ต้นแบบ · รุ่นทดลอง: มีทุก server ในทะเบียนทางการ อัปเดตทุก 30 นาที เข้าสู่ระบบด้วย Google เพื่อเขียนรีวิวได้แล้วต้นแบบ · อัปเดตทุก 30 นาที
PopNx MCPที่รวม MCP สำหรับคนใช้ AI · วิธีติดตั้งภาษาไทยทุกตัว

Scigantic

โดย Sciganticรุ่น 0.3.2i★ 1iบนเครื่องหรือคลาวด์
ชื่อใน registrycom.scigantic/mcp

วิธีติดตั้ง

ใช้ทำอะไรได้

ยังไม่มีคำอธิบายภาษาไทย ดูข้อเท็จจริงด้านล่าง หรือเปิดคำอธิบายต้นฉบับจากผู้ทำ

  • ต่อแบบ คลาวด์หรือติดตั้งในเครื่อง
  • บัญชีหรือคีย์ ไม่ต้องใส่คีย์
  • หมวด เอกสาร ตาราง และงานออฟฟิศ
คำอธิบายต้นฉบับจากผู้ทำ (อังกฤษ)
Search public scientific datasets and read schema cards that describe their files, columns and rows

ติดตั้ง

เลือกโปรแกรม AI ที่คุณใช้ แล้วคัดลอกค่าตั้งไปวาง

ผลตรวจผ่าน 5/5 · สิ่งที่คุณถามผ่านเซิร์ฟเวอร์ของผู้ทำ (api.scigantic.com) · ✓ ตรวจคำสั่งแล้ว 13 พ.ย. 2569

ขั้นแรก: คุณใช้ AI ตัวไหน

เลือกแอปที่คุณใช้ ขั้นตอนจะขึ้นด้านล่าง

ต่อกับ Claude ได้ · ประมาณ 2 นาที

ไม่ต้องใช้คีย์ ไม่ต้องลงโปรแกรม · ตั้งครั้งเดียวที่ claude.ai หรือแอปบนคอม แล้วใช้ในแชตได้ · บัญชีฟรีเพิ่มได้ 1 ตัว · แผน Team/Enterprise ให้เจ้าของ (Owner) เป็นคนเพิ่ม

  1. เปิดหน้า Connectors ของ Claude

    CustomizeConnectors

    CustomizeConnectors1Add2https://…3Add4
  2. กด “Add” → “Custom” → “Web” แล้วกรอก 2 ช่องนี้

    คัดลอกจากที่นี่ไปวางในช่องชื่อเดียวกันบนหน้าจอของ Claude แล้วกด Continue

    Name · ชื่อScigantic
    Remote MCP server URL · ที่อยู่https://api.scigantic.com/mcp

    กด Continue ผ่านหน้าตรวจการล็อกอินที่ Claude ตรวจเจอ · หัวข้อ Authentication เลือกตามที่ผู้ทำบอก (Sign in now, Sign in when needed หรือ No sign in) แล้วกด Add

  3. เปิดใช้ในแชต

    +ConnectorsScigantic

  4. ลองเลย

    ใช้ Scigantic บอกหน่อยว่าทำอะไรให้ฉันได้บ้าง แล้วลองทำให้ดูหนึ่งอย่าง

    ✓ ถ้า Claude บอกว่ากำลังใช้ Scigantic หรือมีชื่อเครื่องมือของ Scigantic ขึ้นในคำตอบ แปลว่าต่อสำเร็จ

ชื่อเมนูตรวจกับหน้าช่วยเหลือของ Anthropic เมื่อ 11 พ.ย. 2569 · หน้าจอของคุณอาจต่างเล็กน้อยตามรุ่นของแอป

