프로토타입 · 미리 보기: 공식 레지스트리의 모든 서버를 담고 있으며 30분마다 동기화해요. 리뷰와 계정 기능은 다음 단계에서 열려요.
PopNx MCPAI를 쓰는 사람을 위한 MCP 서버 · 쉬운 말로 설명해요

Genefoundry

제작자: berntpopp버전 0.10.10i★ –i클라우드에서 실행
레지스트리 이름io.github.berntpopp/genefoundry

설치

개요

제작자가 쓴 설명(영어 원문)

MCP gateway federating 22 biomedical MCP servers behind one endpoint: gnomAD, ClinVar, HPO, VEP.

PopNx MCP의 세 기둥

이 세 가지는 절대 하나의 점수로 합치지 않아요. 의견, 측정, 인기는 서로 다른 것이니까요.

할 수 있는 일

이 서버는 아직 쉬운 말로 된 요약을 쓰지 못했어요. 아래는 레지스트리에서 읽어 온 사실이에요.

  • 연결 방식: 클라우드에서 실행
  • 전송 방식: Streamable HTTP
  • 카테고리: 클리닉 및 건강

설치

쓰고 있는 AI 앱을 고른 다음 설정을 복사하세요.

설치하기 전에

  • 기본 점검: 3개 중 3개 통과
  • 제작자의 서버에서 실행돼요. 내가 요청한 내용은 제작자의 서버를 거쳐요.
  • 레지스트리에 입력해야 할 키가 나와 있지 않아요.

필요한 것

어떤 앱을 쓰세요?

위에서 앱을 고르세요. 기억해 두었다가 다음부터는 버튼에 “…에 설치”라고 표시해요.

웹, 데스크톱, 모바일의 Claude에서 쓸 수 있어요:

  1. Settings → Connectors 열기
  2. Add custom connector 누르기
  3. 아래 주소를 붙여 넣고 Add 누르기
  4. 로그인하라고 하면 제작자의 서비스에 로그인하기
SettingsConnectors1+ Add2https://…3
https://genefoundry.org/mcp

터미널에서 이 명령어를 실행하세요

claude mcp add --transport http genefoundry https://genefoundry.org/mcp

Cursor에서 열기

또는 설정을 직접 복사하기

프로젝트의 .cursor/mcp.json 또는 ~/.cursor/mcp.json에 붙여 넣으세요

{
  "mcpServers": {
    "genefoundry": {
      "url": "https://genefoundry.org/mcp"
    }
  }
}

브라우저가 앱을 열지 물어본 다음, 앱이 설정을 보여 주고 확인을 요청해요. 키 값은 비워 두니 직접 입력하세요.

VS Code에서 열기

또는 설정을 직접 복사하기

프로젝트의 .vscode/mcp.json에 붙여 넣으세요

{
  "servers": {
    "genefoundry": {
      "type": "http",
      "url": "https://genefoundry.org/mcp"
    }
  }
}

브라우저가 앱을 열지 물어본 다음, 앱이 설정을 보여 주고 확인을 요청해요. 키 값은 비워 두니 직접 입력하세요.

ChatGPT는 인터넷에 있는 서버에만 연결할 수 있어요:

  1. 웹에서 ChatGPT 열기 → Settings → Connectors (Apps)
  2. Create 또는 Add 누르기(일부 요금제는 먼저 Advanced에서 Developer mode를 켜야 해요)
  3. 아래 주소를 붙여 넣고 이름을 정한 뒤 저장하기
  4. 로그인하라고 하면 제작자의 서비스에 로그인하기
SettingsConnectors1+ Create2https://…3
https://genefoundry.org/mcp

메뉴 이름은 요금제나 시기에 따라 조금 다를 수 있어요.

선택한 앱은 이 기기의 쿠키에만 저장돼요. 계정은 필요 없어요.

이 설정은 제작자의 레지스트리 정보로 만들었어요. README와 다르면 README를 따르세요.

할 수 있는 일

서버가 도구 목록을 보여 주기 전에 로그인을 요구해요.

