP genotypes on a chromosome (optionally a region): markers compared, identical, different, % identity and the regions where they differ (useful for pedigree/introgression questions).

• snp_haplotype_carriers

  Lines that share a reference line's SNP haplotype in a region (max 5 Mb), e.g. which genebank lines carry the Westar haplotype around a gene. Only markers polymorphic in the panel (minor allele frequency >= min_maf) are used, and a match needs calls at >= min_called of them with

• snp_markers

  SNP array markers (IDs and positions) in a region, with the total count.

• snp_phenotypes

  Field trial trait data held in CropSNPdb for this crop (T3 trials with Crop Ontology trait IDs, Australian Grains Genebank records). With no arguments, lists the available traits. Filter by line and/or trait: trait matches the exact name or any part of it (e.g. 'Height', 'grain y

• search_literature

  Search publications and preprints in Europe PMC (PubMed, PMC, bioRxiv and others). query: free text or Europe PMC syntax (e.g. 'grain size QTL 6A', 'TITLE:"pan-genome"'). gene: optional gene name or Ensembl ID; its curated synonyms and RefSeq IDs are OR-ed into the query (e.g. ge

• get_paper

  Full record for one paper: DOI (10.xxxx/..), PMID (digits) or PMCID (PMC...). Returns the abstract, open-access status and full-text links.

• brapi_germplasm_studies

  Phenotyping studies (field and glasshouse trials) with trait data for a Brassica line, live from the BrAPI nodes (currently the INRAE Brassica trials in GnpIS (rapeseed and cabbage collections), served through FAIDARE). germplasm: a cultivar or line name (matched exactly; upper/t

• brapi_observations

  Trait observations for a Brassica line from the BrAPI nodes (currently the INRAE Brassica trials in GnpIS (rapeseed and cabbage collections), served through FAIDARE), summarised per study and variable: n, mean, min, max (numeric values) or the distinct values, season and location

• gene_pathways

  Plant Reactome metabolic and signalling pathways of a gene (Gramene), with the top-level category and a link to the pathway diagram. gene: an Ensembl Plants gene ID or a gene name/symbol. Pathways are projected from rice by orthology, so say they are inferred. Use pathway_genes f

• pathway_genes

  Genes in a Plant Reactome pathway: pathway is a name or words from it ('jasmonic acid biosynthesis', 'gibberellin', 'flavonoid') or a stable ID (R-TAE-1119332). species: a species name as Plant Reactome writes it ('Triticum aestivum', 'Brassica napus', 'Glycine max'); default all

• trait_hits

  Trait-associated positions across the genome for a chromosome overview: GWAS marker-trait associations and peaks, named trait genes and mapped trait loci held by this site, with chromosome sizes, each with a genome browser link where the assembly is loaded. trait: words to match

• brassica_gene_view

  Interactive gene view for one Brassica gene: a relationship map of its orthologues in B. rapa, B. oleracea, B. juncea, Camelina and Arabidopsis, Arabidopsis function, presence/absence across the B. napus (53 accessions) or B. oleracea (10) pangenome by crop form, BnIR stress resp

ผลตรวจเบื้องต้นi

เราตรวจจากข้อมูลที่ใครก็เปิดดูได้ ยังไม่ได้อ่านโค้ด ข้อที่ไม่เกี่ยวกับตัวนี้ไม่นับในตัวหาร · ตรวจเมื่อ 14 พ.ย. 2569

• ! ควรระวัง

  ตัวตนผู้ทำตรงกับ repo

  ทะเบียนไม่ได้ระบุ repo ของโค้ด จึงยังจับคู่ผู้ลงทะเบียน (plantdatabases.org) กับโค้ดไม่ได้

• … ยังไม่ตรวจ

  ยังมีคนดูแล

  ยังไม่ได้อ่านข้อมูล repo จาก GitHub

• … ยังไม่ตรวจ

  มีสัญญาอนุญาต (license)

  ยังไม่ได้อ่านข้อมูล repo จาก GitHub

• ✓ ผ่าน

  endpoint ตอบ

  ตอบกลับใน 798 ms (HTTP 200)

• – ไม่เกี่ยว

  ล็อกอินแบบ OAuth

  ไม่ต้องล็อกอิน

• ✓ ผ่าน

  คำอธิบายเครื่องมือไม่มีคำสั่งแอบแฝง

  อ่านคำอธิบายเครื่องมือ 32 ตัวแล้ว ไม่พบคำสั่งแอบแฝงถึง AI

รีวิวจากผู้ใช้

ยังไม่มีรีวิว

เข้าสู่ระบบด้วย Google เพื่อเขียนรีวิว

เทียบกับตัวอื่นในหมวด ค้นข้อมูลและความจำของ AIi

• ดาวมากกว่า 0% ของอีก 6096 ตัวในหมวดนี้
• ส่งรุ่นใหม่เข้า registry ล่าสุดกว่า 99% ของอีก 6096 ตัวในหมวดนี้
• ผลตรวจเบื้องต้นดีกว่าหรือเท่ากับ 50% ของอีก 6096 ตัวในหมวดนี้

เทียบกับทุก server ที่ยังใช้งานในหมวดนี้ทั้งทะเบียน ดาวนับเฉพาะเมื่อผู้ลงทะเบียนเป็นเจ้าของ repo

ตัวอื่นในหมวดเดียวกัน

server หมวดเดียวกันจากผู้ทำคนอื่น เรียงตามดาว

อ่านการ์ด:↓ ดาวน์โหลดต่อสัปดาห์i★ ดาว GitHubiสามเสา: รีวิว · ผลตรวจ · การใช้งานiอัปเดต = วันที่ส่งรุ่นล่าสุดเข้า registryi

Context7

ส่งคู่มือการใช้ไลบรารีและเฟรมเวิร์กรุ่นล่าสุดให้ AI อ่านก่อนตอบ ช่วยให้โค้ดที่ AI เขียนไม่ใช้คำสั่งเก่าที่เลิกใช้แล้ว

โดย upstash·ใช้กันมาก·↓ 1.2M/สัปดาห์·★ 64.8K·อัปเดต เมื่อวานซืน

บนเครื่องหรือคลาวด์

ติดตั้ง

Codebase Memory

Codebase knowledge graph for AI agents — 162 languages, sub-ms queries, 99% fewer tokens.

โดย DeusData·ใช้กันมาก·↓ 16.8K/สัปดาห์·★ 48.6K·อัปเดต 28 วันที่ผ่านมา

รันบนเครื่อง

ติดตั้ง

OpenSEO

Keyword research, site audits, rank tracking and AI visibility for your AI agent.

โดย every-app·ใช้กันมาก·★ 27.6K·อัปเดต วันนี้

รันบนคลาวด์✓ everyapp.com

วิธีต่อ

README จากผู้ทำ

ไม่พบ README ใน repo