ต่อกับ ChatGPT ได้ ขึ้นกับแผน

MCP แบบเต็ม: ChatGPT Business, Enterprise หรือ Edu บนเว็บ · Pro: ต่อได้ด้วยสิทธิ์อ่านและดึงข้อมูล เครื่องมือที่แก้ข้อมูลอาจใช้ไม่ได้ · Plus: เอกสารยังไม่ยืนยัน ถ้าเห็นเมนูเพิ่ม MCP แบบกำหนดเองในหน้าปลั๊กอิน ลองตามขั้นตอนได้ · ใช้บนเว็บเท่านั้น

  1. เปิดหน้าเพิ่ม MCP ของ ChatGPT บนเว็บ

    Plugins+Add custom MCP server

    ChatGPTPlugins1+2https://…3Create4
  2. กรอกชื่อและที่อยู่

    ใส่ชื่อ แล้ววางที่อยู่ใต้ Connection ติ๊กยอมรับคำเตือน แล้วกด Create as a plugin

    Name · ชื่อScigantic
    Connection · ที่อยู่https://api.scigantic.com/mcp
  3. เลือก Scigantic ในแชต

    เปิดแชตใหม่แล้วเลือก Scigantic จากรายการปลั๊กอินก่อนพิมพ์

  4. ลองเลย

    ใช้ Scigantic บอกหน่อยว่าทำอะไรให้ฉันได้บ้าง แล้วลองทำให้ดูหนึ่งอย่าง

    ✓ ถ้า ChatGPT บอกว่ากำลังใช้ Scigantic หรือมีชื่อเครื่องมือของ Scigantic ขึ้นในคำตอบ แปลว่าต่อสำเร็จ

ชื่อเมนูตรวจกับหน้าช่วยเหลือของ OpenAI เมื่อ 11 พ.ย. 2569 · หน้าจอของคุณอาจต่างเล็กน้อยตามรุ่นของแอป

ต่อกับ Claude Code ได้ · ประมาณ 2 นาที

ไม่ต้องใช้คีย์ ไม่ต้องลงโปรแกรม

  1. เปิด Terminal

    Mac: กด Command+Space พิมพ์ Terminal · Windows: เปิด PowerShell

  2. วางคำสั่งนี้แล้วกด Enter

    claude mcp add --transport http --scope user scigantic https://api.scigantic.com/mcp
  3. พิมพ์ /mcp ใน Claude Code

    ต้องเห็น Scigantic ในรายการและขึ้นว่าเชื่อมต่อแล้ว

  4. ลองเลย

    ใช้ Scigantic บอกหน่อยว่าทำอะไรให้ฉันได้บ้าง แล้วลองทำให้ดูหนึ่งอย่าง

    ✓ ถ้า Claude Code บอกว่ากำลังใช้ Scigantic หรือมีชื่อเครื่องมือของ Scigantic ขึ้นในคำตอบ แปลว่าต่อสำเร็จ

ชื่อเมนูตรวจกับหน้าช่วยเหลือของ Anthropic เมื่อ 11 พ.ย. 2569 · หน้าจอของคุณอาจต่างเล็กน้อยตามรุ่นของแอป

ต่อกับ Cursor ได้ · ประมาณ 2 นาที

ไม่ต้องใช้คีย์ ไม่ต้องลงโปรแกรม

  1. กดปุ่มนี้เพื่อเปิด Cursor

    เปิดใน Cursor

    Cursor จะถามยืนยันการติดตั้ง ให้กด Install

  2. เปิดแชตของ AI ใน Cursor โหมด Agent

  3. ลองเลย

    ใช้ Scigantic บอกหน่อยว่าทำอะไรให้ฉันได้บ้าง แล้วลองทำให้ดูหนึ่งอย่าง

    ✓ ถ้า Cursor บอกว่ากำลังใช้ Scigantic หรือมีชื่อเครื่องมือของ Scigantic ขึ้นในคำตอบ แปลว่าต่อสำเร็จ

ชื่อเมนูตรวจกับหน้าช่วยเหลือของ Cursor เมื่อ 11 พ.ย. 2569 · หน้าจอของคุณอาจต่างเล็กน้อยตามรุ่นของแอป