기본 점검i

누구나 볼 수 있는 정보를 점검했고, 코드는 읽지 않았어요. 해당하지 않는 항목은 개수에서 뺐어요. · 2026년 11월 7일 점검

  • ✓ 통과

    제작자와 저장소 일치

    레지스트리 이름이 GitHub 계정 berntpopp 기준으로 확인되었고, 이 계정이 저장소를 소유하고 있어요

  • … 아직 점검 안 함

    계속 관리되고 있음

    아직 GitHub에서 이 저장소를 읽어 오지 않았어요

  • … 아직 점검 안 함

    라이선스 있음

    아직 GitHub에서 이 저장소를 읽어 오지 않았어요

  • ✓ 통과

    엔드포인트 응답

    830ms 만에 응답(HTTP 401)

  • ✓ 통과

    OAuth로 로그인

    OAuth 로그인을 지원한다고 밝혀서, AI 앱이 로그인 화면으로 안내해 줘요

  • … 아직 점검 안 함

    도구 설명에 숨겨진 지시 없음

    아직 점검하지 않았어요. 엔드포인트를 점검할 때 도구 목록을 읽어요

클리닉 및 건강 카테고리의 다른 서버와 비교i

  • 이 카테고리의 다른 서버 869개 중 0%보다 스타가 많아요
  • 이 카테고리의 다른 서버 869개 중 72%보다 최근에 레지스트리에 공개됐어요
  • 기본 점검 결과가 이 카테고리의 다른 서버 869개 중 100%와 같거나 더 좋아요

레지스트리에서 이 카테고리의 활성 서버 전체와 비교했어요. 스타는 게시자가 저장소를 소유한 경우에만 세요.

자주 묻는 질문

Genefoundry, 안전한가요?

해당하는 기본 점검 3개 중 3개를 통과했어요. 코드는 읽지 않았어요. 키나 토큰을 넣기 전에 서버가 어떤 권한을 요구하는지 확인하고, 꼭 필요한 권한만 있는 키를 쓰세요.

어떤 키나 코드가 필요한가요?

레지스트리에 필수 키가 나와 있지 않아요. 다만 처음 쓸 때 로그인을 요구하는 서버도 있어요.

내 컴퓨터에서 실행되나요, 클라우드에서 실행되나요?

제작자의 클라우드에서 실행돼요. 설치 없이 인터넷으로 연결하지만, 보내는 내용은 제작자의 서버를 거쳐요.

아직 관리되고 있나요?

GitHub 저장소는 마지막으로 – 변경됐고, 최신 버전(0.10.10)은 9일 전 레지스트리에 올라왔어요.

어떤 앱에서 쓸 수 있나요?

Claude Desktop, Claude Code, Cursor, VS Code처럼 MCP를 지원하는 앱에서 쓸 수 있어요. URL로 연결되기 때문에, 원격 MCP 서버를 지원하는 앱(예: 개발자 모드의 ChatGPT)에서도 쓸 수 있어요.

대신 쓸 수 있는 건 뭐가 있나요?

같은 카테고리에는: Mirobody, FHIR MCP Server, Google Health MCP

대안

같은 카테고리에서 다른 제작자가 만든 서버예요. 스타 순으로 정렬했어요.

카드 보는 법:★ GitHub 스타i세 기둥: 리뷰 · 점검 · 사용 정도i업데이트 = 최신 버전을 레지스트리에 공개한 날i

Mirobody

제작자: thetahealth

Lab results to LOINC codes and UCUM units, symptoms and diagnoses to ICPC-3. Offline, no API key.

내 컴퓨터에서 실행★ 1,408Apache-2.06일 전 업데이트
설치

FHIR MCP Server

제작자: wso2

MCP server providing seamless access to FHIR APIs for AI tools and healthcare applications

내 컴퓨터에서 실행★ 137Apache-2.09일 전 업데이트
설치

Google Health MCP

제작자: davidmosiah

Privacy-first unofficial Google Health API v4 MCP server for health, sleep, activity, HR agents

내 컴퓨터에서 실행★ 79MIT4개월 전 업데이트
설치

제작자의 README

README 열기

제작자의 저장소에서 쓰인 그대로 가져왔어요. PopNx MCP가 검토하거나 보증한 내용이 아니에요. HTML, 이미지, 스크립트는 제거했어요. 링크를 누르면 이 사이트를 벗어나요.

genefoundry-router

A thin FastMCP 3.x aggregator that federates the GeneFoundry *-link MCP fleet behind a single Streamable-HTTP endpoint. A host adds one server — genefoundry — and gets every biomedical backend with collision-free _ naming and search-based discovery.

[!IMPORTANT]

Research use only. Not clinical decision support. Do not use for diagnosis,

treatment, triage, or patient management.

