Mirobody
Lab results to LOINC codes and UCUM units, symptoms and diagnoses to ICPC-3. Offline, no API key.
제작자가 쓴 설명(영어 원문)
MCP gateway federating 22 biomedical MCP servers behind one endpoint: gnomAD, ClinVar, HPO, VEP.
이 세 가지는 절대 하나의 점수로 합치지 않아요. 의견, 측정, 인기는 서로 다른 것이니까요.
이 서버는 아직 쉬운 말로 된 요약을 쓰지 못했어요. 아래는 레지스트리에서 읽어 온 사실이에요.
쓰고 있는 AI 앱을 고른 다음 설정을 복사하세요.
필요한 것
어떤 앱을 쓰세요?
위에서 앱을 고르세요. 기억해 두었다가 다음부터는 버튼에 “…에 설치”라고 표시해요.
웹, 데스크톱, 모바일의 Claude에서 쓸 수 있어요:
https://genefoundry.org/mcp터미널에서 이 명령어를 실행하세요
claude mcp add --transport http genefoundry https://genefoundry.org/mcp프로젝트의 .cursor/mcp.json 또는 ~/.cursor/mcp.json에 붙여 넣으세요
{
"mcpServers": {
"genefoundry": {
"url": "https://genefoundry.org/mcp"
}
}
}브라우저가 앱을 열지 물어본 다음, 앱이 설정을 보여 주고 확인을 요청해요. 키 값은 비워 두니 직접 입력하세요.
프로젝트의 .vscode/mcp.json에 붙여 넣으세요
{
"servers": {
"genefoundry": {
"type": "http",
"url": "https://genefoundry.org/mcp"
}
}
}브라우저가 앱을 열지 물어본 다음, 앱이 설정을 보여 주고 확인을 요청해요. 키 값은 비워 두니 직접 입력하세요.
ChatGPT는 인터넷에 있는 서버에만 연결할 수 있어요:
https://genefoundry.org/mcp메뉴 이름은 요금제나 시기에 따라 조금 다를 수 있어요.
선택한 앱은 이 기기의 쿠키에만 저장돼요. 계정은 필요 없어요.
이 설정은 제작자의 레지스트리 정보로 만들었어요. README와 다르면 README를 따르세요.
서버가 도구 목록을 보여 주기 전에 로그인을 요구해요.
누구나 볼 수 있는 정보를 점검했고, 코드는 읽지 않았어요. 해당하지 않는 항목은 개수에서 뺐어요. · 2026년 11월 7일 점검
레지스트리 이름이 GitHub 계정 berntpopp 기준으로 확인되었고, 이 계정이 저장소를 소유하고 있어요
아직 GitHub에서 이 저장소를 읽어 오지 않았어요
아직 GitHub에서 이 저장소를 읽어 오지 않았어요
830ms 만에 응답(HTTP 401)
OAuth 로그인을 지원한다고 밝혀서, AI 앱이 로그인 화면으로 안내해 줘요
아직 점검하지 않았어요. 엔드포인트를 점검할 때 도구 목록을 읽어요
레지스트리에서 이 카테고리의 활성 서버 전체와 비교했어요. 스타는 게시자가 저장소를 소유한 경우에만 세요.
해당하는 기본 점검 3개 중 3개를 통과했어요. 코드는 읽지 않았어요. 키나 토큰을 넣기 전에 서버가 어떤 권한을 요구하는지 확인하고, 꼭 필요한 권한만 있는 키를 쓰세요.
레지스트리에 필수 키가 나와 있지 않아요. 다만 처음 쓸 때 로그인을 요구하는 서버도 있어요.
제작자의 클라우드에서 실행돼요. 설치 없이 인터넷으로 연결하지만, 보내는 내용은 제작자의 서버를 거쳐요.
GitHub 저장소는 마지막으로 – 변경됐고, 최신 버전(0.10.10)은 9일 전 레지스트리에 올라왔어요.
Claude Desktop, Claude Code, Cursor, VS Code처럼 MCP를 지원하는 앱에서 쓸 수 있어요. URL로 연결되기 때문에, 원격 MCP 서버를 지원하는 앱(예: 개발자 모드의 ChatGPT)에서도 쓸 수 있어요.
같은 카테고리에는: Mirobody, FHIR MCP Server, Google Health MCP
같은 카테고리에서 다른 제작자가 만든 서버예요. 스타 순으로 정렬했어요.
카드 보는 법:★ GitHub 스타i세 기둥: 리뷰 · 점검 · 사용 정도i업데이트 = 최신 버전을 레지스트리에 공개한 날i
Lab results to LOINC codes and UCUM units, symptoms and diagnoses to ICPC-3. Offline, no API key.
MCP server providing seamless access to FHIR APIs for AI tools and healthcare applications
Privacy-first unofficial Google Health API v4 MCP server for health, sleep, activity, HR agents
제작자의 저장소에서 쓰인 그대로 가져왔어요. PopNx MCP가 검토하거나 보증한 내용이 아니에요. HTML, 이미지, 스크립트는 제거했어요. 링크를 누르면 이 사이트를 벗어나요.