ต่อกับ VS Code ได้ · ประมาณ 2 นาที

ไม่ต้องใช้คีย์ ไม่ต้องลงโปรแกรม

  1. กดปุ่มนี้เพื่อเปิด VS Code

    เปิดใน VS Code

    VS Code จะถามยืนยันการติดตั้ง ให้กด Install

  2. เปิดแชตของ AI ใน VS Code โหมด Agent

  3. ลองเลย

    ใช้ Scigantic บอกหน่อยว่าทำอะไรให้ฉันได้บ้าง แล้วลองทำให้ดูหนึ่งอย่าง

    ✓ ถ้า VS Code บอกว่ากำลังใช้ Scigantic หรือมีชื่อเครื่องมือของ Scigantic ขึ้นในคำตอบ แปลว่าต่อสำเร็จ

ชื่อเมนูตรวจกับหน้าช่วยเหลือของ VS Code เมื่อ 11 พ.ย. 2569 · หน้าจอของคุณอาจต่างเล็กน้อยตามรุ่นของแอป

โปรแกรมอื่นที่ใช้ MCP ได้ เช่น Windsurf, Zed หรือ Gemini CLI มีวิธีเพิ่มต่างกัน ดูวิธีของแต่ละตัวในหน้ารวมโปรแกรม

ดูโปรแกรมที่ใช้ MCP ทั้งหมด →

ที่อยู่สำหรับโปรแกรมที่ต่อผ่านเว็บ

ที่อยู่https://api.scigantic.com/mcp

ค่าตั้งแบบไฟล์ JSON อยู่ในหัวข้อ “สำหรับคนเขียนโค้ด” ด้านล่าง

ติดตรงไหน? ถามคนที่ใช้ Scigantic อยู่💬 พูดคุย →
สำหรับคนเขียนโค้ด: คำสั่ง Terminal และค่าตั้ง JSON

ต่อผ่านเว็บ

Claude Code

claude mcp add --transport http --scope user scigantic https://api.scigantic.com/mcp

Cursor (~/.cursor/mcp.json)

{
  "mcpServers": {
    "scigantic": {
      "url": "https://api.scigantic.com/mcp"
    }
  }
}

VS Code (mcp.json)

{
  "servers": {
    "scigantic": {
      "type": "http",
      "url": "https://api.scigantic.com/mcp"
    }
  }
}

ติดตั้งในเครื่อง

Claude Code

claude mcp add --scope user scigantic -- uvx scigantic-mcp

Claude Desktop (claude_desktop_config.json)

{
  "mcpServers": {
    "scigantic": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "scigantic-mcp"
      ]
    }
  }
}

Cursor (~/.cursor/mcp.json)

{
  "mcpServers": {
    "scigantic": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "scigantic-mcp"
      ]
    }
  }
}

VS Code (mcp.json)

{
  "servers": {
    "scigantic": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "scigantic-mcp"
      ]
    }
  }
}

ค่าตั้งนี้สร้างจากข้อมูลใน registry ของผู้ทำ ถ้าไม่ตรงกับ README ให้เชื่อ README

สรุป

ดาวน์โหลดต่อสัปดาห์i
10/สัปดาห์
โดเมนที่ยืนยัน
✓ scigantic.com
การเชื่อมต่อ
บนเครื่องหรือคลาวด์
รุ่นล่าสุดi
0.3.2
ส่งเข้า registryi
10 พ.ย. 2569
แก้โค้ดล่าสุดi
10 พ.ย. 2569
ผู้ทำ
Scigantic
แพ็กเกจ
pypi: scigantic-mcp
เว็บผู้ทำ
scigantic.com
สถานะใน registry
ใช้งานอยู่

ใช้กับโปรแกรมไหนได้

ดูจากแบบการต่อของ server ตัวนี้ และเอกสารของผู้ทำโปรแกรมแต่ละตัว ตรวจเมื่อ 10 พ.ย. 2569