Why

An MCP host that mounted all 21 backends directly would face a wall of several hundred tools — more than a model can reason over, and a guarantee of name collisions. The router collapses that into one endpoint and replaces the flat catalog with a search surface, so a model finds the right tool by intent instead of by scrolling.

It is a *client* to each backend and a *server* to hosts: it namespaces and shapes the surface, but never rewrites a backend's data. The caller's token is never forwarded upstream.

Quick start

The fleet is hosted — no install required:

claude mcp add --transport http genefoundry https://genefoundry.org/mcp

Health check: genefoundry.org/health.

To run your own against the live fleet (Python 3.14+, uv):

uv sync --group dev

cp .env.example .env # set GF_*_URL backend URLs and GF_AUTH_MODE uv run genefoundry-router run --host 127.0.0.1 --port 8000 curl -s localhost:8000/health | python -m json.tool

An offline fake fleet (make dev-fleet + make run-dev, or one-shot make test-e2e) runs the real router against impersonated backends over real Streamable-HTTP — no Docker, no network.

Tools

The router does not surface the federated catalog flat. A model sees three things:

ToolPurpose
search_toolsRelevance search over the entire federated catalog
call_toolInvoke a hit by its _ name
*pinned entry points*Each backend's front-door tool, always visible — declared per-backend as entrypoints: in servers.yaml
search_tools(query="splicing prediction")   # → spliceai_predict_splicing (+ schema)

call_tool(name="spliceai_predict_splicing", arguments={...})

Pinning makes each domain's canonical tool reachable deterministically rather than by relevance luck. See How discovery works — including the two traps that bite MCP clients.

Federated backends

22 backends, 285 tools, each surfaced namespaced — e.g. gnomad_search_genes.

NamespaceDomainData sourceToolsRepo
pubtatorLiterature & entity annotationPubTator335pubtator-link
gnomadVariant / gene / population frequencygnomAD22gnomad-link
orphanetRare disease ontology & associationsOrphadata19orphanet-link
clingenGene–disease curationClinGen17clingen-link
hpoPhenotype ontology & associationsHuman Phenotype Ontology17hpo-link
mavedbVariant-effect assay scoresMaveDB15mavedb-link
uniprotProtein functionUniProt15uniprot-link
clinpgxPharmacogenomics / gene-drug guidelinesClinPGx13clinpgx-link
genereviewsGene–disease literatureGeneReviews13genereviews-link
mgiMouse phenotype & modelsMGI13mgi-link
mondoDisease ontology / cross-referencesMondo13mondo-link
genccGene–disease curationGenCC12gencc-link
metadomeProtein tolerance landscapesMetaDome11metadome-link
stringdbProtein–protein interaction networksSTRING10stringdb-link
gtexTissue expressionGTEx Portal9gtex-link
hgncGene nomenclatureHGNC9hgnc-link
panelappDiagnostic gene panels & curationPanelApp9panelapp-link
autopvs1Variant ACMG PVS1AutoPVS17autopvs1-link
spliceaiSplicing predictionSpliceAI Lookup7spliceailookup-link
vepVariant annotation / consequenceEnsembl VEP7vep-link
clinvarVariant clinical significanceClinVar6clinvar-link
litvarVariant literatureLitVar26litvar-link

Data & provenance

The router serves no data of its own; each backend owns its sources, licences and citation guidance, and the router mirrors their disclaimers.

What it does own is integrity of the tool surface. A backend can serve a clean tool at review time and later change its definition — the channel for a rug pull. The router fingerprints every normalized tool definition and diffs the live fleet against a reviewed, packaged baseline (genefoundry_router/data/fleet-baseline.json), enforced at startup and on a schedule. See Deployment → drift detection.

Documentation

  • Configuration & authentication — every GF_* variable, the OAuth/JWT resource-server modes, and the startup guards.
  • Deployment — container release, digest pinning, rollback, and drift detection.
  • How discovery works — the search surface, entry-point pinning, and how discoverability is measured.
  • Design spec — the architecture and why it is shaped this way.
  • Fleet standards — Tool-Naming · Response-Envelope · MCP-Behaviour · Tool-Surface-Budget · Tool-Schema-Documentation · Container-Hardening · Versioning · README.

Contributing

See AGENTS.md for engineering conventions. make ci-local is the definition-of-done gate: format, lint, line budget, README standard, mypy, and tests.

License

MIT © Bernt Popp. Each federated backend carries the licence and citation terms of its upstream data source; see that backend's repository.

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