biomedmcp

할 수 있는 일

이 서버는 아직 쉬운 말로 된 요약을 쓰지 못했어요. 아래는 레지스트리에서 읽어 온 사실이에요.

• 연결 방식: 컴퓨터 또는 클라우드
• 전송 방식: stdio, Streamable HTTP
• 카테고리: 클리닉 및 건강

설치

쓰고 있는 AI 앱을 고른 다음 설정을 복사하세요.

필요한 것

• 클라우드에서 실행설치할 것 없음. 인터넷으로 연결돼요
• PyPIPython의 uv 설치(uvx 명령어용)

어떤 앱을 쓰세요?

https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "your-value"
      }
    }
  }
}

claude mcp add --transport http biomedmcp https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

claude mcp add biomedmcp --env UBI_PROFILE=your-value -- uvx biomedmcp mcp --transport stdio

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "url": "https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp"
    }
  }
}

{
  "mcpServers": {
    "biomedmcp": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "your-value"
      }
    }
  }
}

{
  "servers": {
    "biomedmcp": {
      "type": "http",
      "url": "https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp"
    }
  }
}

{
  "servers": {
    "biomedmcp": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomedmcp",
        "mcp",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "UBI_PROFILE": "your-value"
      }
    }
  }
}

https://biomedmcp.unibiointelligence.com/mcp

선택한 앱은 이 기기의 쿠키에만 저장돼요. 계정은 필요 없어요.

직접 입력할 값

• UBI_PROFILE env

이 설정은 제작자의 레지스트리 정보로 만들었어요. README와 다르면 README를 따르세요.

할 수 있는 일

도구 이름과 설명은 서버가 2026년 11월 9일에 알려 준 그대로예요. 우리가 아니라 제작자가 쓴 글이고, 일반 텍스트로만 보여 드려요.

• search_records

  Search genes, proteins, drugs, diseases, phenotypes, pathways, variants, pharmacogenomics, GWAS, diagnostics, adverse events, studies, patents or authors by text; returns IDs for get_record (variants: get_variant_evidence). Papers: search_literature. Trials: search_trials. Patent

• get_record

  Fetch one record by ID with optional evidence sections, e.g. gene expression/eqtl/diseases/druggability, drug label/safety, article fulltext, trial eligibility, protein domains/structures. Variants: get_variant_evidence. List an entity's sections with get_capabilities(entity=...)

• search_literature

  Search papers across PubMed, Europe PMC, PubTator and LitSense with date, author, journal, article-type and open-access filters. Deduplicates across sources and reports each source's outcome. Read abstracts or full text with get_record(entity=article). e.g. {"query":"PCSK9 LDL ch

• search_trials

  Search clinical trials (ClinicalTrials.gov, NCI) by condition, intervention, phase and recruitment status. Read arms, eligibility or outcomes with get_record(entity=trial). Does not assess an individual's eligibility. e.g. {"query":"familial hypercholesterolemia","filters":{"stat

• get_variant_evidence

  Get evidence for one variant (rsID, gene + protein change, HGVS or chr:pos:ref:alt). Defaults: ClinVar, gnomAD population, CIViC; add predictions (AlphaMissense), eve, cosmic, oncokb, hotspots, gwas or cbioportal. Ambiguous assembly or transcript is reported, not guessed; predict

• analyze_study

  Analyze an installed public cancer genomics study: gene_profile, mutation_cohort, survival, compare, co_occurrence, filter_cohort, top_mutated. List installed studies with get_capabilities(source=study); ubi_synthetic is invented demo data. Report sample denominators and exclusio

• resolve_entity

  Map a name, alias or ambiguous identifier to exact species-qualified IDs before joining evidence. Returns candidates when ambiguous; a provider match score alone is not identity. Skip when you already hold an exact ID. e.g. {"entity":"gene","query":"LDL receptor","species":9606}

• find_related

  List records linked to one record. gene/drug/disease: articles, trials. variant: articles, structure. article: citations, references, recommendations, authors, entities. author: articles. Record attributes are get_record sections, not relations. e.g. {"entity":"article","id":"PMI

• build_dossier

  Build a multi-section dossier in one call: verified identity, default record sections and top related papers, with citations and per-source outcomes. Workflows: target_dossier, model_input_bundle (gene), drug_review, disease_landscape, pathway_review, variant_dossier, negative_ev

• query_source

  Run a source-specific operation that other tools do not cover, e.g. ChEMBL bioactivities, Ensembl coordinates, PDB structure quality, OmniPath interactions, NCBI Datasets genomes, ncbi-records for GenBank/GEO/SRA. Read get_capabilities(source=...) for operations and params first.

• run_batch

  Run up to ten independent read calls in parallel with one quota reservation; each result keeps its own outcome. build_dossier and utilities are not batchable. e.g. {"calls":[{"operation":"get_record","arguments":{"entity":"gene","id":"PCSK9","species":9606}}]}

• get_capabilities

  List enabled sources, entity sections, dossier workflows and source operations with exact parameter schemas. Narrow with source or entity; diagnose=true probes source health. Examples: biomedmcp://guide. e.g. {}

• get_quota

  Show remaining research allowance and reset times; signed-in accounts get higher limits. e.g. {}

기본 점검i

누구나 볼 수 있는 정보를 점검했고, 코드는 읽지 않았어요. 해당하지 않는 항목은 개수에서 뺐어요. · 2026년 11월 9일 점검

• ✓ 통과

  제작자와 저장소 일치

  레지스트리 이름이 GitHub 계정 unibio-intelligence 기준으로 확인되었고, 이 계정이 저장소를 소유하고 있어요

• … 아직 점검 안 함

  계속 관리되고 있음

  아직 GitHub에서 이 저장소를 읽어 오지 않았어요

• … 아직 점검 안 함

  라이선스 있음

  아직 GitHub에서 이 저장소를 읽어 오지 않았어요

• ✓ 통과

  엔드포인트 응답

  87ms 만에 응답(HTTP 200)

• – 해당 없음

  OAuth로 로그인

  로그인 필요 없음

• ✓ 통과

  도구 설명에 숨겨진 지시 없음

  도구 설명 13개를 읽었고, AI에게 보내는 숨겨진 지시는 없었어요

클리닉 및 건강 카테고리의 다른 서버와 비교i

• 이 카테고리의 다른 서버 1034개 중 0%보다 스타가 많아요
• 이 카테고리의 다른 서버 1034개 중 99%보다 최근에 레지스트리에 공개됐어요
• 기본 점검 결과가 이 카테고리의 다른 서버 1034개 중 100%와 같거나 더 좋아요

레지스트리에서 이 카테고리의 활성 서버 전체와 비교했어요. 스타는 게시자가 저장소를 소유한 경우에만 세요.

대안

같은 카테고리에서 다른 제작자가 만든 서버예요. 스타 순으로 정렬했어요.

카드 보는 법:↓ 주간 다운로드i★ GitHub 스타i세 기둥: 리뷰 · 점검 · 사용 정도i업데이트 = 최신 버전을 레지스트리에 공개한 날i

제작자의 README

python -m pip install biomedmcp==0.2.5

UBI_PROFILE=local biomedmcp get_record '{"entity":"gene","id":"LDLR","species":9606,"sections":["expression"]}'

<!-- public-call-examples:end -->

UBI_PROFILE=local biomedmcp-server --transport http --host 127.0.0.1 --port 8000