ต่อผ่านคลาวด์ได้ใน

ClaudeChatGPTGooseLM StudioMsty StudioCherry StudioCursorVS Code + GitHub CopilotVisual StudioWindsurf (Devin Desktop)ZedKiroClineContinueJetBrains AI AssistantClaude CodeCodex CLIGemini CLIOpenCodenodecodeWarpLibreChatOpen WebUIRaycast

ติดตั้งบนเครื่องได้ใน

ClaudeGooseLM StudioMsty StudioCherry StudioCursorVS Code + GitHub CopilotVisual StudioWindsurf (Devin Desktop)ZedKiroClineContinueJetBrains AI AssistantClaude CodeCodex CLIGemini CLIOpenCodenodecodeWarpLibreChatRaycast

ดูโปรแกรมทั้งหมดพร้อมข้อดีข้อเสีย →

คู่มือที่เกี่ยวข้อง

ทำอะไรได้บ้าง

ชื่อและคำอธิบายเครื่องมือตามที่ server ตอบมาเมื่อ 15 พ.ย. 2569 ผู้ทำเป็นคนเขียน ไม่ใช่เรา แสดงเป็นข้อความล้วน

  • search_archives

    Search the Scigantic catalog of public scientific data archives by natural-language query. Matching considers both the archive's description AND a sample of its actual object/file names, so a distinctive filename or path pattern can surface a match even when the prose description

  • get_archive

    Get full metadata for one archive by id, including its schema card (structure summary) when one exists.

  • get_schema_card

    Get the compact schema card for an archive: file format, columns, sample rows/headers, sidecar docs (READMEs/data dictionaries) and a copy-paste starter cell. This is the fastest way to understand a dataset's structure without mounting it.

  • get_data_access

    Get how to load a dataset in YOUR OWN environment: storage location plus copy-paste code snippets (from the dataset's schema card, or generated as a fallback). Use this after finding a dataset when you want to run analysis where you are, rather than in a hosted notebook.

  • list_archive_files

    List a sample of the files/objects in an archive's storage (the cached file tree).

  • get_sample_notebook

    Get the pre-executed starter notebook for an archive — a worked example of loading and exploring the data. Returns a cell-by-cell summary plus each cell's source (outputs are omitted to keep the payload small).

  • lookup_paper

    Look up a research paper on arXiv, by bare arXiv id (e.g. "1706.03762") or by keywords/title, and return its metadata plus any Scigantic archives linked to or suggested by it. Useful for going from a paper an agent is reading to the underlying datasets. Lookup is arXiv-backed: DO

  • list_compute_tiers

    List the compute tiers available for launching a Scigantic notebook (CPU/GPU options and hourly cost).

  • search

    Search the Scigantic catalog of public scientific datasets. Returns matching datasets as {results: [{id, title, url}]}; pass an id to fetch for the full description and schema card.

  • fetch

    Fetch one Scigantic dataset by id (from search): its description, storage location, source link, and schema card (format, columns, sample rows, caveats, and how to load it).

  • surechembl_compound

    Look up a compound in SureChEMBL, EMBL-EBI's database of chemistry extracted from patents, by any identifier, and report its structure, properties, cross-references (ChEMBL, PubChem, DrugBank, ChEBI, PDB) and how many patents mention it.

  • surechembl_patents_for_compound

    List the patents in which a compound was found (SureChEMBL). Accepts the same identifier forms as surechembl_compound. Aspirin is in ~700,000 documents, so read the total and narrow with surechembl_search_patents when it is large.

  • surechembl_patent

    A patent document from SureChEMBL: title, dates, applicants, inventors, assignees, family, priority claims, number of compounds named in the text, abstract, and (optionally) the claims and description text. SureChEMBL no longer returns CPC codes, citations or legal events with a

  • surechembl_patent_chemistry

    The compounds SureChEMBL's text-mining finds named in a patent's text: SCHEMBL id, name, SMILES, InChIKey, formula, weight. Structures that appear only in images or MOL attachments are not included.