A thin FastMCP 3.x aggregator that federates the GeneFoundry *-link MCP fleet behind a single Streamable-HTTP endpoint. A host adds one server — genefoundry — and gets every biomedical backend with collision-free _ naming and search-based discovery.
[!IMPORTANT]
Research use only. Not clinical decision support. Do not use for diagnosis,
treatment, triage, or patient management.
An MCP host that mounted all 21 backends directly would face a wall of several hundred tools — more than a model can reason over, and a guarantee of name collisions. The router collapses that into one endpoint and replaces the flat catalog with a search surface, so a model finds the right tool by intent instead of by scrolling.
It is a *client* to each backend and a *server* to hosts: it namespaces and shapes the surface, but never rewrites a backend's data. The caller's token is never forwarded upstream.
The fleet is hosted — no install required:
claude mcp add --transport http genefoundry https://genefoundry.org/mcp
Health check: genefoundry.org/health.
To run your own against the live fleet (Python 3.14+, uv):
uv sync --group dev
cp .env.example .env # set GF_*_URL backend URLs and GF_AUTH_MODE uv run genefoundry-router run --host 127.0.0.1 --port 8000 curl -s localhost:8000/health | python -m json.tool
An offline fake fleet (make dev-fleet + make run-dev, or one-shot make test-e2e) runs the real router against impersonated backends over real Streamable-HTTP — no Docker, no network.
The router does not surface the federated catalog flat. A model sees three things:
| Tool | Purpose |
|---|---|
search_tools | Relevance search over the entire federated catalog |
call_tool | Invoke a hit by its _ name |
| *pinned entry points* | Each backend's front-door tool, always visible — declared per-backend as entrypoints: in servers.yaml |
search_tools(query="splicing prediction") # → spliceai_predict_splicing (+ schema)
call_tool(name="spliceai_predict_splicing", arguments={...})
Pinning makes each domain's canonical tool reachable deterministically rather than by relevance luck. See How discovery works — including the two traps that bite MCP clients.
22 backends, 285 tools, each surfaced namespaced — e.g. gnomad_search_genes.
| Namespace | Domain | Data source | Tools | Repo |
|---|---|---|---|---|
pubtator | Literature & entity annotation | PubTator3 | 35 | pubtator-link |
gnomad | Variant / gene / population frequency | gnomAD | 22 | gnomad-link |
orphanet | Rare disease ontology & associations | Orphadata | 19 | orphanet-link |
clingen | Gene–disease curation | ClinGen | 17 | clingen-link |
hpo | Phenotype ontology & associations | Human Phenotype Ontology | 17 | hpo-link |
mavedb | Variant-effect assay scores | MaveDB | 15 | mavedb-link |
uniprot | Protein function | UniProt | 15 | uniprot-link |
clinpgx | Pharmacogenomics / gene-drug guidelines | ClinPGx | 13 | clinpgx-link |
genereviews | Gene–disease literature | GeneReviews | 13 | genereviews-link |
mgi | Mouse phenotype & models | MGI | 13 | mgi-link |
mondo | Disease ontology / cross-references | Mondo | 13 | mondo-link |
gencc | Gene–disease curation | GenCC | 12 | gencc-link |
metadome | Protein tolerance landscapes | MetaDome | 11 | metadome-link |
stringdb | Protein–protein interaction networks | STRING | 10 | stringdb-link |
gtex | Tissue expression | GTEx Portal | 9 | gtex-link |
hgnc | Gene nomenclature | HGNC | 9 | hgnc-link |
panelapp | Diagnostic gene panels & curation | PanelApp | 9 | panelapp-link |
autopvs1 | Variant ACMG PVS1 | AutoPVS1 | 7 | autopvs1-link |
spliceai | Splicing prediction | SpliceAI Lookup | 7 | spliceailookup-link |
vep | Variant annotation / consequence | Ensembl VEP | 7 | vep-link |
clinvar | Variant clinical significance | ClinVar | 6 | clinvar-link |
litvar | Variant literature | LitVar2 | 6 | litvar-link |
The router serves no data of its own; each backend owns its sources, licences and citation guidance, and the router mirrors their disclaimers.
What it does own is integrity of the tool surface. A backend can serve a clean tool at review time and later change its definition — the channel for a rug pull. The router fingerprints every normalized tool definition and diffs the live fleet against a reviewed, packaged baseline (genefoundry_router/data/fleet-baseline.json), enforced at startup and on a schedule. See Deployment → drift detection.
GF_* variable, the OAuth/JWT resource-server modes, and the startup guards.See AGENTS.md for engineering conventions. make ci-local is the definition-of-done gate: format, lint, line budget, README standard, mypy, and tests.
MIT © Bernt Popp. Each federated backend carries the licence and citation terms of its upstream data source; see that backend's repository.