  • surechembl_search_patents

    Full-text patent search over SureChEMBL with Solr syntax. Plain terms search all text; field prefixes narrow: ttl (title), ab (abstract), clm (claims), desc, asg (assignee), inv (inventor), pdyear, cpc, ic (IPCR), fam (family id). Quote publication numbers: pn:"US-10000000-B2". C

  • surechembl_structure_search

    Search SureChEMBL's 31 million patent compounds by chemical structure.

ผลตรวจเบื้องต้นi

เราตรวจจากข้อมูลที่ใครก็เปิดดูได้ ยังไม่ได้อ่านโค้ด ข้อที่ไม่เกี่ยวกับตัวนี้ไม่นับในตัวหาร · ตรวจเมื่อ 16 พ.ย. 2569

  • ✓ ผ่าน

    ตัวตนผู้ทำตรงกับ repo

    ชื่อใน registry ยืนยันโดเมน scigantic.com แล้ว (registry ตรวจความเป็นเจ้าของโดเมน)

  • ✓ ผ่าน

    ยังมีคนดูแล

    มีการแก้โค้ดล่าสุด 6 วันที่ผ่านมา

  • ✓ ผ่าน

    มีสัญญาอนุญาต (license)

    ใช้ MIT-0

  • ✓ ผ่าน

    endpoint ตอบ

    ตอบกลับใน 350 ms (HTTP 200)

  • – ไม่เกี่ยว

    ล็อกอินแบบ OAuth

    ไม่ต้องล็อกอิน

  • ✓ ผ่าน

    คำอธิบายเครื่องมือไม่มีคำสั่งแอบแฝง

    อ่านคำอธิบายเครื่องมือ 16 ตัวแล้ว ไม่พบคำสั่งแอบแฝงถึง AI

ช่องโหว่ที่เปิดเผยแล้ว (OSV.dev)

ไม่พบรายการใน OSV.dev สำหรับ scigantic-mcp@0.3.2

ตรวจเฉพาะตัวแพ็กเกจรุ่นนี้ ไม่ใช่ทุก dependency · ตรวจเมื่อ 15 พ.ย. 2569

เราตรวจอะไรบ้าง → · JSON

ผู้ทำ: ขอให้ตรวจใหม่ หรือแจ้งข้อมูลผิด

พูดคุย

ถาม แชร์เคล็ดลับ หรือแจ้งว่าใช้ไม่ได้ เรียงตามที่คนกดว่ามีประโยชน์

ยังไม่มีใครโพสต์ ถามหรือแชร์เป็นคนแรกได้เลย

ข้อความในส่วนนี้เขียนโดยผู้ใช้ ไม่ใช่ทีม PopNx

เข้าสู่ระบบเพื่อโพสต์

รีวิวจากผู้ใช้

ยังไม่มีรีวิว

เข้าสู่ระบบเพื่อเขียนรีวิว

เทียบกับตัวอื่นในหมวด เอกสาร ตาราง และงานออฟฟิศi

  • ดาวมากกว่า 81% ของอีก 3974 ตัวในหมวดนี้
  • ส่งรุ่นใหม่เข้า registry ล่าสุดกว่า 82% ของอีก 3974 ตัวในหมวดนี้
  • ผลตรวจเบื้องต้นดีกว่าหรือเท่ากับ 100% ของอีก 3974 ตัวในหมวดนี้

เทียบกับทุก server ที่ยังใช้งานในหมวดนี้ทั้งทะเบียน ดาวนับเฉพาะเมื่อผู้ลงทะเบียนเป็นเจ้าของ repo

คำถามที่พบบ่อย

Scigantic ปลอดภัยไหม?

จากการตรวจเบื้องต้นของเรา ผ่าน 5 จาก 5 ข้อที่ตรวจได้ เรายังไม่ได้อ่านโค้ด ก่อนใส่กุญแจหรือ token ให้ดูว่า server ขอสิทธิ์อะไร และเลือกกุญแจที่ทำได้เท่าที่จำเป็น

ต้องใช้กุญแจหรือรหัสอะไรบ้าง?

registry ไม่ได้ระบุว่าต้องใช้กุญแจ แต่บางตัวจะขอให้ล็อกอินตอนใช้ครั้งแรก

ตัวนี้รันบนเครื่องหรือบนคลาวด์?

ได้ทั้งสองแบบ จะลงในเครื่องหรือต่อผ่านคลาวด์ก็ได้

ยังมีคนดูแลอยู่ไหม?

repo บน GitHub มีการแก้โค้ดล่าสุด 6 วันที่ผ่านมา และส่งรุ่นล่าสุด (0.3.2) เข้า registry 6 วันที่ผ่านมา

ใช้กับโปรแกรมไหนได้บ้าง?

โปรแกรมที่รองรับ MCP เช่น Claude Desktop, Claude Code, Cursor และ VS Code ตัวนี้ต่อผ่าน URL จึงใช้กับโปรแกรมที่รับ remote MCP ได้ เช่น ChatGPT บนเว็บ (แบบเต็มในแผน Business ขึ้นไป · Pro แบบอ่านอย่างเดียว)

มีตัวไหนใช้แทนได้บ้าง?

ในหมวดเดียวกันมี Puter MCP, XcodeBuildMCP, Anki MCP Server, Sosumi, Zapier

ตัวอื่นที่ทำงานคล้ายกัน

หมวดเดียวกันจากผู้ทำคนอื่น ผ่านตัวตรวจคำสั่งแล้ว ตัวทางการขึ้นก่อน แล้วเรียงตามดาว

อ่านการ์ด:↓ ดาวน์โหลดต่อสัปดาห์i★ ดาว GitHubiสามเสา: รีวิว · ผลตรวจ · การใช้งานiอัปเดต = วันที่ส่งรุ่นล่าสุดเข้า registryi

Puter MCP

Puter MCP enables AI tools to interact with Puter: manage files, websites, workers, and more

โดย HeyPuterใช้กันมาก★ 44.2Kอัปเดต 5 เดือนที่ผ่านมา

รันบนคลาวด์✓ เจ้าของบริการ · puter.com

XcodeBuildMCP

ให้ AI จัดการโปรเจกต์ Xcode สั่ง build และใช้ iOS Simulator

โดย getsentryใช้กันมาก↓ 130.5K/สัปดาห์ ยอดของแพ็กเกจที่ใช้ร่วม★ 6.6Kอัปเดต 4 เดือนที่ผ่านมา

รันบนเครื่อง✓ เจ้าของบริการ · xcodebuildmcp.com

Anki MCP Server

MCP server for Anki flashcards: adaptive review, notes, media, and deck management via AnkiConnect.

โดย ankimcpกำลังโต↓ 1.1K/สัปดาห์★ 559อัปเดต 42 วันที่ผ่านมา

รันบนเครื่อง✓ เจ้าของบริการ · ankimcp.ai

Sosumi

Search and read Apple developer documentation, HIG, and WWDC transcripts as Markdown.

โดย NSHipsterกำลังโต★ 492อัปเดต 7 วันที่ผ่านมา

รันบนคลาวด์✓ เจ้าของบริการ · sosumi.ai

Zapier

ต่อ AI เข้ากับแอปหลายพันตัวผ่าน Zapier ตัวเดียว เช่น Gmail, Google Sheets, Slack และ LINE ที่มีใน Zapier เลือกได้ว่าให้ AI ทำงานอะไรบ้าง

โดย zapierกำลังโต★ 460อัปเดต 4 เดือนที่ผ่านมา

รันบนคลาวด์✓ เจ้าของบริการ · zapier.com
  • Puter MCP — ใช้บนคลาวด์ ไม่ต้องลงเครื่อง · ไม่ต้องใช้คีย์
  • XcodeBuildMCP — ต้องลงในเครื่อง · ไม่ต้องใช้คีย์
  • Anki MCP Server — ต้องลงในเครื่อง · ไม่ต้องใช้คีย์
  • Sosumi — ใช้บนคลาวด์ ไม่ต้องลงเครื่อง · ไม่ต้องใช้คีย์
  • Zapier — ใช้บนคลาวด์ ไม่ต้องลงเครื่อง · ไม่ต้องใช้คีย์ · อยู่ในคลังของ Claude

README จากผู้ทำ

เปิดอ่าน README

ส่วนนี้คัดจาก repo ของผู้ทำตามต้นฉบับ PopNx MCP ไม่ได้ตรวจหรือรับรองเนื้อหา ตัด HTML รูปภาพ และสคริปต์ออกแล้ว ลิงก์จะพาออกนอกเว็บ

scigantic-mcp

A Model Context Protocol server that exposes the Scigantic catalog of public scientific data archives to any MCP client.

It is built to drop into [Kiro for Life Sciences](https://github.com/aws-samples/sample-kiro-power-life-sciences) alongside its domain database servers. Where each Kiro server wraps one domain's APIs (genomics, proteomics, structural, …), Scigantic is the cross-domain launchpad: about 6,900 curated public archives spanning every domain, each with an LLM-ready schema card (file format, columns, sample rows/headers, inlined READMEs/data dictionaries, and a copy-paste starter cell) so an agent can understand a dataset's structure *before* downloading anything.

It is discovery-only and zero-config — every tool calls public, read-only Scigantic endpoints, so there is no API key to set up.

Since 0.3.0 it also carries six surechembl_* tools for patent chemistry, backed by SureChEMBL (EMBL-EBI, 31M compounds extracted from 45M patents) through the scigantic-surechembl library: look a compound up by any identifier, list the patents that mention it, read a patent, list the compounds named in it, search patents with Solr syntax, and run structure searches. Also public, read-only, no key.

SureChEMBL replaced its REST API in November 2026. Since 0.3.2 these tools run on scigantic-surechembl 0.4, the port to the new API. Three things the new API no longer offers show up in the output: a patent's CPC codes, citations and legal events are not returned; surechembl_patent_chemistry lists the compounds named in a patent's text, not those that appear only in images or attachments; and full-text search and patent families cover US, EP, WO, JP and CN publications only. A chemical name is now resolved through PubChem, since SureChEMBL has no name lookup any more.

Requires Python 3.10+ and MCP SDK 2.x.

Prefer the hosted server if your client speaks HTTP. Scigantic also runs a

remote MCP server at https://api.scigantic.com/mcp (no auth, nothing to

install, and it carries five extra tools: search, fetch,

get_sample_notebook, lookup_paper and list_compute_tiers):

add https://api.scigantic.com/mcp as a streamable HTTP server in your client

(Cursor, VS Code, Windsurf and others), or run

claude mcp add --transport http scigantic https://api.scigantic.com/mcp.

This package exists for clients that launch stdio servers, such as Kiro.

Tools

ToolWhat it does
search_archives(query, category?, limit?)Natural-language search across the whole catalog.
get_archive(id)Full metadata for one archive.
get_schema_card(id)The compact schema card — the fastest way to learn a dataset's structure.
get_data_access(id, language?)How to load the dataset in your own environment: storage location + copy-paste code snippets.
list_archive_files(id, limit?)A sample of the files/objects in the archive.
Patent chemistry (SureChEMBL)
ToolWhat it does
surechembl_compound(identifier)A compound by SureChEMBL id, ChEMBL id, pubchem:CID, drugbank:ID, InChIKey, SMILES or name: structure, properties, cross-references, patent count.
surechembl_patents_for_compound(identifier, limit?)The patents in which the compound was found, with the total.
surechembl_patent(doc_id, include_text?)A patent's bibliography, abstract, family, priority claims, count of compounds named in the text, and optionally its claims and description.
surechembl_patent_chemistry(doc_id, limit?)The compounds SureChEMBL's text-mining finds named in the patent.
surechembl_search_patents(query, limit?)Full-text patent search with Solr field syntax (ttl:, asg:, pdyear:, cpc:, ...) over US, EP, WO, JP and CN publications.
surechembl_structure_search(structure, mode?, limit?)Similarity, substructure, identical or connectivity search over 31M compounds.

Identifiers are preserved verbatim in the output (SureChEMBL's attribution terms ask that SCHEMBL ids and publication numbers be kept), and each result links to surechembl.org. SureChEMBL data is CC BY 4.0.

Prompts (guided workflows)

These surface as slash commands in Claude Code (/mcp__scigantic__ ):

PromptWhat it does
explore_dataset(topic)Search → inspect schema cards → recommend the best dataset → offer load code.
start_analysis(archive_id, goal?)Pull schema card + data-access snippet for an archive and outline an analysis plan.
patent_landscape(compound)Resolve a compound, count and list its patents, summarize assignees, years and CPC areas, read the key documents.

Install & register in Kiro

Add an entry under mcpServers in ~/.kiro/settings/mcp.json.

Option A — `uvx` (zero-install, recommended):

{

"mcpServers": { "scigantic": { "command": "uvx", "args": ["scigantic-mcp"] } } }

Option B — install into a venv (matches the Kiro servers' own mcp.json form):

python3 -m venv .venv && . .venv/bin/activate

pip install scigantic-mcp # or: pip install /path/to/scigantic-mcp

{

"mcpServers": { "scigantic": { "command": "/path/to/.venv/bin/scigantic-mcp", "env": { "SCIGANTIC_API_URL": "https://api.scigantic.com" } } } }

Works the same in Claude Desktop / Claude Code (claude mcp add scigantic -- uvx scigantic-mcp) or any MCP client that launches stdio servers.

Configuration

Env varDefaultPurpose
SCIGANTIC_API_URLhttps://api.scigantic.comAPI base (set to https://staging-api.scigantic.com for staging).
SCIGANTIC_API_ORIGINhttps://scigantic.comOrigin header → selects the public (default) catalog tenant.

Stability

This package is a thin client over the public Scigantic REST API. That API is not versioned and may change without notice — if a response shape moves, a pinned older release of this package can break. Pin a version you have tested, and open an issue if a tool starts returning something unexpected.

The MCP tool names and their arguments are treated as the stable surface, and will not change without a minor version bump.

Develop & test

The tool/client layer has no mcp dependency, so those tests run on any Python with httpx and need no network (mocked transport):

python3 tests/test_tools.py     # or: pytest

tests/test_server_import.py covers the wiring layer — that the server module imports, and that the registered tools and prompts are the expected set. It needs the mcp SDK installed (Python ≥ 3.10) and is skipped otherwise:

pip install -e '.[test]' && pytest

Keep it that way: the tool tests skip server.py on purpose, so an SDK breaking change is invisible to them. All 12 passed while the server could not import at all under SDK 2.x, which is what test_server_import.py now guards against.

Roadmap

  • Richer discovery for agents — structured tool outputs and MCP *resources* (attach an archive + its schema card as durable context).
  • Upstream inclusion as life-sciences-scigantic in aws-samples/sample-kiro-power-life-sciences.
  • Hosted compute is intentionally not exposed here. Scigantic's notebooks are interactive (a JupyterLab URL a human opens); handing an external agent that URL is a dead end. The agent-to-agent path is get_data_access — the caller runs the analysis in its own environment. Letting Scigantic *execute code for* an agent (run against an ephemeral kernel with the dataset mounted, return outputs) is a separate capability the platform would need to build first.

License

MIT-0.